大鼠lncRNA_Bdnf_as定位扩展补充材料数据集

数据集概述

本数据集是“Mapping rat lncRNA Bdnf-as”研究的扩展补充材料,包含序列比对文件、BAM文件、从头组装GTF文件等,为大鼠长链非编码RNA Bdnf-as的定位研究提供支持。

文件详解

该数据集包含20个文件,具体说明如下: - 序列比对与组装文件: - .bam文件(如aln_as_tr1_sorted.bam、trinity-GG_2.gmap.bam等): 共5个,为序列比对结果文件 - .bai文件(如aln_as_tr1_sorted.bam.bai等): 共5个,为BAM文件的索引文件 - .sam文件(如aln_mus_tr2.sam等): 共2个,为序列比对格式文件 - .sai文件(如aln_mus_tr2.sam.sai等): 共2个,为SAM文件的索引文件 - .gtf文件(如3chr_2.gtf): 1个,为从头组装的基因注释文件 - ClustalO_alignment.fa: 1个,为ClustalO序列比对结果文件 - 补充文档与表格: - Supplementary materials.pdf: 1个,PDF格式,首页包含所有文件的详细描述 - Supplementary_table2.txt: 1个,TXT格式,包含用于搜索的序列信息及相关评分数据 - Supplementary_table3.tsv: 1个,TSV格式,包含motif数据库信息、p值、TP/FP率等字段 - Supplementary_table4.tsv: 1个,TSV格式,包含miRNA相关motif信息、统计检验结果等字段

适用场景

  • 分子生物学研究: 用于大鼠lncRNA Bdnf-as的序列比对、基因注释及功能分析
  • 基因组学分析: 支持非编码RNA的从头组装、物种间序列比对研究
  • 生物信息学方法验证: 可用于测试序列比对工具、基因注释流程的有效性
  • 神经科学研究: 为Bdnf相关非编码RNA在神经调控中的作用研究提供数据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.51 MiB
最后更新 2025年12月13日
创建于 2025年12月13日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。