数据集 - 海数据

数据集概述本数据集为鲟鱼保护基因组学研究的SNP标记数据，通过RAD测序技术对四种鲟鱼（Adriatic、Russian、Persian、Siberian）进行SNP标记发现与验证，包含候选SNP标记信息及相关说明文档，共2个文件，用于鲟鱼物种、种群及个体水平的遗传鉴定与保护管理。文件详解...

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马加迪湖罗非鱼的酒精耐受性与生态形态差异研究数据集_我是分割线

数据集概述本数据集聚焦东非Magadi湖及Little Magadi湖极端环境（高温、高碱、高盐）中的Alcolapia属罗非鱼，通过RAD-seq基因组学、几何形态测量学、稳定同位素分析及种群动态模拟，探究其生态形态分化与适应性进化。数据覆盖种群基因组差异、形态特征、食性生态及种群历史，为研究小型鱼类辐射演化提供模型系统支撑。文件详解...

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RAD_seq_Based_海扇贝遗传多样性与种群结构研究数据

数据集概述本数据集基于RAD-seq技术对北美东部12个地点的245只海扇贝（Placopecten magellanicus）进行分析，包含7163个单核苷酸多态性位点（SNPs）数据，其中112个为潜在受选择的异常位点。数据揭示了海扇贝种群的南北遗传分化、等位基因频率的纬度梯度及有限的扩散能力，为渔业资源管理提供科学依据。文件详解...

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Genome_Based北太平洋虎鲸生态型基因组SNP分析数据

数据集概述本数据集包含北太平洋三种部分同域分布虎鲸生态型的全基因组单核苷酸多态性（SNP）数据，用于研究其复杂的祖先起源。数据通过多位点溯祖树、混合图重建及f4统计等方法分析，揭示生态型间的进化关系、祖先混合事件及不完全谱系分选现象，总计包含十四份文件。文件详解 XML文件（5个）...

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Impatiens_Based植物大小层级位置遗传变异研究数据

数据集概述本数据集围绕一年生植物Impatiens capensis（凤仙花）自然种群展开，通过对种群大小分布中不同位置个体的基因分型，探究植物大小层级位置的遗传变异情况。研究发现，考虑种群结构后，未检测到大小层级位置存在显著遗传变异，提示植物适合度进化速率可能受限于现有遗传变异水平。文件详解基因分型文件（.vcf格式）...

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Dryad_Based_里奥格兰德流域特有鲤科鱼类遗传评估数据

数据集概述本数据集针对美国西南部及墨西哥里奥格兰德流域受栖息地改变影响的两种特有鲤科鱼类——里奥格兰德闪鳞鱼（Notropis jemezanus）和斑点银汉鱼（Macrhybopsis aestivalis）开展遗传评估，分析其种群遗传变异、遗传独特性及潜在局部适应性，为物种保护提供遗传学依据。文件详解 Final.Nj.mac.hap.vcf...

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Ecology_Based竹节虫颜色表型适合度遗传互作研究数据

数据集概述本数据集基于竹节虫野外实验，聚焦颜色表型的基因型-表型-适合度图谱构建，探究生态选择如何塑造上位性遗传互作。包含颜色性状的遗传基础、适合度关联及不同宿主植物处理下的选择动态数据，为理解自然中遗传互作的进化机制提供支撑。文件详解代码文件（.r格式，共18个）...

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黄莺杂交区基因组及羽毛变异研究_以巴尔的摩与布洛克黄莺杂交区为例

数据集概述本数据集聚焦巴尔的摩拟鹂与布洛克拟鹂杂交区，通过简化基因组测序获取297只拟鹂的3067个遗传标记，结合羽色表型数据，分析杂交与基因渐渗模式、表型与基因型的关联性，以及杂交区的时空动态，为鸟类物种分化机制研究提供支持。文件详解 Modern_Oriole_Phenotypes.xlsx 文件格式：XLSX...

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Genetic_basis_针叶树高纬度林线干旱胁迫生长反应数据

数据集概述本数据集包含广泛分布针叶树在高纬度林线过渡带干旱胁迫下生长反应的遗传基础研究相关数据，涵盖原始及过滤的SNP数据、树木年轮原始数据，以及用于SNP过滤、表型数据处理和基因型-表型关联分析的R脚本，共十一个文件。文件详解代码文件（.r格式，共6个）文件名称：Genesis_multiple...

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GrayWolf_Based_环境驱动的灰狼功能基因变异研究数据

数据集概述本数据集基于灰狼6个生态型的候选基因筛选结果，设计靶向捕获阵列对1040个候选基因（含外显子及侧翼区域）和5000个非基因中性区域进行重测序，覆盖107只灰狼样本。通过选择测试揭示候选基因与非候选区域的变异模式，识别与局部适应相关的潜在功能变异，验证全基因组SNP扫描标记功能基因的有效性。文件详解环境数据文件...

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Quercus_aquifolioides_气候适应性基因研究数据

数据集概述本数据集为川滇高山栎气候适应性研究相关数据，涵盖60个种群587个个体的干旱胁迫候选基因测序结果，包含381个SNP位点与8个微卫星标记的遗传信息，支持分析该物种不同谱系（西藏、横断山-川西高原）的遗传多样性、适应性位点及未来气候适应风险。文件详解文件名称：SSR_All.xlsx 文件格式：XLSX...

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Crepidula_Based_海洋腹足类遗传分化与多样性研究数据

数据集概述本数据集通过基因分型测序技术，分析海洋腹足类Crepidula属中两种不同扩散模式物种（C. convexa和C. fornicata）的核心与边缘种群遗传变异。包含遗传分化、多样性指标及采样坐标等数据，共12个文件，用于验证边缘种群遗传多样性降低的理论预测。文件详解文档类文件...

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Caribbean_Based_加勒比红树林繁殖体扩散差异研究数据

数据集概述本数据集围绕加勒比地区两种红树林（白红树Laguncularia racemosa与红树Rhizophora mangle）的繁殖体扩散差异展开，包含叶绿体基因组、核标记序列、海洋洋流数据及补充文档，用于研究海漂适应性陆生植物的遗传变异地理分布机制，涉及基因流、洋流影响等关键问题。文件详解基因组序列文件（.fasta格式）...

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HGT_Salmonella_肉鸡沙门氏菌AR水平基因转移实验数据

数据集概述本数据集围绕肉鸡感染海德堡沙门氏菌后，水平基因转移（HGT）作为抗生素耐药性（AR）主要驱动因素的研究展开，包含实验相关的元数据、基因测序变异文件及分析脚本，共75个文件，用于验证无抗生素饲养下AR的转移情况及机制。文件详解变异数据文件（.vcf格式，73个）文件名称示例：OG10-05B.vcf、SB-PL2-05C.vcf等...

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RAD_seq_Based_南极企鹅种群基因组比较与扩散机制研究数据

数据集概述本数据集为南极企鹅种群基因组比较研究数据，基于RAD-seq技术获取5种企鹅（帝企鹅、王企鹅、阿德利企鹅、帽带企鹅、巴布亚企鹅）的全基因组数据，用于分析繁殖群体间的连通性模式，探究影响物种扩散的内在与外在屏障，揭示海洋生态位及海洋学因素对基因流的作用。文件详解基因组变异数据文件（.vcf格式）文件名称：Gentoos_all-...

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Sebastes_diaconus_石鱼耳石形态与基因组变异研究数据

数据集概述本数据集围绕东北太平洋石鱼（Sebastes diaconus）的种内变异展开，包含其基因组变异与耳石形态数据。研究覆盖俄勒冈海岸近岸与离岸共3个采样点，分析了15000余个中性基因座的遗传差异及耳石形态的性二态性，为理解该物种种群结构及管理提供基础数据。文件详解基因组数据文件 VCF格式文件（5个）：包括deacon-three-...

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ebola_Based_塞拉利昂埃博拉病毒感染病例评估数据集v1_2

数据集概述本数据集记录了2014年5月25日至6月18日期间，塞拉利昂Kenema Government Hospital评估的213例埃博拉病毒感染病例信息，数据版本为v1.2，支持对埃博拉临床特征及预后的研究。文件详解文件名称：ebola-1.2.zip 文件格式：ZIP...

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Chorthippus_Based_蚱蜢种群基因组扫描表型分化研究数据

数据集概述本数据集为Chorthippus属蚱蜢的种群基因组扫描数据，包含三种蚱蜢（Chorthippus biguttulus、C. mollis、C. brunneus）的基因组变异信息。通过RNA-seq技术分析物种间功能变异，识别受选择位点及相关基因，涉及鸣叫、听觉、食性偏好等表型分化相关基因，共14个文件。文件详解...

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Dryad_Horornis_斐济灌木莺基因流与岛屿生物地理学研究数据

数据集概述本数据集为论文配套的数据，基于斐济灌木莺（Horornis ruficapilla）的基因组数据，研究岛屿大小和距离对基因流的影响，验证岛屿生物地理学理论在基因组层面的适用性。包含基因序列、变异数据、分析配置及结果表格等8个文件，支持相关假设检验与后续研究。文件详解文档文件文件名称：README.txt 文件格式：TXT...

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Pasteuria_Daphnia_Based宿主基因组进化研究数据