数据集概述
该数据集为病原菌-宿主互作数据库（PHI-base）4.18版本，收录真菌、卵菌和细菌病原体中经实验验证的致病性、毒力及效应基因，覆盖动物、植物等宿主的互作信息，含基因序列与功能描述，支持数据互操作，为医疗和农业病原体基因研究提供资源。
文件详解
- 数据文件：
- phi-base_4.18_data.csv：CSV格式，包含record_id、phi_id、protein_id、gene_id、aa_sequence（氨基酸序列）、nt_sequence（核苷酸序列）、gene（基因名）等核心字段
- phi-base_4.18_fasta.fas：FASTA格式，存储数据库中所有基因的核苷酸和氨基酸序列
- 元数据与结构文件：
- datapackage.json：JSON格式，数据包装结构文件，含资源、版本、创建时间等元信息
- phi-base_schema.json：JSON格式，数据集结构描述文件
- 说明文档：
- README.html：HTML格式，数据库说明文档
- README.md：Markdown格式，数据库说明文档
数据来源
PHI-base（phi-base.org）
适用场景
- 病原生物学研究：分析病原菌致病性、毒力基因的功能及演化
- 药物靶点发现：筛选医疗或农业重要病原体的潜在化学干预靶点
- 宿主-病原体互作机制研究：探究不同宿主与病原体间的分子互作规律
- 生物信息学分析：利用基因序列数据开展序列比对、结构预测等分析
