数据集概述
本数据集包含淡水藻类Coccomyxa elongata SAG 216-3b的测序数据FastQC质量报告,涵盖PacBio Hifi、ONT、Hi-C及RNAseq四种测序类型的质控结果,用于支撑其染色体级基因组组装与注释研究。
文件详解
- 测序类型FastQC报告文件(共6个,均为.html格式):
- RNAseq_Ce_S1_R1_001_fastqc.html:RNAseq测序数据R1端的FastQC质量报告
- RNAseq_Ce_S1_R2_001_fastqc.html:RNAseq测序数据R2端的FastQC质量报告
- HiC_Arima_TTATAGCC_Celongata_S2_L001_R1_001_fastqc.html:Hi-C测序数据R1端的FastQC质量报告
- HiC_Arima_TTATAGCC_Celongata_S2_L001_R2_001_fastqc.html:Hi-C测序数据R2端的FastQC质量报告
- Celongata_SAG216_3B_porechop_n_fastqc.html:ONT测序数据的FastQC质量报告
- m64093_220722_215755.hifi_reads_fastqc.html:PacBio Hifi测序数据的FastQC质量报告
适用场景
- 基因组学研究:评估Coccomyxa elongata SAG 216-3b各类测序数据的质量,支撑基因组组装流程优化
- 转录组学分析:验证RNAseq数据质量,为基因表达分析提供数据可靠性依据
- 生物信息学质控:作为测序数据质量评估的参考案例,用于生物信息学教学或流程测试
- 藻类分子生物学研究:辅助解析该淡水藻类基因组特征与基因功能注释的可信度