数据集概述
本数据集围绕雄性歌带鹀鸣唱信号与主要组织相容性复合体(MHC)多样性的关联展开,包含鸣唱曲目内容、复杂度与MHC基因多样性的实验数据,以及分析代码和补充文档,为研究鸣唱信号对MHC多样性的指示作用提供支持。
文件详解
该数据集包含13个文件,涵盖数据、代码与文档类型,具体说明如下:
- 核心数据文件(CSV格式):
- Dryad12_MHC_SAs_and_Song_Data.csv:包含个体ID、MHC多样性(SA)、鸣唱复杂度(song)等字段
- Dryad4_MHC_composition_table.csv:MHC基因组成数据表
- Dryad5_MHC_composition_table_with_IDs.csv:带个体ID的MHC基因组成数据表
- Dryad8_song_unifrac_matrix.csv:鸣唱Unifrac矩阵数据
- Dryad9_MHC_UniFrac_Matrix.csv:MHC Unifrac矩阵数据
- Dryad11_syllable_Jaccard_Dissimilarity.csv:音节Jaccard相异度数据
- 分析代码与文档(DOCX格式):
- Dryad3_Rcode.docx:R语言分析代码文档
- Dryad1_PCRandSeqconditions.docx:PCR及测序条件说明文档
- Dryad13_Suppl_analysis.docx:补充分析文档
- 其他格式文件:
- Dryad10_syllable_jaccard_SIMILARITY_index.xlsx:音节Jaccard相似度指数表(Excel格式)
- Dryad2_FigS1_MHCalleletree.pdf:MHC等位基因树图(PDF格式)
- Dryad6_MHC_AA_sequences.fas:MHC氨基酸序列文件(FAS格式)
- Dryad7_MHC_AA_tree.nwk:MHC氨基酸序列树文件(NWK格式)
适用场景
- 行为生态学研究:分析鸣唱信号对基因多样性的指示作用
- 进化生物学研究:探究MHC多样性与鸣唱复杂度的进化关联
- 动物行为学研究:验证鸣唱作为择偶信号的遗传适应性价值
- 分子生态学研究:解析MHC基因多样性与疾病抗性的关系
- 生物信息学分析:利用鸣唱与基因数据构建关联模型