-
Kakusan4_Aminosan_Based_分子系统发育模型选择程序数据
数据集概述 本数据集包含Kakusan4和Aminosan两个程序的样本文件,用于多基因座序列数据的分子系统发育分析。这两个程序支持基于信息准则选择非分区、比例和单独模型,可处理DNA及氨基酸序列,提供图形界面与命令行接口,并生成主流系统发育软件的模型配置文件。 文件详解 文件名称:Sample_Aminosan.zip 文件格式:ZIP...
-
Candida_albicans_CDR1_白色念珠菌多药耐药ABC转运蛋白序列数据
数据集概述 本数据集包含白色念珠菌(Candida albicans)多药耐药ABC转运蛋白CDR1的序列数据,涉及DNA和氨基酸序列两类文件,可用于生物信息学相关的基因结构、进化分析等研究。 文件详解 文件名称:combined_CaCDR1_aa_FINAL(2).fasta 文件格式:FASTA...
-
Aspergillus_leporis_麦角生物碱生物合成卫星基因簇研究数据2023
数据集概述 本数据集支持对Aspergillus leporis麦角生物碱生产的研究,包含该真菌的麦角生物碱生物合成基因簇分析、easD敲除实验数据,以及rugulovasine相关基因的系统发育分析序列。数据涉及真菌代谢产物检测、基因功能验证及异源表达实验结果,共包含3个文件。 文件详解 文件名称:README.md 文件格式:MD...
-
PoAstVs_GenBank_Based_东非小型猪场猪星状病毒基因组分析补充数据
数据集概述 本数据集为东非小型猪场猪星状病毒研究的补充材料,包含5个表格,记录猪星状病毒全基因组及衣壳蛋白(ORF2)的核苷酸、氨基酸序列比对结果、进化分歧估计和潜在抗原表位预测,用于揭示东非流行的新型遗传多样性基因型,支持病毒基因组学研究。 文件详解...
-
BeyondDrosophila_Based裂殖蝇类系统发育转录组学全基因氨基酸序列数据集
数据集概述 本数据集包含裂殖蝇类(含果蝇、家蝇等55000种)系统发育转录组学研究的全基因氨基酸序列数据,涉及70个物种的3145个基因。数据用于解析裂殖蝇类快速辐射的系统发育关系,为理解其农业、医学及法医学重要性物种的多样性形成机制提供支持,共含13个相关文件。 文件详解 文档文件...
-
Arcadia_Science_人类疾病相关重复序列扩增跨物种分布研究数据_Version3
数据集概述 本数据集为Arcadia Science相关研究的配套数据,聚焦人类疾病相关重复序列扩增在不同生物中的分布情况,包含考拉种群测序的重复序列计数结果、与人类重复扩增蛋白同源的序列/结构相似性比对结果、相关氨基酸序列文件及分类学分析表格等,共15个文件,支持跨物种重复序列扩增的生物信息学研究。 文件详解 考拉重复序列分析文件...
-
ICTV_VMR_Based双生病毒CP与Rep氨基酸比对及系统发育分析完整数据
数据集概述 本数据集包含ICTV批准的双生病毒RefSeq物种样本的外壳蛋白(CP)、修剪后的复制相关蛋白(Rep)氨基酸序列比对结果、系统发育分析文件及关联元数据,共涉及432个符合纳入标准的物种样本,为双生病毒的分类与进化研究提供结构化数据支持。 文件详解 文件名称:Begomovirus-ICTV-approved-species-...
-
iOBPdb_Archival_昆虫气味结合蛋白与挥发性有机化合物结合亲和力数据集
数据集概述 本数据集是iOBPdb初始版本的存档数据,记录昆虫气味结合蛋白(OBP)对挥发性有机化合物(VOC)的结合亲和力信息。包含91种昆虫的382个独特OBP、622种VOC目标及181项功能研究数据,通过结构化文件整合相关生物信息与实验结果。 文件详解...
-
Molecular_evolution_Based_神经嵴调控网络分子进化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦硬骨鱼类神经嵴调控网络(NC GRN)的分子进化研究,包含36个基因在16种硬骨鱼类中的分子分化模式分析数据。研究通过dN/dS比率分析揭示不同发育阶段基因的选择压力差异,支持发育沙漏模型;通过序列特征聚类验证网络基因的极端保守性,为理解脊椎动物形态多样性的分子机制提供数据支撑。 文件详解 文件名称:Alignments.zip...
-
Eriophyoidea_Based_植食性瘿螨类高级系统发育与线粒体基因组研究数据
数据集概述 本数据集围绕植食性瘿螨类(Eriophyoidea)的高级系统发育研究展开,包含153种瘿螨的完整线粒体基因组测序结果,涉及54种线粒体基因重排模式。数据支持瘿螨类整体及内部6个分支的单系性,结合分子定年揭示其起源于三叠纪、白垩纪多样化的特征,与被子植物演化相关。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
-
Neodiprion_lecontei_Based松食叶蜂环境响应基因家族进化研究数据集
数据集概述 本数据集为松食叶蜂(Neodiprion lecontei)环境响应基因家族进化研究的配套数据,包含手动注释的基因序列、多物种比对文件及附录表格,覆盖嗅觉受体、味觉受体、细胞色素P450等5类基因家族,支持基因进化规律及适应性遗传变化的分析验证。 文件详解 说明文档 文件名称:README.md 文件格式:MD...
-
Holotrichia_parallela_Based暗黑鳃金龟代谢通路与嗅觉基因原始数据
数据集概述 本数据集为暗黑鳃金龟触角转录组分析的原始数据,包含KEGG通路富集分析注释的代谢与信号通路、FuncTree软件可视化的功能潜力,以及OBPs、CSPs等嗅觉候选基因的鉴定结果,还涉及系统发育分析、热图与qRT-PCR实验相关数据,共5个文件。 文件详解 文件1:Amino acid and nucleotide sequences of...
-
Coelopa_frigida_Based海藻蝇表皮碳氢化合物遗传分化与表型可塑性研究数据
数据集概述 本数据集来自海藻蝇(Coelopa frigida)表皮碳氢化合物(CHCs)的研究,包含其表型与遗传变异相关数据。CHCs是昆虫与环境的边界物质,可作为物种、配偶识别信号,本研究分析其受遗传(性别、种群)和环境(幼虫饮食)因素的影响,并结合全基因组重测序数据探究遗传基础,共含五个文件。 文件详解...
-
Jones_2021_AEM_Based_三种产麦角酸酰胺曲霉化学分析及酶系统发育分析序列数据
数据集概述 本数据集包含三种产麦角酸酰胺曲霉(A. leporis、A. homomorphus、A. hancockii)的化学分析数据,以及相关酶的系统发育分析序列。数据记录了曲霉产生的麦角酸衍生物(主要为麦角酸α-羟乙基酰胺)的化学特征,同时提供了参与麦角酸合成的酶的氨基酸序列,支持真菌代谢途径及系统发育研究。 文件详解...
-
Arcobacter_butzleri_Genomic_Diversity_Analysis_Data
数据集概述 本数据集包含对49株Arcobacter butzleri基因组的分析结果,涵盖基因组组装与注释、核心及泛基因组位点数据。数据支持研究该新兴人类病原体的毒力、抗生素耐药性可塑性及基因组多样性,包含组装序列、转录本序列、氨基酸序列、核心基因座比对、特定基因比对、PorA高变区分类序列及泛基因组等位基因谱矩阵等8个文件。 文件详解...
-
PaschalOConnorData_EmmaTeelingSupervisor_爱尔兰蝙蝠食性研究数据
数据集概述 本数据集围绕爱尔兰蝙蝠的食性展开,包含两种格式的文件,分别为Excel表格和FASTA序列文件,总计2个文件。数据未进行训练测试、数据标签或原始处理的拆分,可用于爱尔兰蝙蝠食性相关的生物研究分析。 文件详解 PaschalOConnorData_EmmaTeelingSupervisor.xlsx 文件格式:XLSX...
-
Eimeria_Mitochondrial_Based澳大利亚鸡艾美耳球虫线粒体基因组物种多样性研究数据
数据集概述 本数据集包含澳大利亚鸡艾美耳球虫的25个完整线粒体基因组数据,涉及该国已知的10个物种(含OTU-X、-Y、-Z)。数据支持艾美耳球虫物种的遗传多样性分析及系统发育研究,显示澳大利亚菌株遗传多样性较低,为疫苗有效性评估提供依据。 文件详解 README文档...
-
Development_validation_high_throughput_非模式物种序列标记设计与分析数据
数据集概述 本数据集围绕非模式物种序列标记的开发、验证及高通量分析展开,提供了适用于无参考基因组物种的遗传标记设计框架相关数据,包含标记序列、基因型数据、生物信息学脚本及参考序列等,可支持群体遗传学、系统发育学研究中标记的应用与分析。 文件详解 VCF_files.tar 文件格式:TAR(压缩包)...
-
拟步甲科_Staphylinidae_中Creophilus属和Platydracus属线粒体基因组的系统发育分析数据
数据集概述 本数据集包含鞘翅目隐翅虫科Creophilus属和Platydracus属的首个线粒体基因组相关的系统发育分析数据,涵盖修剪后的矩阵、分区文件、扩展共识树及补充表格,用于支持该类群的系统发育关系研究。 文件详解 数据集压缩包(Datasets.zip)...
-
加勒比胎生石龙子Spondylurus_nitidus与S_culebrae染色体水平参考基因组数据集
数据集概述 本数据集为加勒比胎生石龙子Spondylurus nitidus和S. culebrae的高质量染色体水平参考基因组组装结果,包含基因序列、注释信息、统计文件等,支撑对这两种石龙子基因组结构与功能的研究。 文件详解 基因序列文件:...



