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CPR_Genome_Subset_Jaffe_et_al_2020_微生物基因组数据
数据集概述 本数据集为Jaffe et al. 2020论文相关的候选门辐射(CPR)基因组子集,内容为CPR微生物的基因组序列数据,以压缩包形式存储,可用于微生物基因组学研究。 文件详解 压缩包文件 文件名称:jaffe_et_al_cpr_genomes.zip 文件格式:ZIP 字段映射介绍:压缩包内包含与Jaffe et al....
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Squamate_Phylogenomic_Based爬行动物系统发育基因组学分析数据
数据集概述 本数据集基于4178个核基因座的靶向序列捕获数据,对32种有鳞目爬行动物(蜥蜴和蛇)及5个外类群进行系统发育基因组学分析。通过串联法和物种树方法,明确蛇类在蜥蜴科中的起源位置,解决了鬣蜥类蜥蜴的争议性分类地位。数据集包含6个文件,为研究有鳞目高级分类关系提供强支持的假设。 文件详解 RAxML输入文件(TXT格式)...
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Dryad_Source_Serpula_lacrymans有性多样性分子特征研究数据集
数据集概述 本数据集为四极性担子菌Serpula lacrymans种群有性多样性的分子特征研究数据,包含交配型基因注释、遗传标记开发及欧洲种群交配型多样性分析相关文件,支持对该木材腐朽真菌交配系统、种群遗传结构及传播限制因素的研究。 文件详解 Dryad_readme.txt 文件格式:TXT...
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Eckert_et_al_Based_软松亚属多基因座适应性进化研究数据_archive
数据集概述 本数据集包含11种软松(松属软松亚属)的167个直系同源核基因片段的DNA序列比对数据,用于研究其适应性进化。研究通过分析非同义突变的适应性比例(α)和有害 fitness 效应分布(DFE),发现多数新非同义突变具有强有害性,长期适应性进化证据不足,符合近中性理论预期。数据以压缩包形式提供,含1个文件。 文件详解...
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Holotrichia_parallela_Based暗黑鳃金龟代谢通路与嗅觉基因原始数据
数据集概述 本数据集为暗黑鳃金龟触角转录组分析的原始数据,包含KEGG通路富集分析注释的代谢与信号通路、FuncTree软件可视化的功能潜力,以及OBPs、CSPs等嗅觉候选基因的鉴定结果,还涉及系统发育分析、热图与qRT-PCR实验相关数据,共5个文件。 文件详解 文件1:Amino acid and nucleotide sequences of...
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Coelopa_frigida_Based海藻蝇表皮碳氢化合物遗传分化与表型可塑性研究数据
数据集概述 本数据集来自海藻蝇(Coelopa frigida)表皮碳氢化合物(CHCs)的研究,包含其表型与遗传变异相关数据。CHCs是昆虫与环境的边界物质,可作为物种、配偶识别信号,本研究分析其受遗传(性别、种群)和环境(幼虫饮食)因素的影响,并结合全基因组重测序数据探究遗传基础,共含五个文件。 文件详解...
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Homalothecium_lutescens_SNP_Based苔藓近交远交平衡研究数据
数据集概述 本数据集围绕苔藓植物Homalothecium lutescens的近交与远交平衡研究展开,包含4个文件,记录了4个种群中矮雄、孢子体及雌性宿主枝条的SNP基因型和标记序列信息,用于分析该物种的近亲繁殖机制及远交补偿策略。 文件详解 说明文档类(.txt格式,共3个) 文件名称:README_for_SNP_genotypes.txt...
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黄连_Coptis_chinensis_Franch_连续种植田原核生物和病毒群落组成数据
数据集概述 本数据集聚焦黄连连作田的微生物群落,包含原核生物和病毒的群落组成信息,涵盖OTU(操作分类单元)数据、病毒重叠群信息及对应的核苷酸序列,为研究连作条件下黄连根际微生物生态提供基础数据。 文件详解 文件名称:Prokaryotic OTU information.xlsx 文件格式:XLSX...
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Taraxacum_officinale_Based_无性生殖基因组转座元件动态变化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦无性生殖植物蒲公英(Taraxacum officinale)的转座元件(TE)研究,包含5个TE簇相关的文本文件及1个直方图压缩文件。通过低覆盖度基因组测序、转录组和甲基化分析,揭示无性系内TE的动态变化、转录活性及甲基化差异,为理解无性生殖基因组演化提供数据支持。 文件详解...
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Conoidean_Phylogenetic_Based芋螺总科毒液肽库系统发育整合分析数据
数据集概述 本数据集为芋螺总科毒液肽库与系统发育及生物学框架整合研究的相关数据,包含毒液肽库、基因序列、系统发育树及序列比对等材料,用于分析芋螺总科物种的系统发育关系,识别新属及毒液肽的生物多样性关联特征,为毒液肽的生物医学应用提供数据基础。 文件详解 README.docx:DOCX格式,数据集说明文档,介绍研究背景、数据内容及使用说明...
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Adeno_associated_virus_2_Based美国儿童急性重症肝炎病毒研究数据
数据集概述 本数据集包含论文“Adeno-associated virus type 2 in children from the United States with acute severe...
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紫海胆_Strongylocentrotus_purpuratus_在异常位点数据中的选择信号
数据集概述 本数据集包含紫海胆(Strongylocentrotus purpuratus)的基因序列数据,聚焦其在环境异质景观中适应性基因的选择信号。通过分析5个候选适应基因和2个中性基因,探究高扩散物种的局部适应机制,验证基因变异与温度等环境变量的关联,为理解异质环境下的选择模式提供支持。 文件详解...
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Stenothyra_glabra_mitogenome_tRNA二级结构补充材料数据2020
数据集概述 本数据集为论文Supplementary material 2,内容是Stenothyra glabra线粒体基因组中tRNA的二级结构信息,是Stenothyridae科首个完整线粒体基因组研究的补充资料,支持对该物种线粒体tRNA结构特征的分析。 文件详解 文件名称:oo_473852.docx 文件格式:DOCX...
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Procambarus_clarkii_Based克氏原螯虾光感知相关核苷酸序列研究数据2021
数据集概述 本数据集包含克氏原螯虾(Procambarus clarkii)腹神经索的62条转录本核苷酸序列,通过生物信息学工具识别与视网膜外光感受器光相互作用相关的基因家族,涉及眼和眼外光感知的生物合成途径及光转导级联相关基因。数据已存入GenBank数据库,包含2个补充文件。 文件详解 文件名称:Calderón-...
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Amblyrhynchus_cristatus_加拉帕戈斯海鬣蜥进化历史杂交与物种形成研究数据集
数据集概述 本数据集围绕加拉帕戈斯海鬣蜥(Amblyrhynchus cristatus)的进化历史展开,聚焦杂交与物种形成的相互作用。包含基因组比对、线粒体数据、微卫星标记、形态测量等多类型数据,揭示海鬣蜥的系统发育关系、种群结构及岛屿间杂交现象,为理解物种形成与基因交流的进化机制提供支持。 文件详解 文档类...
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Leafless_epiphytic_orchids_Based_无叶附生兰菌根真菌数据_2021
数据集概述 本数据集包含无叶附生兰的真菌系统发育与群落数据,来自2021年发表于Mycorrhiza期刊的论文。数据涵盖角担菌科真菌的序列矩阵、系统发育树,以及不同样本中菌根真菌OTU的序列丰度与采样信息,共包含4个文件,用于展示无叶附生兰共享的菌根真菌关系。 文件详解 readme.docx 文件格式:DOCX...
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Acari_Phylogeny_Species_Delimitation_农业螨类分子标记原始数据
数据集概述 本数据集包含重要农业螨类物种的3'细胞色素C氧化酶I(COI)基因序列和核糖体内部转录间隔区(ITS)基因序列原始数据,用于支持农业螨类的系统发育分析与物种界定研究,为农业螨类的精准鉴定提供分子依据。 文件详解 文件名称:RawData.xlsx 文件格式:XLSX...
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Phylogenomics_基于Australo_Papuan啮齿动物辐射演化系统基因组学研究数据
数据集概述 本数据集围绕Australo-Papuan鼠科啮齿动物(Hydromyini亚科)的快速辐射演化展开,包含1245个独立基因座的核苷酸序列数据及多种系统基因组推断方法的结果,用于比较串联与溯祖框架下的分支支持度估计,揭示部分节点的系统发育冲突与不确定性。 文件详解 基因与探针设计文件...
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From_feces_to_data_Based_鸟类_昆虫食物网捕食与可利用猎物元条形码分析数据
数据集概述 本数据集通过DNA元条形码技术,分析4种鸟类(大山雀、蓝山雀等)雏鸟粪便中的捕食猎物,及桦树树冠中鳞翅目幼虫粪便(虫粪)的可利用猎物,共鉴定53种猎物物种,其中21%与虫粪样本重合。数据包含实验结果及阈值验证信息,用于研究鸟类-昆虫食物网的营养互作关系。 文件详解 OTU_table.xlsx 文件格式:XLSX...
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Meta_barcoding_Freshwater_Appalachia浮游原生生物普查补充材料数据
数据集概述 本数据集为论文“美国弗吉尼亚州阿巴拉契亚-自然隧道州立公园淡水浮游原生生物元条形码普查”的补充材料4,核心内容是记录实验所用引物与PCR条件的表格2,用于支撑淡水浮游原生生物分子检测实验的可重复性,共包含1个文件。 文件详解 文件名称:oo_234383.xlsx 文件格式:XLSX...



