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鸟类系统发育基因组数据类型与分类单元采样影响研究数据集
数据集概述 本数据集围绕鸟类系统发育基因组学研究展开,聚焦新鸟亚纲早期分化节点的系统发育树冲突问题,通过构建含90%非编码序列的235种鸟类数据矩阵,对比分析数据类型、分类单元数量及位点数量对系统发育树拓扑结构的影响,揭示数据类型为导致树结构不一致的关键因素。 文件详解 压缩文件(.gz格式):...
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矾根属系统发育基因组冲突数据集
数据集概述 本数据集围绕矾根属(Heuchera)的系统发育基因组冲突展开,整合了核基因、质体和线粒体三类独立基因组数据,通过多种分析策略揭示物种杂交导致的系统发育不一致现象,为植物进化研究提供多维度数据支持。 文件详解 该数据集包含53个文件,涵盖多种格式,具体说明如下: - 附录与统计文件: - Appendix1_Coverage...
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Xiphophorus鱼类系统发育网络与性状进化分析数据集
数据集概述 本数据集围绕剑尾鱼(Xiphophorus)的系统发育网络与性状进化展开,包含系统发育树文件、形态学数据、遗传距离数据及分析代码与报告,支持基于网状进化模型的系统发育比较方法研究,验证杂交等网状事件对性状分布的影响。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,共4个):...
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珊瑚礁驱动物种分化数据集
数据集概述 本数据集围绕珊瑚礁作为物种分化驱动因素展开,包含四种珊瑚礁鱼类科(隆头鱼科、蝴蝶鱼科、雀鲷科、天竺鲷科)的系统发育树及研究附录文档,为分析珊瑚礁与生物多样性热点形成的关系提供数据支持。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式): Chaetodontidae.tre:蝴蝶鱼科的系统发育树数据文件...
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阿根廷北部安第斯山脉十字花科新物种Pennellia_yalaensis数据集
数据集概述 该数据集记录了阿根廷胡胡伊省发现的十字花科新物种Pennellia yalaensis的形态描述、亲缘关系分析及系统发育研究数据。包含基于ITS和trnL-F序列的分子系统发育分析结果,以及区分该新物种与近缘种的形态特征数据,为植物分类学研究提供支持。 文件详解 文档文件: Appendix...
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生态机遇对适应性辐射时间与形态影响数据集
数据集概述 本数据集围绕生态机遇对适应性辐射的影响展开,以慈鲷鱼类为研究对象,分析其系统发育中多样化速率变化的分布、主要分支在系统发育空间的分布,以及生态机遇对这些模式的作用,为理解生物多样性分布不均现象提供数据支持。 文件详解 文件名称: MCC_Cichlidae_phylogeny_treePL_ML.tre,格式: .tre,内容:...
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南美河流慈鲷平行适应性辐射研究数据集
数据集概述 本数据集围绕南美乌拉圭河与巴拉那河的鲈形慈鲷(Crenicichla)展开,记录其独立演化出的裂殖食性、附生生物食性、软体动物食性等生态形态型,以及表型演化爆发与生态位扩张的关联,为河流生态系统中平行适应性辐射研究提供数据支持。 文件详解 文档文件:...
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安第斯山Petroravenia属_十字花科_Thelypodieae族_基于形态学和分子数据的重新评估数据集
数据集概述 本数据集围绕安第斯山十字花科Petroravenia属的分类学重新评估展开,包含基于核基因(ITS)和质体基因(trnL-F、trnH-psbA)的分子系统发育分析数据、形态学比较结果及分类修订信息,为研究该属的系统发育关系、分类地位及濒危物种保护提供支持。 文件详解 分子系统发育数据文件...
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狐猴系统发育与分化时间数据集
数据集概述 本数据集整合形态学与DNA序列数据,通过尖端定年(TD)和化石化生死过程(FBD)模型,推断现生及灭绝狐猴的系统发育关系与分化时间,涉及马达加斯加特有狐猴88%的类群,为灵长类演化历史研究提供支持。 文件详解...
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亚马逊细身安乐蜥性信号变异的进化驱动因素数据集
数据集概述 本数据集围绕亚马逊细身安乐蜥(Anolis fuscoauratus)的性信号(喉扇颜色)变异展开,探究遗传分化、环境梯度及近缘物种共存对其变异的影响,为平行性状进化及信号性状在物种形成中的作用研究提供支持。 文件详解 数据文件(CSV格式):...
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两栖动物生物地理分析数据集
数据集概述 本数据集包含两栖动物生物地理分析的相关数据,基于3309个物种(约占现存多样性的45%)的时间树,重建其在12个全球生态区的迁徙模式,探讨古代大陆 vicariance 和近期海洋扩散对现存物种分布的影响。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 核心数据文件: - amph_shl_dates_trim.tre:...
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鳉形目鱼类系统发育关系锚定杂交富集数据研究数据集
数据集概述 本数据集围绕鳉形目(Cyprinodontoidea)鱼类的系统发育关系展开,通过锚定杂交富集技术获取数据,包含16个科107个类群的遗传信息,涉及序列比对、系统发育树构建及统计分析结果,为该类群进化关系研究提供支持。 文件详解 序列比对与预处理文件:...
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海链藻目海陆生境转换时间推断数据集
数据集概述 该数据集围绕海链藻目(Thalassiosirales)的海陆生境转换时间展开研究,通过贝叶斯松弛分子钟方法分析不同化石校准方案下的演化时间尺度,探讨淡水谱系的起源时间及主要生境殖民事件的发生时期。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,共7个):...
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木槿族_锦葵科_系统发育关系研究比对与树文件数据集
数据集概述 本数据集包含木槿族(锦葵科)系统发育关系研究的基因比对文件与系统发育树文件,基于迄今最全面的分类群采样构建,涉及传统定义的木槿属和孔雀葵属的多系性分析,以及新属的分类修订,为该族植物分类提供关键数据支持。 文件详解 数据集包含5个文件,具体说明如下: - 文件名称:README.md - 文件格式:Markdown(.md) -...
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系统发育分析中分层特征整合数据集
数据集概述 该数据集围绕系统发育分析中分层特征整合展开,包含用于评估新优化标准的合成与实证数据,涉及字符矩阵、字符类型文件及系统发育树文件,支持对比不同处理不适用字符方法的效果。 文件详解 核心数据文件:...
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南非唐菖蒲传粉驱动分化研究数据集
数据集概述 本数据集围绕南非唐菖蒲(Gladiolus)的传粉驱动分化研究展开,包含系统发育树、研究表格等文件,用于验证传粉者驱动的生态物种形成模型在该类群高物种多样性中的作用,为理解生物多样性热点地区植物演化提供数据支持。 文件详解 文件名称: Gladiolus_tree.tre 文件格式: .tre(系统发育树文件) 内容说明:...
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树蛙热生理学系统发育分析补充数据集与代码
数据集概述 本数据集为树蛙热生理学系统发育分析研究的补充资料,包含物种热生理特征实测数据、系统发育树文件、OU模型分析代码及教程数据,支持复现树蛙从热带向温带迁徙过程中生理适应性的进化研究。 文件详解 文档文件: README.pdf:PDF格式,提供数据集整体说明与使用指引 数据文件:...
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紫花针茅复合体高山物种主成分分析与统计检验结果表
数据集概述 该数据集为紫花针茅复合体高山物种的主成分分析(PCA)与统计检验结果表,包含7个形态特征的PCA因子载荷、ANOVA/Kruskal-Wallis检验结果及组间事后检验显著性,用于物种分类研究。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML (.html) 字段映射: Character:形态特征(缩写,对应Table 1)...
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新热带豆科Zapoteca属亚属分类修订数据集
数据集概述 本数据集围绕新热带豆科Zapoteca属的亚属分类修订展开,基于核ETS、ITS及质体trnL-trnF DNA区域分析,调整了亚属划分并新增Subamazonica亚属,同时提供亚属检索表。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,共3个): trnl.con.tre:质体trnL-trnF序列构建的一致树文件...
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蝴蝶分化时间贝叶斯分析的先验与后验数据集
数据集概述 本数据集包含蝴蝶(凤蝶总科)属级系统发育时间校准分析的相关结果与数据文件。核心内容为通过贝叶斯方法分析蝴蝶分化时间的先验与后验分布,涉及994个类群、多基因片段及化石与宿主植物校准点,为蝴蝶起源时间及系统发育研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 系统发育树文件(.tre格式,共10个): -...



