数据集概述
本数据集涵盖真菌NUDIX酶多样性分析的原始数据，包含补充文件（如真菌组装列表、蛋白ID、基序保守性等）和多个文件夹（分子对接结果、结构文件、序列比对、系统发育树），为研究真菌NUDIX酶的多样性与功能提供支持。
文件详解
- 补充文件:
- Supplementary_File_S1.xlsx: Excel格式，包含真菌组装列表、NUDIX框比较及表达数据
- Supplementary_File_S2.docx.pdf: PDF格式，包含各新亚家族关联的蛋白ID列表
- 其他补充文件（S3-S8）: 含NUDIX框基序保守性、亚家族与门的对应关系、转录组数据集及表达数据、NUDIX超家族外结构域列表等
- 压缩文件夹:
- docking_results_pH_8.zip: 存储13个新亚家族代表蛋白的分子对接结果
- docking_structures_pdb_files.zip: 存储所有PDB格式的分子结构文件
- new_subfamilies_aln.zip: 存储13个新亚家族的FASTA格式序列比对文件
- phylogenetic_trees.zip: 存储IqTree2计算的Newick格式系统发育树文件
适用场景
- 分子生物学研究: 分析真菌NUDIX酶的序列多样性与进化关系
- 结构生物学研究: 基于分子对接结果探究NUDIX酶与化合物的相互作用
- 功能基因组学研究: 结合转录组数据解析NUDIX酶的表达模式与功能
- 生物信息学分析: 利用系统发育树与序列比对数据开展进化分析
