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快速折叠肽的蒙特卡洛模拟数据集
数据集概述 该数据集包含快速折叠肽的蒙特卡洛模拟实验数据，核心围绕十氨基酸与二十氨基酸肽链从变性构象到平衡构象的折叠过程展开，采用联合原子力场及隐式水模型，通过多种模拟移动方式确定肽链最低能量结构。 文件详解 该数据集包含多个类型的文件，具体说明如下： - 核心模拟数据文件： - 无扩展名文件（149个）：可能为模拟过程中的中间输出或参数配置文件 -...
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BRCA与人类激肽释放酶蛋白互作对接研究数据集
数据集概述 本数据集包含BRCA（野生型及突变型）与人类激肽释放酶蛋白互作的对接实验数据，涵盖受体结构文件、对接结果、结合能统计及相互作用分析等，通过README提供复用指导，为前列腺癌相关蛋白互作机制研究提供支持。 文件详解 该数据集包含多个目录和文件，具体说明如下： - 核心目录: - wildtype_BRCA_docking/:...
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新芽孢杆菌II型SMC_Wadjet复合体结构数据集
数据集概述 本数据集围绕新芽孢杆菌（Neobacillus vireti）的II型SMC Wadjet复合体结构展开，包含其重构模型、AlphaFold预测模型及相关实验图表。旨在揭示该类原核免疫复合物的独特结构特征，为理解Wadjet系统演化及功能提供数据支持。 文件详解 该数据集由多个目录和文件组成，具体说明如下： - 核心结构重构文件（位于...
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肠炎沙门氏菌WbaP结构关联数据集
数据集概述 本数据集包含肠炎沙门氏菌WbaP蛋白的结构关联数据，涵盖XLMS交联数据、CDMS数据、AlphaFold生成的二聚体模型及Foldseek分析结果，为该蛋白结构研究提供多维度数据支持。 文件详解 主目录文件： S_enterica_WbaP_foldseek_afdb-...
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胆固醇与毒蕈碱及阿片受体对接数据集
数据集概述 该数据集包含胆固醇与毒蕈碱受体（M2、M4亚型）及阿片受体（Kappa、Mu、Delta亚型）对接的分子动力学模拟结果，以PDB格式存储受体与胆固醇结合的最优构象文件，共五十个文件。 文件详解 该数据集包含一个目录下的五十个PDB格式文件，具体说明如下： - 目录: Cholesterol docking to muscarinic and...
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胰岛素_受体复合物短分子动力学_11埃片段_氨基酸二聚体数据集
数据集概述 本数据集包含胰岛素-受体复合物的短分子动力学模拟数据、11埃片段结构数据及氨基酸二聚体数据，涉及分子结构、动力学轨迹及氨基酸相互作用对的信息，为研究胰岛素与受体的结合机制提供数据支持。 文件详解 该数据集按目录分类存储，具体说明如下： - Short-MD目录： - minimized.pdb：胰岛素-...
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锌抗病毒蛋白对感染脊椎动物RNA病毒基因组组成的影响数据集
数据集概述 本数据集围绕锌抗病毒蛋白（ZAP）对感染脊椎动物RNA病毒基因组组成的影响展开，包含系统发育分析、蛋白结构、病毒组成等多维度数据，支撑研究ZAP起源进化及与病毒基因组CpG抑制的关联。 文件详解 该数据集包含多个目录及文件，具体说明如下： - 病毒组成数据（Viral composition/ 目录）： -...
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具有人类病原体分子靶点药理干预潜力的肽数据库
数据集概述 本数据集包含针对细菌、病毒、寄生虫和真菌等病原体的抗菌肽数据库，通过PubChem和ChEMBL获取肽的SMILES结构，经OpenBabel转换为一维SMI、三维MOL2和PDB格式，共七百一十八条具有抑制活性的肽，支持病原体分子靶点相关研究。 文件详解 该数据集由多个目录和文件组成，具体说明如下： - 补充资料文件: -...
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淀粉样前体蛋白C99内在无序域跨膜螺旋二聚化与膜外β链形成数据集
数据集概述 本数据集围绕淀粉样前体蛋白C99内在无序域展开，包含其在POPC脂质双分子层及150毫摩尔氯化钠水溶液中的构象数据、GENESIS分子动力学模拟参数，以及稀浓度下核磁共振顺磁探针强度比数据，为研究膜外β链形成对跨膜螺旋二聚化的调控提供支持。 文件详解 该数据集按功能划分为以下目录及文件： - C99单体构象目录（C99 monomer...
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MgtE镁离子通道生物信息学分类与新型亚类稳定化的从头蛋白设计数据集
数据集概述 本数据集围绕MgtE镁离子通道的生物信息学分类及新型亚类稳定化的从头蛋白设计展开，包含实验数值数据、蛋白质结构文件、图像文件等多类型资料，为相关研究提供数据支持。 文件详解 该数据集按研究图表主题分类存储，具体说明如下： - Figure2相关文件（位于Figure2-numeric data for FSEC-Nb mgte目录下）： -...
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白癜风整合遗传学与多组学分析机制及治疗靶点数据集
数据集概述 本数据集包含用于分子对接的蛋白质和小分子化合物结构文件，围绕白癜风的整合遗传学与多组学分析展开，涉及JAK/STAT通路对CTSS的调控机制，为白癜风治疗靶点研究提供结构数据支持。 文件详解 该数据集包含一个目录下的八个文件，具体说明如下： - 目录: Integrative Genetics and Multiomics Analysis...
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Y型沸石吸附密度泛函理论手稿数据集
数据集概述 本数据集包含离子交换Y型沸石吸附硫和芳香族物质的密度泛函理论（DFT）计算相关文件，涵盖NBO7输出文件、分子结构文件及焓值数据，为沸石吸附性能的理论研究提供支持。 文件详解 根目录文件： Enthalpies.xlsx：Excel格式文件，可能包含吸附过程的焓值数据 CeY目录（CeY/）： 包含CeY-BT.pdb、CeY-...
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DNA侧翼增强CreA_ZFD结合数据集
数据集概述 本数据集聚焦DNA 5'侧翼序列对CreA-ZFD结合能力的增强作用，核心发现为侧翼序列可使结合亲和力提升2.8倍。包含质粒构建、蛋白表达纯化、结合实验及结构模型等多类文件，为分子生物学相关研究提供支持。 文件详解 数据集包含16个文件，均位于“DNA flank enhances CreA-ZFD...
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af2rave_基于物理采样的蛋白质集合生成数据集
数据集概述 本数据集是“af2rave: 基于物理采样的蛋白质集合生成”项目的代码与数据集合，包含针对ADK、DDR1、RBD三种蛋白质的AlphaFold预测结构、晶体结构、分析脚本及模型文件，以PDB格式为主，为蛋白质结构动态研究提供数据支持。 文件详解 该数据集按蛋白质类型分类存储，具体说明如下： -...
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挑战性靶点蛋白质结构预测工具比较研究_蛇毒毒素
数据集概述 本数据集收录了针对蛇毒毒素这一挑战性靶点的蛋白质结构预测工具比较研究中使用的所有结构文件。研究评估了AlphaFold2、ColabFold等工具在无参考模板情况下的预测性能，发现AlphaFold2表现最优，ColabFold计算成本更低，所有工具在无序区域预测上存在局限，为相关蛋白质结构研究提供数据支持。 文件详解...
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哺乳动物CatSpers超四级结构的膜内二硫键交联研究模型数据
数据集概述 该数据集包含一个基于膜内二硫键交联研究构建的小鼠CatSper1-4蛋白模型文件，用于阐明哺乳动物CatSpers的超四级结构，模型呈现为两个反向平行且通过CatSper3交联的线性二聚体组成的四聚体，推测其沿精子鞭毛主段延伸形成双排聚合物。 文件详解 文件名称：mcatsper_16.pdb 文件格式：PDB（.pdb）...
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RNA三维结构预测方法比较分析数据集
数据集概述 本数据集为RNA三维结构预测方法比较分析研究的配套数据，聚焦RNA-配体相互作用建模准确性评估。包含六种预测程序（DeepFoldRNA、RhoFold等）的建模结果，部分方法含有无二级结构输入的对比数据，还新增了用于基准测试的Blind Set 1和Blind Set 2数据集，以PDB格式为主存储结构预测结果。 文件详解...
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麻疹风疹疫苗研究数据集
数据集概述 本数据集是与麻疹风疹疫苗研究相关的实验数据集合，包含疫苗研究中的分子建模、对接结果、结构评估、材料信息及正常模式分析等多类数据文件，为麻疹风疹疫苗的研究提供了全面的数据支持。 文件详解 该数据集由多个目录和文件组成，具体说明如下： - 目录：Measles-Rubella Vaccine Research Data/ -...
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AlphaFold与JiNYUAN蛋白质结构预测数据集-aleron751
AlphaFold与JiNYUAN蛋白质结构预测数据集-aleron751 数据来源：互联网公开数据 标签：蛋白质结构预测,AlphaFold,JiNYUAN,PDB,生物信息学,科研,教育,数据科学 数据概述：...
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蛋白质结构与角度数据集AngleandDihedralfortheCHAMPSStructuresDataset-soerendip
蛋白质结构与角度数据集AngleandDihedralfortheCHAMPSStructuresDataset-soerendip 数据来源：互联网公开数据 标签：蛋白质结构，生物信息学，数据集，结构分析，角度计算，分子动力学，化学信息学，生物医学 数据概述：...
