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Ceratodon_purpureus_De_novo_转录组组装与比较分析数据
数据集概述 本数据集包含紫萼藓（Ceratodon purpureus）雌雄分离株的转录组从头组装与比较分析数据，使用454 FLX技术生成。通过与小立碗藓（Physcomitrella patens）的比较分析，覆盖了原丝体转录组，为研究苔藓植物基因家族进化、生理发育分化及密码子使用偏好提供资源，共含12个文件。 文件详解 预测序列文件...
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Mesodesma_donacium_SNP_Based_基因注释与多态性分析数据
数据集概述 本数据集围绕软蛤Mesodesma donacium的表达序列标签（EST）数据展开，通过454焦磷酸测序生成180159条EST，经从头组装得到10178个contigs和41765个singletons，最终发现2594个SNP位点，涉及613条共识序列，还包含基因本体（GO）分析及SNP验证相关信息，为该物种遗传研究提供基础数据。...
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Triops_newberryi_Based蝌蚪虾转录组组装及差异基因表达分析数据
数据集概述 本数据集包含蝌蚪虾（Triops newberryi）无参考基因组的转录组从头组装结果及初步差异基因表达分析数据。通过Illumina Hi-Seq 2000对实验室控制条件下、两种不同水质（原生与非原生）饲养的无节幼体蝌蚪虾进行RNA测序，获得3.65亿条50nt...
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Picea_abies_Transcriptome_Sequencing_Data
数据集概述 本数据集为挪威云杉（Picea abies）针叶转录组测序结果，包含约7000万条76bp片段的原始数据（5Gbp），通过从头组装及整合公共EST数据构建参考转录组，获得38419条长度超150bp的PUTs（推定唯一转录本），并分析了基因表达差异、SNPs及同义/非同义替换率，为裸子植物与被子植物的基因进化研究提供数据支持。 文件详解...
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Raeymaekers_NatCommun_2017_三刺与九刺棘鱼适应性分化研究数据
数据集概述 本数据集包含三刺和九刺棘鱼的基因分型及相关研究数据，用于分析两种亲缘关系相近的鱼类在共同生境中沿盐度梯度的中性与适应性分化差异。数据支撑对物种特异性适应能力、表型平行性与基因组非平行适应性的研究，共含3个文件。 文件详解 九刺棘鱼基因分型文件 文件名称：Raeymaekers et al-...
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Populus_Salicaceae_Based杨属植物叶绿体基因组与核基因组差异分析数据
数据集概述 本数据集包含杨属植物（Populus balsamifera和P. trichocarpa）的叶绿体基因组测序分析数据，用于研究近缘物种间叶绿体基因组与核基因组的差异。通过从头组装和参考映射构建系统发育树，揭示了叶绿体基因组的深度分化与核基因组分化的不一致性，为植物分子系统发育研究提供数据支持。 文件详解 系统发育数据文件...
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ENA_PRJEB62664_Symphonia_globulifera全基因组组装与注释数据
数据集概述 本数据集包含热带雨林物种Symphonia globulifera的从头组装核基因组、叶绿体基因组及线粒体基因组相关数据，涉及基因组组装、注释、编码序列提取及基因比对结果，可用于研究该物种的种内遗传变异特性，共包含7个文件。 文件详解...
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Kentish_plover_Transcriptome_神经转录组组装及表达分析数据2013
数据集概述 本数据集为Kentish plover（Charadrius alexandrinus）的从头神经转录组组装结果，基于端脑和间脑组织的Illumina RNA-Seq短读长数据生成。包含超21000条表达转录本、31000余个高质量SNP、2500余个SSR，以及雌雄行为相关差异表达基因，为无参考基因组的生态模型物种提供转录组资源。...
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Brassicaceae_Transcriptome_Based十字花科转录组SSR分子标记与注释数据
数据集概述 本数据集基于十字花科19个物种的从头组装转录组，挖掘得到2012个可直接使用的SSR标记及引物序列，同时包含Cochlearia pyrenaica的高质量注释转录组，还测试了Cochlearia属内标记的可转移性与多态性，为十字花科进化研究与遗传分析提供工具。 文件详解...
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Pseudo_nitzschia_arenysensis_Based_脂氧合酶敲低株转录组组装及功能注释数据
数据集概述 本数据集包含硅藻Pseudo-nitzschia arenysensis脂氧合酶（LOX）基因敲低株及野生型菌株的RNA-seq数据从头组装结果，以及转录本序列的功能分类信息，旨在研究氧脂素合成机制及相关代谢物在硅藻中的作用机制。 文件详解 文件名称：P. arenysensis...
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Ulkenia_visurgensis_Based_智利破囊壶菌Lng2转录组组装与功能注释完整数据
数据集概述 本数据集包含智利破囊壶菌菌株Ulkenia visurgensis Lng2的从头转录组组装结果及功能注释信息。转录组基于NovaSeq 6000测序的150bp双端 reads 组装，涵盖9个RNA样本的清理数据、Trinity组装结果、Python代码、中间文件及GO/KEGG/同源注释，以压缩包形式提供。 文件详解...
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Supplementary_Table_S2_Based_马铃薯转录组de_novo组装参数信息数据
数据集概述 本数据集为详细的马铃薯转录组从头组装信息补充表格，核心内容是马铃薯初级转录组组装的汇总列表，记录了用于生成短读长从头组装的相关参数，为马铃薯转录组组装分析提供结构化参考。 文件详解 文件名称：Supplementary Table S2.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：包含马铃薯初级转录组从头组装的汇总信息，记录了短读长de...
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Squalius_pyrenaicus_Based_伊比利亚濒危鲤科鱼类繁殖器官转录组数据_基因组资源
数据集概述 本数据集为伊比利亚特有濒危鲤科鱼类（Squalius pyrenaicus）繁殖相关器官的从头组装转录组数据，包含雌雄个体脑和性腺组织的转录组序列、基因注释及GO功能注释信息，可用于研究该物种性别决定机制、繁殖相关基因功能及进化特征，为濒危物种保护提供基因组资源支持。 文件详解 非冗余转录本序列文件...
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烟草天蛾基因组从头组装数据集
数据集概述 本数据集提供烟草天蛾（Manduca sexta）的新参考基因组JHU_Msex_v1.0，通过现代技术从头组装，提升连续性、准确性和完整性。基因组大小470 Mb，连续性为原版本的约25倍，scaffold N50超14 Mb，注释含25,256个基因，可供公开使用。 文件详解...
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黑水虻幼虫转录组组装与生物活性肽数据集
数据集概述 本数据集围绕黑水虻幼虫的转录组组装及相关生物活性肽展开，包含转录组从头组装注释结果、神经肽前体列表、抗菌肽前体列表及图表说明文档，为研究其对水产动物的促肠动力潜力与抗菌特性提供数据支持。 文件详解 该数据集包含4个文件，具体说明如下： - 转录组组装文件: -...
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加州红鲍转录组测序SNP发现与高分辨率熔解分析数据集
数据集概述 本数据集为加州红鲍转录组测序研究成果，包含通过cDNA焦磷酸测序鉴定的622个高质量SNP标记，及45个具基因本体功能信息的SNP标记，其中8个在个体中呈多态性，通过高分辨率熔解分析（HRMA）验证，为评估遗传多样性提供候选基因数据。 文件详解 Hr summary report.pdf：PDF格式，红鲍SNP研究的总结报告文档 Multi...
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束带蛇转录组_焦磷酸测序_从头组装及性别特异性差异数据集
数据集概述 本数据集包含西部 terrestrial 束带蛇（Thamnophis elegans）的转录组数据，通过焦磷酸测序技术生成，涵盖雌雄性别特异性转录本差异。数据经从头组装得到基因序列，结合注释分析识别性别特异性基因、SNPs、INDELs及进化相关基因，为爬行动物分子资源研究提供支持。 文件详解...
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Parthenoxylon转录组组装结果补充材料3
数据集概述 本数据集为《Characterisation of the Cinnamomum parthenoxylon (Jack) Meisn (Lauraceae) transcriptome using Illumina paired-end sequencing and EST-SSR markers development for...
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Cinnamomum_parthenoxylon_Based_天料木转录组组装单基因长度数据完整图像
数据集概述 该数据集为Cinnamomum parthenoxylon转录组研究的补充材料5，核心内容是展示其从头转录组组装得到的单基因长度分布的图片，支持种群遗传学研究中的EST-SSR标记开发。 文件详解 文件名称: oo_1000532.jpg 文件格式: JPG（.jpg） 文件内容: 对应图S3，展示Cinnamomum...
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大鼠lncRNA_Bdnf_as定位扩展补充材料数据集
数据集概述 本数据集是“Mapping rat lncRNA Bdnf-as”研究的扩展补充材料，包含序列比对文件、BAM文件、从头组装GTF文件等，为大鼠长链非编码RNA Bdnf-as的定位研究提供支持。 文件详解 该数据集包含20个文件，具体说明如下： - 序列比对与组装文件: -...
