找到154个数据集

分类: 公开数据 标签: NEX格式

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  • 泥炭藓生态位偏好演化研究数据集

    2026年2月12日 30 8 4

    数据集概述 本数据集聚焦泥炭藓(Sphagnum)生态位偏好与系统发育的关联,包含39种泥炭藓的18个基因位点DNA序列、系统发育树及生态数据,用于测试生态位描述符的系统发育信号及演化速率变化,揭示泥炭藓微生境偏好的进化规律。 文件详解 Sphagnum_all_genes.nex 文件格式:NEX...
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  • 中华角蛙的系统地理学与种群动态模型数据

    2026年2月9日 0 83 5

    数据集概述 本数据集围绕非洲泡沫巢树蛙(Chiromantis rufescens)展开,通过系统发育地理推断和种群统计模型测试,分析其在西非和中非几内亚-刚果雨林中的分化模式。包含线粒体DNA、单核苷酸多态性数据及种群分化模型测试结果,涉及130个样本,共6个文件。 文件详解 基因序列与结构文件 文件名称:16s.nex 文件格式:NEX...
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  • GSK3_植物基因家族系统发育与进化历史研究数据

    2026年2月9日 30 2 1

    数据集概述 本数据集围绕陆地植物GSK3/SHAGGY样激酶基因家族展开,包含系统发育分析所需的基因序列矩阵、进化树文件及基因表达数据。通过对关键类群(基础被子植物、裸子植物等)的基因分析,揭示该家族的复制事件与功能分化,为理解植物形态复杂度提升与基因家族进化的关联提供支持。 文件详解 文件名称:GSK3 phylogenetic tree.nex...
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  • 阿吉奥皮纳属蜘蛛的性别大小二态性与系统发育分析数据

    2026年2月9日 30 164 17

    数据集概述 本数据集为Argiopinae园蛛亚科蜘蛛性大小二态性(SSD)的宏观进化模式研究数据,包含系统发育分析文件及体长数据文件,支持检验性大小协同进化、异速生长模式等进化假说,用于探究该类群性二态性的非定向、等距进化特征。 文件详解 Appendix S2.nex 文件格式:NEX...
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  • Anolis_蜥蜴_海地安乐蜥繁殖特征置换基因组研究数据

    2026年2月7日 30 64 5

    数据集概述 本数据集围绕海地安乐蜥繁殖特征置换(RCD)研究展开,包含基因组扫描、线粒体DNA序列及地理参考气候数据,用于验证强化过程对繁殖隔离的作用,重新探究喉部皮瓣(dewlap)表型地理变异的驱动机制,为物种形成研究提供数据支持。 文件详解 基因组与线粒体DNA数据文件...
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  • PHYLOGENIES_水生群体无脊椎动物繁殖策略进化系统发育数据

    2026年1月27日 30 142 106

    数据集概述 本数据集围绕水生群体无脊椎动物繁殖策略的进化转变展开,包含基因序列比对文件、系统发育树拓扑结构文件、祖先特征估计脚本及繁殖策略编码数据。通过多模型分析不同基因分区的系统发育关系,为研究该类群繁殖策略的进化提供支撑,共含17份文件。 文件详解 基因比对文件 文件名称:All_genes_alignment.nex 文件格式:NEX...
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  • nrpb2_替代分子标记环境真菌群落分析数据

    2026年2月1日 30 155 100

    数据集概述 本数据集围绕rpb2基因作为环境真菌群落分析替代分子标记展开,对比其与ITS标记在云杉林表层土壤真菌群落分析中的适用性。包含模拟群落数据、OTU表及系统发育树数据,支持评估rpb2基因在分类覆盖、定量准确性和系统发育分析中的优势,共6个文件。 文件详解 模拟群落序列文件 文件名称:MOCK_ITS.fas、MOCK_rpb2.fas...
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  • Cichlid_丽鱼起源化石与分子证据研究数据

    2026年2月1日 30 190 181

    数据集概述 本数据集围绕丽鱼起源时间展开研究,提供了古生物学和分子钟分析的相关数据。通过整合化石证据与10个核基因的DNA序列数据集,对丽鱼冠群起源时间进行估算,结果支持其起源于古新世(约65-57百万年前),晚于冈瓦纳大陆分裂时间,为丽鱼生物地理学研究提供了修订的宏观进化时间尺度。 文件详解 数据文件 文件名称:cichlidCONCAT.nex...
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  • 非鸟翼类兽脚亚目恐龙鳞片皮肤结构数据2022_01

    2026年1月31日 30 44 38

    数据集概述 本数据集聚焦非鸟翼类兽脚亚目恐龙的非羽毛皮肤结构,涵盖鳞片、真皮骨化结构等形态与分布特征。数据基于化石记录,对比不同类群(如角鼻龙类、异特龙超科、暴龙超科等)的皮肤类型差异,为研究恐龙皮肤演化及与羽毛的共存关系提供基础信息。 文件详解 字符映射文件(.nex格式)...
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  • 非洲裸鳃类动物的生殖多样性演化及比较系统发育分析数据

    2026年1月31日 30 147 61

    数据集概述 本数据集围绕非洲Afrobatrachia蛙类支系的繁殖多样性进化展开,包含系统发育比较分析相关的序列文件、模拟数据、功率分析结果及脚本。通过研究该类群(占非洲蛙类多样性超一半)的繁殖模式演化,探讨陆生化繁殖策略的中间阶段、生态形态与产卵位点的关联等科学问题,共含9个文件。 文件详解 序列文件...
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  • 全基因组范围的甲虫NPC标记物_用于系统发育数据分析

    2026年1月31日 30 91 27

    数据集概述 本数据集为甲虫(Coleoptera)系统发育研究提供基因组范围的核蛋白编码(NPC)标记资源。包含1470个候选基因座及95个可PCR扩增的标记,可解决甲虫从深层到浅层的进化分歧问题,为昆虫系统发育研究提供高效且信息丰富的分子标记工具。 文件详解 文档文件 文件名称:README_for_python_scripts1.txt...
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  • Pyrgus_Based蝴蝶属气候生态位演化速率分析数据

    2026年1月30日 30 202 137

    数据集概述 本数据集围绕Pyrgus蝴蝶属的气候生态位演化展开,对比同域与异域分化谱系的生态位演化速率差异。通过整合新一代测序、生物地理学分析及生态位模型,基于全属系统发育树,分析8个气候维度的演化速率,探讨空间分化背景对生态位演化的影响。数据集包含3个核心文件,支撑相关生物进化研究。 文件详解 3_Data_occurences.xlsx...
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  • 关于人类进化关系与年代评估研究数据的贝叶斯系统发育分析报告

    2026年1月30日 30 92 79

    数据集概述 本数据集围绕南非新发现的古人类物种Homo naledi,通过贝叶斯系统发育方法分析其进化关系与年代。包含头牙特征超级矩阵数据、化石标本列表及系统发育分析文件,支持验证Homo naledi在人属进化树中的位置及年代估计(约91.2万年),为古人类演化研究提供关键数据支撑。 文件详解 Dembo_et_al_2016_JHE.nex...
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  • Lemmus_Based_挪威旅鼠古DNA进化历史研究数据

    2026年1月30日 30 99 85

    数据集概述 本数据集为研究挪威旅鼠(Lemmus lemmus)起源的古DNA分析数据,包含17个文件,涵盖BEAST输入文件、MrBayes输入文件、进化树注释结果、序列比对数据集等,用于探究该物种在晚更新世至全新世的进化历史及冰期避难所生存证据。 文件详解 BEAST分析文件...
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  • Salmo_ischchan_塞凡湖鳟鱼基因组进化研究数据

    2026年1月30日 30 125 66

    数据集概述 本数据集为塞凡湖鳟鱼(Salmo ischchan)物种群进化研究的基因组数据,包含6个文件,涵盖线粒体DNA多序列比对、核基因SNP数据、进化分析相关的数据文件及说明文档,支持系统发育树构建、群体结构分析、基因流检测等进化生物学研究,助力解析塞凡湖鳟鱼物种群的形成机制与进化历史。 文件详解 核基因SNP数据文件...
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  • Lepidosauria_Based鳞龙类三叠纪起源研究整合数据

    2026年1月28日 30 146 138

    数据集概述 本数据集为研究鳞龙类(蜥蜴、蛇、喙头蜥)起源的整合数据,包含德国Vellberg地区中三叠世最古老鳞龙类化石相关的分子序列、系统发育矩阵及分析文件,用于结合化石与分子证据确定鳞龙类起源时间,共5个文件。 文件详解 系统发育矩阵文件 文件名称:Vellberg_FossilPhylo_matrixPAUPmrB.nex 文件格式:NEX...
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  • Lissamphibia_Based化石终端分类群分歧时间估算数据

    2026年1月27日 30 134 30

    数据集概述 本数据集围绕Lissamphibia起源展开,采用化石作为终端分类群,结合分子与形态数据,通过贝叶斯方法估算分歧时间。包含系统发育分析所需的形态、分子数据文件及分析结果文件,共10个文件,用于探究Lissamphibia的单系性、演化位置及起源时间。 文件详解 .tre格式文件(共5个)...
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  • Molluscan_Consensus_软体动物门系统发育评估数据

    2026年1月27日 0 117 9

    数据集概述 本数据集聚焦软体动物门的系统发育研究,整合42篇已发表的系统发育树数据,对比形态学与分子生物学推断的类群关系差异。通过分析类群间的节点距离模式,评估现有系统发育假说的一致性,为软体动物门高阶分类关系的后续研究提供参考依据。 文件详解 补充图表文件(EPS格式) 文件名称:suppl-...
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  • RAD_seq_Based_南极企鹅种群基因组比较与扩散机制研究数据

    2026年1月27日 30 92 63

    数据集概述 本数据集为南极企鹅种群基因组比较研究数据,基于RAD-seq技术获取5种企鹅(帝企鹅、王企鹅、阿德利企鹅、帽带企鹅、巴布亚企鹅)的全基因组数据,用于分析繁殖群体间的连通性模式,探究影响物种扩散的内在与外在屏障,揭示海洋生态位及海洋学因素对基因流的作用。 文件详解 基因组变异数据文件(.vcf格式) 文件名称:Gentoos_all-...
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  • Toyotamaphimeia_taiwanicus_分类修订研究数据

    2026年1月26日 30 87 24

    数据集概述 本数据集聚焦台湾更新世鳄类Tomistoma taiwanicus的分类修订研究,将其重新归类为Toyotamaphimeia taiwanicus,为日本以外首次发现该属物种。数据支持其东亚演化支系地位,揭示其热带物种属性及台湾起源、向日本扩散的演化场景,为古生物地理研究提供关键证据。 文件详解 文件名称:Cho and Tsai...
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