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Dryad_Based_Eumorpha属分子系统发育与幼虫眼斑进化研究数据
数据集概述 本数据集包含Eumorpha属(鳞翅目:天蛾科)的分子系统发育研究数据,涉及23个物种的62个个体,测序了CAD、EF-1α、Wingless和COI四个基因(共3773个碱基对),并分析了幼虫防御性眼斑的进化过程。数据支持系统发育关系构建及眼斑演化模式研究,包含4个相关文件。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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Deimatidae_COI_based_海百合纲基因p距离估算数据_2024
数据集概述 本数据集包含Deimatidae科物种间COI基因的p距离估算结果,数据来自ZooKeys论文的补充材料,支持南海及马里亚纳弧前区域Deimatidae科新物种的分类研究,采用整合分类学方法分析基因序列差异,为海洋生物分类提供分子数据支撑。 文件详解 文件名称:oo_1006164.docx 文件格式:DOCX...
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OGRDB_Based_NOD_ShiLtJ小鼠IGKV种系受体基因参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠NOD/ShiLtJ品系IGKV基因座的种系参考集,包含4个相关文件,覆盖基因序列、元数据及许可说明三类文件类型,为免疫学研究提供标准化的基因参考数据。 文件详解 许可文件 文件名称:licence.txt 文件格式:TXT...
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Asellidae_Database_Based系统发育与地下生物进化研究数据
数据集概述 本数据集是论文“The World Asellidae database and phylogeny: a collaborative backbone resource for comparative studies of subterranean life...
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OGRDB_Source_小鼠A_J品系IGL_V基因胚系参考数据集_CC0许可
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠A/J品系IGL-V基因胚系参考数据,包含未对齐、带空位的FASTA序列文件、JSON数据文件及许可说明文档,共4个文件,支持免疫受体基因相关研究。 文件详解 数据文件 文件名称:J IGLV_rev_2_ungapped.fasta...
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Dryad_SaproPaperDryad2_澳大利亚雨林蜥蜴谱系不一致性研究数据
数据集概述 本数据集为澳大利亚雨林蜥蜴物种复合体(Saproscincus basiliscus与S. lewisi)谱系不一致性研究的相关数据。研究聚焦南部S. basiliscus谱系线粒体基因组高度分化但核基因组分化显著较低的现象,通过多基因座与基于溯祖的近似贝叶斯计算(ABC)方法测试谱系不一致性的成因假说,数据集包含1个压缩文件。 文件详解...
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Zygaenidae_Based_鳞翅目Zygaenidae科系统发育与化石综述数据
数据集概述 本数据集为鳞翅目Zygaenidae科系统发育研究的分析数据,包含用于构建系统发育树的基因序列比对文件、BEAST分析输入文件及化石综述相关内容,支持主要支系年龄估算与化石记录整理,共6个文件,服务于昆虫系统学研究。 文件详解 Zygaeninae.txt 文件格式:TXT...
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Candida_albicans_CDR1_白色念珠菌多药耐药ABC转运蛋白序列数据
数据集概述 本数据集包含白色念珠菌(Candida albicans)多药耐药ABC转运蛋白CDR1的序列数据,涉及DNA和氨基酸序列两类文件,可用于生物信息学相关的基因结构、进化分析等研究。 文件详解 文件名称:combined_CaCDR1_aa_FINAL(2).fasta 文件格式:FASTA...
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Phylogenetic_informativeness_鳍条鱼分子分歧时间系统发育研究数据
数据集概述 本数据集为鳍条鱼(Actinopterygii)分子分歧时间研究的相关数据,包含4个.tre文件和4个.xml文件,共8个文件。数据用于分析系统发育信息对分子分歧时间估计的影响,解决线粒体与核基因序列年龄估计的不一致问题,通过排除饱和数据调和分歧时间估计结果。 文件详解 .tre文件(共4个,文件格式:TRE)...
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Pescadero_Basin_Ostiactis_pearseae海葵兼性化能合成共生研究数据
数据集概述 本数据集围绕加州湾佩斯adero盆地深海热泉中Ostiactis pearseae海葵与化能合成细菌的共生关系展开,包含海葵组织同位素分析、细菌群落分子数据、基因序列及采样记录,揭示刺胞动物首例兼性化能合成共生机制,涉及5个关联文件。 文件详解 文件名称:SUP05_16S_napA_aprA_copy.txt 文件格式:TXT...
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Nedubini_Based_近北极螽斯系统发育研究基因序列与分析文件_原始数据
数据集概述 本数据集为近北极盾背螽斯(“Tettigoniinae”)系统发育研究的相关文件,包含5个基因区域的序列数据及系统发育分析文件。研究通过贝叶斯和似然法分析,明确近北极Nedubini为螽斯科基部分支,为理解螽斯演化及北美残遗类群分布提供数据支持,共含3个文件。 文件详解 Project33rdBEAST_wfossils copy.xml...
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Pseudouroctonus_reddelli_洞穴微避难所系统地理学研究数据
数据集概述 本数据集为北美洞穴蝎子Pseudouroctonus reddelli的系统地理学研究数据,包含线粒体与核DNA序列数据及相关说明文档。通过12个种群的基因序列分析,验证洞穴作为更新世微避难所的假说,支持物种冰期存续及扩散机制研究,共含6个文件。 文件详解 说明文档(Document files)...
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OGRDB_Based_小鼠PWD_PhJ品系IGKV基因种系参考数据集_开放获取
数据集概述 本数据集为小鼠PWD/PhJ品系的IGKV基因种系参考集,发布于开放种系受体数据库(OGRDB)。包含无间隙、有间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可证文件,共4个文件,用于提供该品系免疫球蛋白κ轻链可变区基因的标准化种系参考序列。 文件详解 许可证文件 文件名称:licence.txt 文件格式:TXT...
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OGRDB_Based_小鼠C57BL_6J品系IGKV基因种系参考数据集_发布版
数据集概述 本数据集为小鼠C57BL/6J品系的IGKV基因种系参考集,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)。包含间隙型、无间隙型FASTA序列文件、JSON元数据文件及许可证文件,共计4个文件,覆盖基因序列和参考信息,用于生物医学领域的基因序列研究。 文件详解 licence.txt 文件格式:TXT...
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ZooKeys_Serichlamys_Based基因序列邻接距离矩阵数据2025
数据集概述 本数据集为Serichlamys属(食蚜蝇科)标本COI基因序列的邻接距离矩阵,是2025年发表于ZooKeys的Neotropical地区Serichlamys属物种修订研究的补充材料,用于支撑该属物种的分子分类学分析,仅包含一个文件。 文件详解 文件名称:oo_1359661.xlsx 文件格式:XLSX...
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GC_content_Mutational_Decay_人类蛋白编码基因5_端研究数据
数据集概述 本数据集围绕人类蛋白编码基因5'端GC含量的突变衰减研究展开,包含20个Excel文件,覆盖物种GC含量、核苷酸含量、重组相关GC含量、单碱基替换率等多维度分析内容,为生物信息学研究提供结构化数据支持。 文件详解 数据文件组(共20个.xlsx文件)...
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Bacidia_fuscoviridis_Based_北美温带地衣科属关系系统发育研究数据
数据集概述 本数据集为论文“Bacidia fuscoviridis, another overlooked sorediate crustose lichen widely distributed in temperate eastern North...
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ZooKeys_补充材料_太平洋Epizoanthus物种系统发育分析补充材料数据2016
数据集概述 本数据集是论文“Unexpected diversity and a new species of Epizoanthus (Anthozoa, Hexacorallia) attached to eunicid worm tubes from the Pacific Ocean”的补充材料1,包含用于COI、mt...
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ZooKeys_补充材料_6_Monacha_cantiana种群系统发育分析基因序列数据
数据集概述 本数据集为论文补充材料6,包含Monacha cantiana(Montagu, 1803)的串联基因序列,具体为H3基因与[(5.8SrDNA)+ITS2+(28SrDNA)]的组合序列,用于NJ/ML-MEGA7/IQ Tree/RAxML/BI等系统发育分析,对应论文图10的研究内容。 文件详解...
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Phyllonorycter_platani_Europe_悬铃木潜叶蛾系统地理格局研究数据
数据集概述 本数据集为欧洲悬铃木潜叶蛾(Phyllonorycter platani)的系统地理格局研究数据,包含284个个体(来自欧洲、亚洲、北美38个种群)的线粒体COI基因(1242bp)和核基因28S rDNA(893bp)序列分析结果,揭示了亚洲与欧洲两个地理分支的遗传差异及杂交区域,支持该物种的冰期避难所与近期扩张假说。 文件详解...



