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Echinoidea_phylogeny_海胆全证据系统发育与年代学研究数据集
数据集概述 本数据集为海胆（Echinoidea）全证据系统发育与年代学研究的补充数据，整合了基因组学与古生物学数据，包含基因本体数据、组合数据集、地层数据集、基因座子采样环境文件、补充图表、补充表格、系统发育比对文件及形态学数据集等8个文件，用于解析海胆类群的系统发育关系与分化时间。 文件详解...
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Demographic_History_Based_种群分化时间串联基因分析数据
数据集概述 本数据集为种群分化时间估算的串联基因分析结果，探讨种群历史对替换率估算的复杂影响，涉及死亡谷鳉鱼（含魔洞鳉鱼）的分化时间与隔离研究，修正了原数百万年隔离的假设，提出魔洞鳉鱼近期定植及种群间基因流频繁的结论。 文件详解 文件名称：analysis.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：包含串联基因分析的相关结果文件，具体内容未提供预览...
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Juglandaceae_Based_全球生物地理综合与优先保护区数据_2019
数据集概述 本数据集为胡桃科（Juglandaceae）全球生物地理综合研究的补充数据，包含该科现存及化石物种的分布信息、系统发育关系、分化时间、系统发育多样性及祖先分布地推断结果，支撑胡桃科分布格局、多样性模式、起源演化及优先保护区的研究，共含1个文件。 文件详解...
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Centrarchidae_Source_鲈科鱼类系统发育与多样化时间尺度研究数据
数据集概述 本数据集聚焦北美淡水鱼类鲈科（Centrarchidae）的系统发育与多样化时间尺度研究，包含16个核基因的DNA序列数据、形态学数据集及化石校准信息，覆盖几乎所有已知及未描述物种，用于解析鲈科鱼类的演化关系与分化时间。 文件详解 基因序列文件（.nex格式，34个）...
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Annelida_Transcriptomics_环节动物门系统发育转录组研究数据
数据集概述 本数据集基于转录组数据构建环节动物门系统发育树，涵盖68750-170497个氨基酸位点、305-622种蛋白质，解析环节动物基部类群（如龙介科、火刺毛虫科等）关系，明确寄生蠕虫类群演化位置，支持环节动物祖先特征重建及早期分化时间推断，包含19个相关文件。 文件详解 转录组数据集文件（Dataset_*.fas）...
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Dryad_Giant_kangaroo_rat_濒危物种种群历史变化与分化研究数据
数据集概述 本数据集为濒危物种巨型更格卢鼠（Dipodomys ingens）的种群遗传学研究数据，包含线粒体DNA测序及核微卫星基因分型结果，用于分析其种群历史变化、遗传分化及元种群结构，为该物种的保护管理提供遗传学依据。 文件详解 文件名称：Statham_Giant_kangaroo_rat_submission_Dryad.xlsx...
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Ranitomeya_imitator_Based_拟态分化与物种形成连续体研究数据
数据集概述 本数据集围绕模仿箭毒蛙（Ranitomeya imitator）的拟态分化与物种形成连续体展开，包含两种拟态过渡带（带状-条纹、斑点-条纹）的表型、基因、行为数据及模型分析文件，覆盖表型分化、遗传差异、配偶选择等维度，为研究物种形成过程提供多层面支撑。 文件详解 拟态表型数据文件 文件名称：banded-striped color-...
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Hawkmoth_Dryad_Based_反蝙蝠超声产生与声纳干扰行为及系统发育数据
数据集概述 本数据集聚焦天蛾与蝙蝠的协同进化关系，包含124种天蛾对蝙蝠声纳攻击的超声响应行为数据、蝙蝠-天蛾捕食实验结果，以及基于多基因构建的化石校准系统发育树。数据覆盖天蛾超声产生的功能验证（声纳干扰）和进化历史分析，涉及约1500种天蛾的防御策略起源与分化时间研究。 文件详解 系统发育树文件...
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Phlorest_Based_Pama_Nyungan语言系统发育分析数据集2012
数据集概述 本数据集为基于Bowern & Atkinson 2012年研究的Phlorest系统发育树数据，核心内容是Pama-Nyungan语言的内部结构计算系统发育分析结果，用于支持语言演化和分类研究，数据集包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称：phlorest/bowern_and_atkinson2012-v1.1.zip...
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Malagasy_dung_beetles_Based_竞争释放与物种形成研究数据集
数据集概述 本数据集围绕马达加斯加蜣螂（Nanos和Apotolamprus属）的竞争释放、分布扩张与物种形成展开，整合了系统发育树、基因序列、地理分布、丰度及体型数据，用于验证竞争释放促进物种分化的假说，为理解岛屿生物多样性形成机制提供支持。 文件详解 系统发育树文件（.nex格式，共7个）...
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Zopheridae_Coleoptera_新西兰渐新世淹没事件甲虫谱系存活研究数据
数据集概述 本数据集围绕新西兰渐新世淹没事件对拟步甲科（Zopheridae）甲虫的影响展开，包含用于分析该甲虫谱系存活情况的系统发育树与相关元数据文件。通过化石校准的系统发育方法，探究渐新世淹没事件是否导致该类群的种群瓶颈与大规模灭绝，以及其谱系的演化历史。 文件详解 Appendix_S2.tre 文件格式：.tre（系统发育树文件）...
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Heredity_Population_divergence_种群分化与混合模型ABC方法遗传数据
数据集概述 本数据集包含论文所用的遗传数据分析文件，聚焦种群分化与混合模型选择。通过近似贝叶斯计算（ABC）方法，分析微卫星数据以区分种群分化（无混合）与混合模型，验证了20个位点数据可高准确率识别生成模型，并应用于伊比利亚淡水鱼类种群遗传模式研究。 文件详解...
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PopulusAngustifolia_Based窄叶杨地理气候种群历史研究数据
数据集概述 本数据集围绕窄叶杨（Populus angustifolia）种群历史展开，通过363个个体的多位点多态性分析（覆盖1800公里纬度范围），探究地理屏障和气候时空变化对其种群遗传结构的影响，包含SSR（简单序列重复）数据，用于支持相关遗传学研究。 文件详解 文件名称：PopulusAngustifoliaSSR.xlsx 文件格式：XLSX...
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Parasitic_plants_Based_寄生植物三基因组分子进化速率研究数据
数据集概述 本数据集为寄生植物分子进化速率研究的补充数据，包含12个被子植物寄生生活方式独立起源类群的线粒体、核和叶绿体三基因组DNA序列分析结果，验证寄生植物分子进化速率普遍高于非寄生亲缘类群的结论，支持相关进化机制探讨。 文件详解 README_for_Comparisons.txt 文件格式：TXT...
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Salmo_salar_Based_大西洋鲑鱼西北欧避难所与殖民路线分子标记研究数据
数据集概述 本数据集基于大西洋鲑鱼的分子标记研究，通过核微卫星和线粒体DNA分析，揭示其在西北欧的冰期避难所（包括伊比利亚半岛及法国西北部隐避难所）及冰后期殖民路线，涉及英国、爱尔兰等区域的种群遗传结构，核心数据存储于单一Excel文件中。 文件详解 文件名称：MICROS_&_RFLPFINAL2new copy.xlsx 文件格式：XLSX...
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Dasyurid_Species_Geography_袋鼬科有袋类物种形成地理研究数据
数据集概述 本数据集围绕袋鼬科（Dasyuridae）有袋类物种形成的地理机制展开，覆盖澳大利亚、新几内亚及周边岛屿的67个物种，通过地理分布重叠分析、系统发育重建、形态学特征测量等方法，探究竞争与分化时间对物种形态差异及地理分布重叠的影响，旨在验证区域尺度异域物种形成及局域尺度同域特征置换的假说。 文件详解...
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Virentes_based_美洲冬青栎基因组与种群遗传学系统发育及生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集围绕美洲冬青栎（Quercus subsection Virentes）展开，包含基因组与种群遗传学分析相关数据，用于探究该类群的系统发育关系、分化时间、基因流模式及生态位分化机制，覆盖遗传多样性、形态功能性状及气候生态位等维度。 文件详解 CSV格式文件（共5个）...
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Neonympha_mitchellii_mitchellii_保护遗传学研究分析数据
数据集概述 本数据集为Mitchell's satyr蝴蝶（Neonympha mitchellii mitchellii）的保护遗传学研究数据，包含48个个体（来自5个种群）的6种分子标记（5个核基因、1个线粒体基因）相关文件，支持系统发育、聚类及溯祖分析，用于明确亚种分类关系及保护策略制定，共23个文件。 文件详解 分子标记数据文件（.nex格式）...
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Populus_Speciation_更新世气候振荡触发的胡杨与灰叶胡杨物种形成研究数据
数据集概述 本数据集围绕更新世气候振荡触发的两种沙漠杨树（胡杨与灰叶胡杨）物种形成研究展开，包含60个个体的11个核基因座测序数据、样本分析代码等内容，用于估计物种分化时间、检测基因流及选择信号，揭示更新世气候对种间分化的影响。 文件详解 Populus euphratica sequence.zip 文件格式：ZIP...
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Satler_Carstens2017_Based生态群落跨生物地理屏障单元扩散研究数据
数据集概述 本数据集包含与Sarracenia alata食肉猪笼草相关的五种共生节肢动物的单核苷酸多态性（SNP）数据，用于检验美国东南部主要生物地理屏障密西西比河对生态群落共多样化的影响。数据通过分析种群遗传结构、分化时间等，探究生态关系对共多样化的预测作用，共包含两个压缩文件。 文件详解 脚本文件包...
