找到77个数据集

分类: 公开数据 标签: VCF文件

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  • 基因组特征_岛屿雀类物种形成基因组学数据

    2026年2月9日 30 182 60

    数据集概述 本数据集为岛屿雀类物种形成研究相关数据,包含样本信息、单核苷酸多态性(SNPs)、线粒体序列、核基因序列及微卫星数据集等,用于分析岛屿雀类物种形成过程中的隔离、杂交和选择的基因组特征,支持物种演化机制研究。 文件详解 Table_S9_samples_accession_nos.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 梅氏酵母_Metschnikowia_的遗传混合与表型多样性研究数据

    2026年2月6日 0 66 51

    数据集概述 本数据集为论文“Genetic admixture increases phenotypic diversity in the nectar yeast Metschnikowia reukaufii”的原始数据及补充文件,包含73株Metschnikowia...
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  • 黄毛平菇的颜色评分_COI单倍型及SNP数据

    2026年2月1日 30 200 113

    数据集概述 本数据集包含金龟子Phelotrupes auratus个体的颜色评分、COI单倍型及SNP数据,用于研究该物种地理颜色变异的种群遗传结构。数据支持分析颜色变异与遗传分化的关系、基因流障碍及颜色相关基因位点,涉及红、绿、靛蓝三种体色类型及五个种群分组。 文件详解 SNP数据文件 文件名称:SNP_data.vcf 文件格式:VCF...
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  • 苏必利尔湖湖鳟鱼生态型形态与基因组多样性数据

    2026年2月1日 30 70 33

    数据集概述 本数据集聚焦苏必利尔湖鳟鱼四种生态型的形态与基因组分化平行性研究,包含486个个体的6822个过滤SNP基因数据及多采样点形态测量数据,覆盖Isle Royale、Big Reef等4个采样点,用于分析生态型间遗传分化、形态差异及适应性选择位点,支持进化生物学中生态物种形成机制的研究。 文件详解 样本信息文件...
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  • 海洋基因组学_海洋环境_海扇贝_基因组结构研究数据

    2026年1月31日 30 188 71

    数据集概述 本数据集围绕经济物种海扇贝(Placopecten magellanicus)的基因组结构与海洋环境变异的关联展开,包含245个个体的7163个SNP位点数据,以及温度、盐度等海洋环境参数,旨在分析环境因素对其基因频率梯度的驱动作用,为渔业管理和环境变化响应预测提供依据。 文件详解...
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  • RADseq_Based聚类阈值优化实证流程配套数据

    2026年1月31日 30 126 73

    数据集概述 本数据集为论文“An empirical pipeline for choosing the optimal clustering threshold in RADseq studies”的配套数据,包含两个压缩文件,用于支持RADseq研究中聚类阈值优化实证流程的复现与分析,可辅助研究人员确定RADseq数据分析中的最优聚类参数。...
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  • Tanakaea_Based植物演化与种群稳定性研究数据

    2026年1月30日 30 51 23

    数据集概述 本数据集为Tanakaea属(虎耳草科)植物演化与种群稳定性研究的配套数据,包含叶绿体基因组序列、基因组单核苷酸多态性、形态特征测量及性别分化等多维度数据,用于验证残遗植物演化停滞与种群稳定性假说,揭示繁殖性状演化对其长期存活的作用。 文件详解 叶绿体基因组相关文件...
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  • Wheat_EMS_Based小麦增强抗病性突变体研究数据

    2026年1月29日 30 51 41

    数据集概述 本数据集为小麦EMS突变体抗病性研究相关数据,包含通过GATK和QTL-seq技术生成的分析文件,用于研究小麦增强抗病性EMS突变体(含模拟病斑突变体)对条锈病的成株抗性,共包含2个压缩文件。 文件详解 Kr620_GATK.zip 文件格式:ZIP...
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  • Opiliones_Based_生殖模式基因组测定与分析数据

    2026年1月29日 30 59 1

    数据集概述 本数据集包含 facultatively parthenogenetic Opiliones(Leiobunum manubriatum 和 L....
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  • GBS_PAG2018_八倍体草莓基因分型与变异发现研究数据

    2026年1月29日 30 81 35

    数据集概述 本数据集为八倍体草莓(Fragaria × ananassa)基因分型与变异发现研究数据,基于基因分型测序(GBS)技术与参考基因组,测试PstI-MseI和HindIII-MseI两种酶组合的双酶切方案,通过Illumina HiSeq...
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  • 马加迪湖罗非鱼的酒精耐受性与生态形态差异研究数据集_我是分割线

    2026年1月29日 30 205 81

    数据集概述 本数据集聚焦东非Magadi湖及Little Magadi湖极端环境(高温、高碱、高盐)中的Alcolapia属罗非鱼,通过RAD-seq基因组学、几何形态测量学、稳定同位素分析及种群动态模拟,探究其生态形态分化与适应性进化。数据覆盖种群基因组差异、形态特征、食性生态及种群历史,为研究小型鱼类辐射演化提供模型系统支撑。 文件详解...
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  • Genome_Based北太平洋虎鲸生态型基因组SNP分析数据

    2026年1月29日 30 32 3

    数据集概述 本数据集包含北太平洋三种部分同域分布虎鲸生态型的全基因组单核苷酸多态性(SNP)数据,用于研究其复杂的祖先起源。数据通过多位点溯祖树、混合图重建及f4统计等方法分析,揭示生态型间的进化关系、祖先混合事件及不完全谱系分选现象,总计包含十四份文件。 文件详解 XML文件(5个)...
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  • Ecology_Based竹节虫颜色表型适合度遗传互作研究数据

    2026年1月28日 30 208 62

    数据集概述 本数据集基于竹节虫野外实验,聚焦颜色表型的基因型-表型-适合度图谱构建,探究生态选择如何塑造上位性遗传互作。包含颜色性状的遗传基础、适合度关联及不同宿主植物处理下的选择动态数据,为理解自然中遗传互作的进化机制提供支撑。 文件详解 代码文件(.r格式,共18个)...
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  • 黄莺杂交区基因组及羽毛变异研究_以巴尔的摩与布洛克黄莺杂交区为例

    2026年1月28日 30 11 6

    数据集概述 本数据集聚焦巴尔的摩拟鹂与布洛克拟鹂杂交区,通过简化基因组测序获取297只拟鹂的3067个遗传标记,结合羽色表型数据,分析杂交与基因渐渗模式、表型与基因型的关联性,以及杂交区的时空动态,为鸟类物种分化机制研究提供支持。 文件详解 Modern_Oriole_Phenotypes.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Rhagoletis_Based果蝇滞育适应性分化基因组研究数据

    2026年1月28日 30 193 164

    数据集概述 本数据集包含Rhagoletis果蝇苹果和山楂寄主种群滞育适应性分化的基因组研究数据,涉及基因位点变异、等位基因频率、滞育相关性状分析及数据处理脚本等内容,用于解释适应性进化中多性状组合与拮抗选择导致的反直觉遗传模式,共含37个文件。 文件详解 基因组数据文件...
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  • Felidae_Based_富集条件对猫科动物DNA捕获影响研究数据

    2026年1月27日 30 186 63

    数据集概述 本数据集围绕富集条件对猫科动物线粒体DNA捕获效果的影响展开,通过杂交捕获技术结合高通量测序,评估不同杂交温度对新鲜、档案及古代样本捕获成功率的作用,为优化非模式物种及降解样本的DNA捕获方案提供数据支持。 文件详解 Tree-files.zip 文件格式:ZIP 内容说明:包含与实验相关的树文件压缩包 LSE-...
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  • Pasteuria_Daphnia_Based宿主基因组进化研究数据

    2026年1月26日 30 164 88

    数据集概述 本数据集用于研究寄生虫驱动宿主基因组进化的分子机制,聚焦浮游甲壳动物大型溞(Daphnia magna)与细菌病原体Pasteuria ramosa的互作系统。包含97个欧洲来源Daphnia magna基因型的全基因组多态性数据,通过关联分析识别抗P. ramosa的基因组区域,并检测正选择信号。数据集共3个文件,支持宿主-...
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  • Norway_spruce_Genomic_人口历史与基因流研究数据

    2026年1月25日 30 82 64

    数据集概述 本数据集包含支持论文“Genomic data provides new insights on the demographic history and the extent of recent material transfers in Norway...
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  • Mytilus_Based_入侵与本地海洋贻贝基因分化与杂交结果数据

    2026年1月23日 30 139 59

    数据集概述 本数据集围绕入侵海洋贻贝Mytilus galloprovincialis与本地近缘种的基因分化及杂交结果展开,包含非杂交(南非、加州)和杂交(澳大利亚贝特曼斯湾、悉尼港)场景下的基因数据,涉及大西洋与地中海谱系的平行分化、长链非编码RNA演化约束及不同杂交区的基因渗入差异分析。 文件详解...
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  • Artocarpus_spp_基于转录组的面包果驯化正向选择分析数据

    2026年1月23日 30 170 107

    数据集概述 本数据集是面包果(Artocarpus altilis)及其野生近缘种驯化过程中正向选择的转录组筛选研究数据,包含转录组组装、变异检测及系统发育分析相关文件,可用于识别面包果驯化相关的候选基因,支撑改良品种开发与种质资源保护研究。 文件详解 文件名称:breadfruit.vcf.gz 文件格式:VCF(压缩格式)...
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