找到518个数据集

标签: FASTA

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  • 鳉科鱼类系统基因组学分析数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 该数据集包含基于RNA测序数据的鳉科(Fundulidae)系统基因组学分析数据,涵盖十六种内群鳉科鱼类及参考外群的152个基因的组装、拼接与比对序列,支持系统发育关系研究。 文件详解 核心分析文件:...
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  • Lymexyloidea与Mordelloidea系统基因组学数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集为Lymexyloidea与Mordelloidea(鞘翅目:多食亚目:扁甲总科)系统基因组学研究的支撑数据,包含甲虫转录组与基因组的蛋白质序列比对文件、序列裁剪结果及系统发育树分析结果,用于相关研究论文的结果计算。 文件详解 该数据集包含12个文件,分布在2个目录中,具体说明如下: - 主目录文件: -...
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  • 冠状病毒重塑成熟人类转运RNA组以促进感染数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集围绕人类冠状病毒重塑宿主成熟转运RNA组(tRNAome)的机制展开,包含7种冠状病毒的密码子使用分析、宿主tRNA组定量数据及氨基酸剥夺/酶敲低实验结果,揭示不同冠状病毒对宿主tRNA组的调控模式差异,为病毒-宿主相互作用研究提供支撑。 文件详解 该数据集按研究图表分类存储,核心文件说明如下: -...
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  • 抗体工作表与FASTA文件数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集包含抗体实验相关的工作表文件和蛋白质组数据搜索用的FASTA文件,涵盖实验背景信息、孔板布局、荧光染色曝光时间、抗体列表及蛋白质组序列数据,为抗体实验与蛋白质组分析提供支持。 文件详解 文件名称:Document S1_Antibody worksheet.xlsm 文件格式:XLSM (.xlsm)...
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  • 恒河猴热量限制肝脏反应分子谱数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集包含恒河猴在热量限制(CR)条件下肝脏反应的分子谱数据,基于威斯康星大学麦迪逊分校1989年启动的研究中雄性恒河猴的肝脏活检样本,涵盖RNA-Seq、脂质组学、代谢组学等多组学数据,用于分析短期CR的纵向分子变化。 文件详解 该数据集包含4个文件,具体说明如下: - 数据文件(.xlsx格式): -...
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  • 本科生物化学实验课程数据集_串联质谱与X_Tandem分析

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集专为本科生物化学实验课程设计,聚焦串联质谱技术及在Google Colab平台运行X!Tandem分析工具的教学应用。包含样本MS/MS数据及运行X!Tandem所需的配置文件,为学生实践提供完整数据支持。 文件详解 文件目录: Dataset for an undergraduate biochemistry laboratory...
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  • 热带鲨鱼多样性环境DNA序列数据集2017

    2025年11月27日   

    数据集概述 该数据集为2017年研究中使用的热带鲨鱼多样性环境DNA(eDNA)序列数据,包含经质量过滤、双端比对和长度筛选后的唯一序列,未经过聚类或分类学分配,记录了样本读取丰度、总读取数和序列长度等信息。 文件详解 文件名称: SHAK.new.fasta 文件格式: FASTA(.fasta) 内容说明:...
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  • 猪带绦虫遗传分析数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集包含用于猪带绦虫遗传分析的相关数据,支持题为《日本猪带绦虫的系统发育特征:对其神秘进化史的启示》的研究。数据涵盖基因序列、系统发育分析文件、图表及补充表格等,为猪带绦虫的进化与遗传研究提供基础资料。 文件详解 该数据集按研究图表和内容分类组织,具体文件说明如下: - 基因序列文件(.fasta格式): -...
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  • 土壤线虫OTU序列及代表性OTU序列数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 该数据集包含通过MiSeq焦磷酸测序法从日光温室土壤线虫总DNA样本中获取的土壤线虫18S rDNA序列,以及对应的代表性OTU序列,为土壤线虫群落结构研究提供分子数据支持。 文件详解 文件名称: Soil nematode OTUs sequences.fasta 文件格式: FASTA (.fasta) 内容说明:...
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  • 马来西亚黄带燕弄蝶线粒体基因组完整数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集包含马来西亚黄带燕弄蝶(Hasora schoenherr)的完整线粒体基因组序列,通过二代测序技术获得,总长15353bp,涵盖13个蛋白编码基因、22个转运RNA、2个核糖体RNA及1个控制区,已在GenBank注册(登录号PQ149492)。 文件详解 文件名称:Complete mitogenome of Hasora...
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  • 萨拉托加温泉数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 该数据集是Lollar等人研究的支持数据,围绕萨拉托加温泉的地质微生物学展开,包含原始测序数据、处理后的OTU表、分类学信息、多样性分析结果、元数据及分析代码等,为温泉环境微生物群落研究提供全面数据支持。 文件详解 该数据集包含多个目录和文件,具体说明如下: - 根目录文件: - Data...
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  • 金毛蕨_Mandaianum品种完整转录组测序注释数据

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集为蕨类植物金毛蕨(Phlebodium aureum)'Mandaianum'品种的转录组测序数据。通过对蕨类叶片进行总RNA提取,使用Illumina HiSeq...
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  • af2rave_基于物理采样的蛋白质集合生成数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集是“af2rave: 基于物理采样的蛋白质集合生成”项目的代码与数据集合,包含针对ADK、DDR1、RBD三种蛋白质的AlphaFold预测结构、晶体结构、分析脚本及模型文件,以PDB格式为主,为蛋白质结构动态研究提供数据支持。 文件详解 该数据集按蛋白质类型分类存储,具体说明如下: -...
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  • 美国太浩湖信号小龙虾携带多种丝囊霉属物种数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 本数据集围绕美国太浩湖的信号小龙虾(Pacifastacus leniusculus)展开,记录其携带的多种丝囊霉属(Aphanomyces)物种信息,包括分离菌株的基因序列、来源及相关实验数据,为研究小龙虾与病原真菌的共生关系提供支持。 文件详解 文件名称: LakeTahoeAphanomyces060219JM.txt 文件格式:...
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  • 植物胁迫响应中miRNA_lncRNA互作预测及调控作用识别数据集

    2025年11月27日   

    数据集概述 该数据集围绕植物胁迫响应中的miRNA-lncRNA互作预测及调控作用识别展开,包含用于在线工具分析、网络构建和模型预测的多类型数据,为研究非编码RNA在植物抗逆中的调控机制提供数据支持。 文件详解 文件名称: dataset.rar 文件格式: RAR(压缩文件) 内容说明: 压缩包内包含多种格式数据,具体如下:...
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  • NGS数据_膜型丝氨酸蛋白酶底物库

    2025年11月26日   

    数据集概述 该数据集为膜型丝氨酸蛋白酶(matriptase)底物库的下一代测序(NGS)数据,包含原始及注释序列(含Sort1至Sort4筛选轮次)、聚类变体等。数据揭示高效切割序列的富集情况,用于指导后续动力学及前药激活实验,支持蛋白酶激活前药优化研究。 文件详解 数据集包含十五个FASTA格式文件,均位于NGS data - matriptase...
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  • 粪产碱杆菌D334基因组数据集

    2025年11月26日   

    数据集概述 该数据集包含从红树林沉积物中分离的粪产碱杆菌D334菌株的基因组序列,以及对其四氢嘧啶、PHA等应激反应机制相关基因簇的基因组分析数据,为研究该菌株的环境适应机制提供基础。 文件详解 数据集包含2个文件,具体说明如下: - Alcaligenes faecalis D334 genome/Supporting...
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  • Btana产品相关酵母菌群研究数据集

    2025年11月26日   

    数据集概述 本数据集围绕Btana产品相关酵母菌群研究展开,包含酵母菌群的物种鉴定、表型特征、代谢产物及酶活性相关数据,以多类型文件记录实验与分析结果,为研究该产品酵母菌群结构及功能提供支持。 文件详解 该数据集包含58个文件,主要分布在New folder/目录下,具体说明如下: - 序列文件(.fasta格式,共50个): - 位于New...
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  • 小麦叶片RNA测序与种子引发处理实验数据集2025

    2025年11月26日   

    数据集概述 该数据集包含了未经处理、叶面处理及干旱胁迫下种子引发处理的小麦植株叶片样本的原始RNA测序数据,采用Illumina二代测序方法获取,为研究不同处理对小麦基因表达的影响提供数据支持。 文件详解 目录:Decsi et al., 2025_DIB_article/ 文件列表: Decsi et al....
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  • 麻疹风疹疫苗研究数据集

    2025年11月26日   

    数据集概述 本数据集是与麻疹风疹疫苗研究相关的实验数据集合,包含疫苗研究中的分子建模、对接结果、结构评估、材料信息及正常模式分析等多类数据文件,为麻疹风疹疫苗的研究提供了全面的数据支持。 文件详解 该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 目录:Measles-Rubella Vaccine Research Data/ -...
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