数据集概述
该数据集包含所有DNA和RNA六核苷酸序列的序列依赖性形状参数及谐波刚度参数，同时提供用于可视化检查的坐标与刚度热图，以及实现深度优先搜索算法的Python脚本和从MD数据生成模型参数CSV文件的脚本集。
文件详解
该数据集由四个独立文件组成，具体说明如下：
- 核心数据文件:
- hexamers_csv.zip: ZIP格式压缩包，包含所有DNA和RNA六核苷酸序列的序列依赖性形状参数及谐波刚度参数数据。
- hexamers_heatmaps.zip: ZIP格式压缩包，包含用于可视化检查的坐标与刚度热图数据。
- 算法脚本文件:
- kmer_packing.py: Python格式脚本文件，实现深度优先搜索算法，用于创建包含所有k-mers的最小序列。
- 工具脚本文件:
- scripts.zip: ZIP格式压缩包，包含Shell、Python、Matlab脚本集，用于从MD数据生成模型参数CSV文件。
适用场景
- 分子生物学研究: 分析DNA和RNA六核苷酸序列的形状与刚度特性，探究序列对核酸结构的影响。
- 生物信息学算法开发: 基于深度优先搜索算法脚本，优化k-mer序列生成方法。
- 计算生物学建模: 利用MD数据处理脚本，构建或验证核酸结构相关的计算模型。
- 生物数据可视化: 使用热图数据研究核酸序列特征的可视化呈现方式。
