数据集概述
本数据集围绕分枝杆菌细胞色素P450酶展开，包含FASTA序列文件、网络分析结果图片及Cytoscape会话文件，支持通过序列相似性网络（SSN）和基因组邻域网络（GNN）研究该酶的功能，为未表征酶的功能预测提供数据基础。
文件详解
- FASTA序列文件（共3个）：
- CYPs from genus Mycobacterium 1 Oct 19.fasta：分枝杆菌属细胞色素P450酶的FASTA序列
- Mycobacterium P450 set from publication by Parvez et al 2016.fasta：Parvez等2016年发表文献补充材料中的参考FASTA序列
- Publication plus CYPs from genus Mycobacterium 1 Oct 19.fasta：上述两类序列的合并文件，用于生成SSN
- PNG图片文件（共2个）：
- Publication_plus_CYPs_from_genus_Mycobacterium_1_Oct_19_fasta_AST78_ID40 Full Network with Title.png：AST78（40%同一性，定义CYP家族）生成的SSN分析图片
- Publication_plus_CYPs_from_genus_Mycobacterium_1_Oct_19_fasta_AST131_ID55 Full Network colorized with Title.png：AST141（55%同一性，定义CYP亚家族）生成的SSN分析图片
- Cytoscape会话文件（共2个）：
- SSN_for_Publication_plus_CYPs_from_genus_Mycobacterium_1_Oct_19_fasta_AST78_ID40.cys：AST78生成的SSN的Cytoscape会话
- SSN_plus_GNN_for_Publication_plus_CYPs_from_genus_Mycobacterium_1_Oct_19_fasta_AST131_ID55.cys：AST141生成的SSN和GNN的Cytoscape会话
适用场景
- 微生物学研究：分析分枝杆菌细胞色素P450酶的序列相似性与家族分类
- 酶功能预测：通过基因组邻域网络推测未表征P450酶的潜在功能
- 分子进化分析：探究分枝杆菌P450酶的进化关系与多样性
- 生物信息学方法验证：验证序列相似性网络在酶功能注释中的应用效果
