找到16个数据集

标签: BAM文件

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  • yevis_getting_started线粒体测序分析工作流完整数据

    2026年1月26日 30 6 0

    数据集概述 本数据集是manabuishii/yevis-getting-started项目中的一个工作流数据，包含31个文件，涉及人类线粒体基因组分析所需的参考序列、配置文件、工作流脚本等。数据覆盖参考基因组文件、索引文件、黑名单位点文件、工作流定义文件（WDL）、输入参数配置文件等类型，用于支持线粒体基因组的比对、变异检测等分析流程。 文件详解...
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  • Citrus_Genetic_Basis_柑橘杂交驯化细胞质核冲突研究数据集

    2026年1月20日 30 152 85

    数据集概述 本数据集围绕柑橘杂交、驯化及多样化过程中的细胞质核冲突遗传基础展开，包含184份样本的叶绿体、线粒体及核基因组变异图谱，线粒体异质性分析序列，基因表达归一化数据，GWAS分析文件，基因注释结果及基因组组装文件等，共14个文件，为柑橘细胞质核互作机制研究提供全面数据支撑。 文件详解 基因组变异图谱类...
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  • conNDD_Based_152例研究外显子组五年后再评估分析数据_2023

    2026年1月20日 30 169 45

    数据集概述 本数据集为论文“Re-evaluation and Re-analysis of 152 research exomes five years after the initial report reveals clinically relevant changes in...
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  • Kennett_et_al_Based_查科峡谷史前母系王朝考古基因组完整数据

    2026年1月19日 30 2 0

    数据集概述 本数据集为查科峡谷史前母系王朝的考古基因组研究数据，包含公元800至1130年间普韦布洛博尼托精英墓穴中9个个体的线粒体基因组及6个核基因组样本信息，证实该区域存在持续约330年的精英母系世系，用于探究无文字史前复杂社会的世袭领导机制。数据集共含4个文件，涵盖说明文档、压缩数据及补充信息。 文件详解 说明文档类...
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  • CNVkit_Based_RD_Connect_GPAP合成数据拷贝数变异检测数据

    2026年1月15日 30 104 39

    数据集概述 本数据集是从Zenodo原始BAM文件集合中提取的子集，基于RD-Connect GPAP合成数据进行处理，通过CNVkit检测拷贝数变异，仅保留感兴趣区域。数据集包含72个文件，涵盖.cns、.vcf、.json三种格式，聚焦于基因组拷贝数变异的分析研究。 文件详解 文件类型与分布...
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  • Johnson_et_al_2022_Based_芸苔属植物干旱实验基因组进化数据

    2026年1月14日 30 187 117

    数据集概述 本数据集记录了芸苔属植物Brassica rapa在实验干旱条件下的基因组进化研究数据，包含祖先与后代种群的基因组测序结果、表型数据及分析文件，用于探究干旱选择下的遗传平行性与适应性进化机制，共8个文件。 文件详解 文档类文件 文件名称：README_Johnson_et_al_2022_JEB.txt 文件格式：TXT...
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  • Xdrop_Nanopore_Based_转基因抗晚疫病马铃薯T_DNA特征分析数据集

    2026年1月14日 30 82 53

    数据集概述 本数据集包含利用Samplix Xdrop®富集技术和Nanopore测序技术，对Feed the Future全球生物技术马铃薯合作项目开发的4个转基因抗晚疫病马铃薯事件（DIA_MSU_UB015、DIA_MSU_UB255、GRA_MSU_UG234、GRA_MSU_UG265）进行T-...
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  • BAM_Files_Human_RNA_seq_WES_Visualization_Practice_Data

    2025年12月28日 30 148 42

    数据集概述 本数据集包含两组人类小BAM文件，分别用于RNA-seq和全外显子测序（WES）可视化教学练习。RNA-seq数据来自上皮间质转化细胞系的0天（未诱导）和7天（诱导后）样本，WES数据来自非小细胞肺癌患者的肿瘤和血液组织样本，所有数据均从开放获取的SRA数据集处理而来。 文件详解 RNA-EMT.zip 文件格式：ZIP...
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  • 黑腹果蝇基因组结构变异检测与基因分型数据集

    2025年12月22日 30 174 160

    数据集概述 该数据集包含使用Genomestrip/2.0工具，对黑腹果蝇（D.melanogaster）Sussex LHM半克隆系及一个内部参考系个体的基因组结构变异进行检测与基因分型的代码、日志、数据及摘要。数据涵盖原始与过滤后的CNV结果、提交至NCBI dbVAR的变异文件等，为相关基因组研究提供支持。 文件详解 代码文件:...
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  • 美洲黑松适应性性状全基因组关联遗传学数据集

    2025年12月15日 30 171 163

    数据集概述 该数据集围绕美洲黑松球果闭鳞性这一关键适应性性状展开全基因组关联遗传学研究，包含通过限制性酶切与PCR扩增法生成的群体基因组数据，涉及98株样本的95000余个单核苷酸多态性位点，为解析该性状的遗传结构提供支持。 文件详解 REFpine27apr11-0.bam：BAM格式文件，可能为测序比对后的基因组数据文件...
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  • Target_Bam_Atf4_Locus_Based_小鼠Atf4基因座RNA_seq子集BAM数据_补充说明_按规则优化_1_主题_时间风格中加入_m...

    2025年12月14日 30 59 4

    数据集概述 本数据集包含小鼠基因组mm10版本中chr15:79481845–81029726区间的RNA-seq子集BAM文件，覆盖Atf4、Rps19bp1、Cacna1i基因座及邻近区域，用于聚焦分析该区域的剪接连接、异常融合转录本及转录动态。 文件详解 文件名称: Target.Bam.zip 文件格式: ZIP压缩包（.zip） 内容说明:...
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  • 大鼠lncRNA_Bdnf_as定位扩展补充材料数据集

    2025年12月13日 30 9 6

    数据集概述 本数据集是“Mapping rat lncRNA Bdnf-as”研究的扩展补充材料，包含序列比对文件、BAM文件、从头组装GTF文件等，为大鼠长链非编码RNA Bdnf-as的定位研究提供支持。 文件详解 该数据集包含20个文件，具体说明如下： - 序列比对与组装文件: -...
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  • 桃基因组测序_附加叶片BAM文件比对数据集

    2025年12月13日 30 139 29

    数据集概述 该数据集围绕桃基因组测序展开，包含用于比对分析的附加叶片BAM文件压缩包，为桃基因组相关研究提供原始测序数据支持。 文件详解 文件名称: DHQ_bams_aroundMutSites.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明: 压缩包内包含与桃基因组测序相关的叶片BAM文件，具体字段及内容需解压后查看，无预览信息 适用场景...
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  • Leishmania主要端粒酶TERT成分缺失与端粒_细胞稳态及感染性关联研究数据集

    2025年12月10日 30 24 15

    数据集概述 该数据集为Shiburah等人关于Leishmania主要端粒酶TERT成分缺失与端粒、细胞稳态及感染性关联研究的配套数据，包含实验结果数据、序列文件、文档及图片等多种类型文件，支撑相关研究分析。 文件详解 数据文件（.xlsx/.xls格式）： AnnexinV-PI analysis.xlsx：AnnexinV-PI分析数据...
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  • 拟南芥盐度耐受性平行进化研究数据集

    2025年12月10日 30 147 12

    数据集概述 本数据集包含Martinez-Rivas等人2025年发表于《Science Advances》的研究“Parallel Evolution of Salinity Tolerance in Arabidopsis thaliana Accessions from Cape Verde...
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  • SARS_CoV_2再感染病例基因组证据数据集

    2025年12月5日 30 11 3

    数据集概述 本数据集围绕SARS-CoV-2再感染病例的基因组证据展开，包含该病例相关的基因组测序数据、变异分析文件、实验方法脚本及附录文档，为研究新冠病毒再感染的基因组特征提供支持。 文件详解 该数据集包含14个文件，按类型分类说明如下： - 基因组变异文件（.vcf格式，共5个）： -...
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