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Sceloporus_Based_北美刺蜥物种分化比较基因组数据
数据集概述 本数据集为北美刺蜥属8个物种三元组的基因组分化研究数据，通过简化基因组测序获取数百个基因座序列，使用隔离-迁移模型对比物种分化的遗传历史，检测物种形成时的基因流情况，分析基因组水平的分化时间变异及迁移率参数。 文件详解 文件名称：TripletData.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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Marcussen_et_al_小麦祖先基因组杂交研究数据_压缩包
数据集概述 本数据集聚焦于面包小麦祖先基因组的古杂交事件研究，通过分析小麦及五倍体近缘种的基因组组装数据，探究其系统发育历史、进化关系与分化时间，揭示小麦基因组多轮杂交（同倍体与多倍体）的形成机制，为理解小麦基因组的多层次系统发育镶嵌结构提供基础。 文件详解...
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Amblypygi_Based鞭蛛全球系统发育与DNA序列研究数据
数据集概述 本数据集为鞭蛛（Amblypygi）全球系统发育研究相关数据，包含DNA序列比对、UCE序列比对及说明文档，支持鞭蛛分子系统发育分析、分化时间估算等研究，共5个文件，覆盖3种文件格式。 文件详解 README.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：数据集说明文档，包含研究背景、数据采集与处理方法、文件内容说明等信息...
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Liocichla_Based鸟类属多基因位点分子系统发育研究数据
数据集概述 本数据集包含鸟类Liocichla属（雀形目：噪鹛科）的多基因位点分子系统发育研究数据，涵盖5个已识别物种的基因序列比对、系统发育分析文件及相关辅助数据，用于构建物种进化树、估算分化时间，支持亚洲鸟类多样化的生物地理假说验证。 文件详解 分析配置文件（XML）...
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Dryad_淡水鱼类群落_遗传结构与生态古景观筛选分析数据2020
数据集概述 本数据集聚焦巴西大西洋沿岸水系中四种共分布淡水鱼类（脂鲤科）的遗传结构研究，通过SNPs分析检验类群间遗传结构的一致性，探究生态筛与古景观筛对群落结构的影响，含1个压缩文件。 文件详解 文件名称：Dryad_ThomazKnowles2020.zip 文件格式：ZIP（压缩文件）...
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Squamata_Based_有鳞目基因组规模数据系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集基于289个样本的高通量测序数据，覆盖75个有鳞目科，用于分析其系统发育关系、估算分化时间及评估拓扑不确定性。重点验证传统形态学分类群（如Scleroglossa和Macrostomata）的基因组支持度，探讨基因树与物种树不一致的原因，包含23个相关文件。 文件详解 文档类文件 文件名称：Fig_S1_Phylogenetic...
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Forpus_Based_新热带区鹦鹉属多样化时空尺度偏差识别研究数据
数据集概述 本数据集围绕新热带区Forpus鹦鹉属展开，旨在识别其多样化过程中不同时空尺度的偏差。通过对比生物种与统计推断种/亚种的数据集，分析其对多样化速率及生物地理断裂带推断的影响，探讨新热带鸟类演化时间起源争议的可能原因。 文件详解 文件名称：Alignments.zip 文件格式：ZIP...
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Synbranchiformes_Based全球扩散生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集包含合鳃鱼目（Synbranchiformes）鱼类的超保守元件（UCEs）测序数据及系统发育分析结果，用于研究该类群的全球扩散历史与生物地理学模式。数据支持东南亚为主要类群祖先区域的结论，排除冈瓦纳大陆分裂假说，揭示独立大陆入侵事件，共包含十五个文件。 文件详解 系统发育树文件（.tre）...
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Anchored_Based_天牛科系统发育与进化研究锚定杂交富集数据
数据集概述 本数据集基于锚定杂交富集技术生成的522个单拷贝核基因系统发育数据，用于重建天牛科（Cerambycidae）的高级系统发育关系。样本覆盖31个叶甲总科类群及4个外群，聚焦天牛科的系统发育地位与亚科间关系，为天牛科进化历史研究提供基础数据。 文件详解 文件名称：concatenated_nt.phy 文件格式：.phy...
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Cavernacmella_Based_海洋岛屿小蜗牛表型进化研究数据
数据集概述 本数据集记录小笠原群岛微陆栖蜗牛Cavernacmella的表型进化研究数据，包含表型数据与基因序列比对文件，用于分析表型分化与基因型分化的关联模式，揭示其长期表型稳定与短期分化的特征。 文件详解 DA_morphological_data.xls 文件格式：XLS 字段映射介绍：包含小蜗牛表型数据，具体字段未提供预览...
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MycoKeys_补充材料_单生隔担菌属系统发育分化时间分析_2023年
数据集概述 本数据集为论文《Haploporus属（多孔菌目，担子菌门）的分类纲要、系统发育及分化时间分析：两个新物种的提出》的补充材料，包含支持研究结论的相关数据，以压缩文件形式呈现，用于辅助理解Haploporus属的分类学研究结果。 文件详解 文件名称：oo_883143.zip 文件格式：ZIP（压缩包）...
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Uma_scoparia_Based_莫哈韦沙趾蜥蜴种群结构与物种形成研究数据
数据集概述 本数据集包含莫哈韦沙趾蜥蜴（Uma scoparia）的种群遗传学研究数据，旨在分析该物种的物种形成、种群结构及历史动态。数据来自109只蜥蜴样本的14个核基因座DNA序列，通过多种遗传学分析方法（如贝叶斯聚类、隔离迁移模型等）验证了其与近缘种的分化时间及种群特征，为该濒危物种的保护单元定义提供支持，共含18个文件。 文件详解...
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Dry_Forest_Birds_Genome_SNP分化基因流数据
数据集概述 本数据集记录南美干旱林鸟类种群分化与基因流研究的相关文件，涉及6个共分布类群对的基因组SNP数据及分析结果，核心研究干旱林鸟类群落因地理隔离形成的非同步分化模式与不对称基因流特征，包含3个归档文件。 文件详解 归档文件1：MarTum-fsc2_files.tgz 文件格式：TGZ...
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Amphiacusta_物种泵假说验证_加勒比蟋蟀基因组分化研究数据
数据集概述 本数据集通过基因组扫描验证“物种泵”假说，研究加勒比无翅蟋蟀（Amphiacusta sanctaecrucis）在维尔京群岛的种群分化。包含10个种群136个个体的约32000个单核苷酸多态性（SNPs）数据及相关分析文件，支持推断 colonization模型、遗传分化水平和分化时间，探讨岛屿连接周期对基因组分化的影响。 文件详解...
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Notothenioid_Based_南极冰鱼适应性辐射进化分析数据
数据集概述 本数据集围绕南极冰鱼适应性辐射的进化研究，包含14个文件，主要为XML格式的模型文件和trees格式的树文件。通过时间校准的系统发育树及形态、浮力等特征数据，验证冰鱼辐射是否符合早期爆发模型，分析其多样性与差异的时间动态。 文件详解 XML模型文件（12个） 文件名称：Model01.xml至Model12.xml 文件格式：.xml...
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Pinus_Fossils_Based_松属化石校准分化时间估算数据集
数据集概述 本数据集包含基于21个均匀分布于松属主要分支的化石，结合节点定年和端点定年方法生成的贝叶斯分子系统发育树及相关文件。数据旨在解决现有研究中松属主要分支分化时间估算的差异，提供更可靠的分化时间参考，支持松属多样化过程与地质或气候事件关联分析。 文件详解 系统发育树文件（.tre格式，共11个）...
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DRYAD_Iberian_chiffchaff越冬地种群进化研究数据
数据集概述 本数据集为伊比利亚柳莺（Phylloscopus ibericus）的研究数据，通过同位素和遗传分析方法，探究其越冬地、种群规模及进化历史。数据源于对该隐存种的分子鉴定、氢同位素比值对比及系统发育重建，为理解其生态与进化提供支持，包含一个文件。 文件详解 文件名称：JAV_02559_DRYAD.xlsx 文件格式：XLSX...
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陈广吉_自适应扩增ERVK单体LTRs与雀形目物种形成关联研究数据代码
数据集概述 本数据集包含论文“Adaptive expansion of ERVK solo-LTRs is associated with Passeriformes speciation events”所用的全部数据与代码，以压缩包形式存储，用于研究ERVK solo-...
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Euparkerella_Based_蛙类遗传多样性与物种界定研究数据
数据集概述 本数据集围绕巴西大西洋森林特有Euparkerella属蛙类展开，通过线粒体与核基因序列分析其系统发育关系，结合物种界定方法揭示隐存遗传多样性。数据覆盖39个个体，识别出6个地理连贯的进化单元，为该属物种多样性低估问题提供证据。 文件详解 文件名称：Fusinatto et...
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Anopheles_Genus_Based_按蚊属分化与新热带支系数据集
数据集概述 本数据集围绕按蚊属的系统发育关系与分化时间展开，包含COI、COII和5.8S rRNA基因的综合数据。通过最大似然法和贝叶斯推断，分析了按蚊属七个亚属中的六个，揭示新热带支系（Stethomyia、Kerteszia、Nyssorhynchus）的单系性及其在晚白垩纪的分化时间。数据集包含3个文件，用于支持按蚊属进化研究。 文件详解...
