找到39个数据集

分类: 公开数据 标签: FASTQ

过滤结果

  • Anellovirus_33种圆环病毒FASTQ数据集2023

    2026年1月28日 30 20 16

    数据集概述 本数据集包含三十三种圆环病毒的FASTQ数据，由十六组计算机模拟生成，核苷酸序列与2023年第一版灵长类圆环病毒数据库序列的一致性从百分之百到百分之八十五不等。数据通过art_illumina软件生成，可用于病毒基因组相关分析。 文件详解 文件名称：dataset-33Anelloviruses-2023.zip 文件格式：ZIP...
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  • 示例数据集_哥伦巴1000基因组计划人类染色体19单倍型测试数据集

    2026年1月27日 30 179 91

    数据集概述 本数据集为测试用基因组数据，包含来自1000 Genomes Project的人类个体HG00096和HG00097的19号染色体两个单倍型参考序列文件，以及从SRR17981962测序数据中采样得到的10万条双端测序读数文件，所有数据打包为一个压缩文件。 文件详解 压缩包文件 文件名称：test_data.zip 文件格式：ZIP...
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  • GTN_Training_Galaxy平台ENA数据上传教程训练数据

    2026年1月23日 30 57 45

    数据集概述 本数据集是Zenodo.3732359数据的子集，用于Galaxy培训网络（GTN）的“Upload data to ENA”教程。已按指定流程移除人类序列痕迹，包含基于Illumina PE数据生成的SARS-CoV-2共识序列及相关原始数据，共8个文件。 文件详解 数据文件...
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  • PacBio_Illumina_微卫星发现与引物开发测序技术影响数据

    2026年1月23日 30 178 1

    数据集概述 本数据集围绕测序读长、质量和数量对微卫星发现及引物开发的影响展开，对比PacBio与Illumina等测序平台的性能，包含3个植物物种的模拟与实验数据，涉及测序质量控制、微卫星标记验证等流程，共4个文件。 文件详解 ErrorTrimSim.fastq 文件格式：FASTQ...
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  • Salinity_Based_灌溉水盐度对椰枣树根际细菌群落影响研究数据

    2026年1月22日 30 198 143

    数据集概述 本数据集聚焦灌溉水盐度对椰枣树根际细菌群落的影响，通过16S rRNA基因 metabarcoding技术分析非盐水与盐水灌溉条件下的细菌群落差异，包含OTU分布、多样性指数及环境因子相关性数据，共85个文件。 文件详解 测序数据文件...
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  • CIMMYT_Based_面包小麦育种系基因型测序数据_2013_2020

    2026年1月21日 30 96 20

    数据集概述 本数据集包含国际玉米小麦改良中心（CIMMYT）2013-2020年培育的74,403份面包小麦育种系的基因型数据。通过基因型测序（GBS）构建433个GBS文库，经Illumina平台测序生成440个FASTQ文件，原始数据存储于NCBI BioProject PRJNA498085，数据集含3个文件，支持小麦育种相关分析。 文件详解...
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  • DNA_Diet_Estimates_Based_饮食分析准确性提升研究数据

    2026年1月20日 30 13 5

    数据集概述 本数据集围绕DNA饮食分析准确性提升研究，包含圈养港海豹粪便样本及对应猎物组织混合物的测序数据，以及用于校正技术偏差和消化偏差的实验数据，支持评估饮食DNA序列比例与实际饮食比例的对应关系及校正方法效果。 文件详解 README_for_Figure_Data.txt 文件格式：TXT 字段映射介绍：包含图表数据字段说明，如Fig...
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  • TCR_BCR_Based_弹性蛋白酶诱导小鼠腹主动脉瘤T_B细胞克隆性测序数据集

    2026年1月18日 30 192 134

    数据集概述 本数据集为弹性蛋白酶诱导小鼠腹主动脉瘤模型中T、B细胞克隆性研究的TCR/BCR测序数据，包含造模后3、7、14、28天及假手术、未手术对照组小鼠肾下腹主动脉淋巴细胞的单细胞测序结果，提供CellRanger输出文件、哈希抗体与TCR/BCR及样本对应信息，共71个文件，用于分析T/B细胞克隆性特征。 文件详解 样本与哈希信息文件...
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  • Triturus_Newt_Genetic_Data_塞尔维亚东部蝾螈遗传分析数据集

    2026年1月18日 30 45 20

    数据集概述 本数据集包含对塞尔维亚东部Vrtovać地区9个Triturus蝾螈样本（含T. arntzeni模式标本及副模式标本）的核基因数据，通过二代测序获取52个标记。数据与当地4种冠螈参考序列对比，分析样本遗传成分，为物种分类提供依据。 文件详解 原始数据文件 文件名称：1 - FASTQ_IonTorrent.zip...
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  • Tamura_Dataset_Based_大豆肽对幼鼠社会隔离影响_16S测序数据集

    2026年1月18日 30 196 138

    数据集概述 本数据集记录慢性摄入大豆肽补充剂对幼鼠社会隔离的影响，包含16S核糖体核糖核酸基因微生物群落分析的原始测序数据，按对照饮食群养、大豆肽饮食群养、对照饮食社会隔离、大豆肽饮食社会隔离四组分类，共26个文件。 文件详解 原始测序文件（Fastq.gz）...
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  • Dryad_Plant_derived_eDNA_节肢动物监测与植物_互作对比研究数据_v1

    2026年1月17日 30 9 7

    数据集概述 本数据集来自Dryad数据平台，围绕植物源环境DNA（eDNA）与传统节肢动物监测方法的对比研究展开。通过四项实验，测试了植物表面冲洗液和均质植物材料的eDNA宏条形码技术，与传统监测方法在节肢动物群落多样性及植物-节肢动物互作检测上的性能差异。数据集包含385个文件，支持生物多样性监测技术的有效性验证与互作关系分析。 文件详解...
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  • Joshua_Tree_Based_约书亚树国家公园岩内微生物群落扩增子测序数据2016

    2026年1月13日 30 23 15

    数据集概述 本数据集包含2016年5月在美国约书亚树国家公园采集的10份岩内群落样本的ITS真菌和16S细菌扩增子测序数据，采用地球微生物组计划协议，通过Illumina Miseq平台测序，数据存储为2个压缩包。 文件详解 ITS_fungi.zip 文件格式：ZIP 内容：包含ITS真菌扩增子测序的R1.fastq和R2.fastq原始序列文件...
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  • DNA_metabarcoding_Based_Mayotte岛河流硅藻生态状态评估数据

    2026年1月13日 30 75 70

    数据集概述 本数据集为期刊论文的补充数据，包含Mayotte岛河流底栖硅藻的DNA宏条形码监测数据，涉及80个样本的测序原始数据、样本信息及生物信息学处理后的OTU列表，用于评估热带河流生态状态，支持DNA宏条形码与显微镜检测方法的对比研究。 文件详解 80 PGM sequencing libraries (raw data, fastq...
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  • Ancient_Mitochondrial_DNA_Based_巨型短面熊趋同演化研究数据

    2026年1月13日 30 38 14

    数据集概述 本数据集包含古代巨型短面熊（Tremarctinae亚科）的线粒体DNA研究数据，涉及南北美洲巨型短面熊（Arctodus simus与Arctotherium angustidens）及现生眼镜熊的演化关系分析，揭示其趋同演化特征。数据集含4个文件，支持分子系统发育分析。 文件详解 PartitionFinder_files.zip...
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  • manabuishii_yevis_getting_started_基因序列格式转换工作流数据

    2026年1月11日 30 53 39

    数据集概述 本数据集是manabuishii/yevis-getting-started项目中的一个工作流，包含14个文件，涉及基因序列数据格式转换相关的工作流定义、输入配置、示例数据及说明文档，支持CRAM与BAM、FASTQ与BAM等格式转换任务，适用于生物信息学序列数据处理场景。 文件详解 工作流定义文件（.wdl） 文件名称：cram-to-...
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  • metabarcoding_biovolume_correction_硅藻分子生物监测定量偏差校正数据

    2026年1月2日 30 106 1

    数据集概述 本数据集为论文补充数据，核心内容是硅藻分子生物监测中细胞生物量校正因子的应用相关数据，包含5个模拟群落、3次重复的原始测序数据及对应信息表，用于解决 metabarcoding 定量偏差问题，支持硅藻分子生物监测方法优化。 文件详解 15 fastq files raw reads (5 mock communities, 3...
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  • 基于Platygonus_compressus的已灭绝北美平头野猪古DNA及现存物种线粒体基因组研究数据

    2026年1月1日 30 34 5

    数据集概述 本数据集包含已灭绝北美平头野猪（Platygonus compressus）的古DNA数据，以及现存野猪科物种的完整线粒体基因组序列。数据用于分子系统发育分析，以明确古生物与现存物种的亲缘关系、分化时间，并初步探究平头野猪的种群遗传多样性。数据集共9个文件，涵盖测序数据、分析脚本及结果文件。 文件详解 测序数据文件...
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  • Metabarcoding_eDNA通过Obitools教程训练数据集

    2025年12月24日 30 73 8

    数据集概述 本数据集是用于"Metabarcoding/eDNA through Obitools"教程的训练数据，包含多种格式的文件，支持使用Galaxy平台进行生物信息学分析实践，为学习宏条形码和环境DNA（eDNA）数据处理提供基础数据资源。 文件详解 文件名称: wolf_tutorial.zip，文件格式:...
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  • 帕金森病患者与健康对照者MTG靶向富集单核RNA测序数据集

    2025年12月23日 30 55 4

    数据集概述 本数据集包含帕金森病患者与健康对照者的人类中颞叶皮层（MTG）样本经靶向富集的单核RNA测序（snRNAseq）原始FASTQ数据，是PD5D队列研究的一部分，该队列还包含基因分型、单细胞ATACseq及空间转录组学等多组学数据。 文件详解 文件名称: scherzer-pmdbs-sn-rnaseq-mtg-...
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  • 代谢型谷氨酸受体4靶向癌症免疫治疗研究数据集

    2025年12月23日 30 57 33

    数据集概述 本数据集围绕代谢型谷氨酸受体4（GRM4）在癌症免疫治疗中的作用展开，包含基因敲除、药物抑制实验及单细胞测序等相关数据，支撑GRM4靶向作为癌症免疫治疗新策略的研究结论。 文件详解 差异表达基因数据文件：...
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