剪接调控学习模型数据集

数据集概述

本数据集包含通过KATMAP方法从剪接因子(SF)扰动RNA-seq实验中学习到的剪接调控模型,涵盖不同剪接事件类型的模型文件、推理结果及靶标预测表,为研究剪接因子调控机制提供数据支持。

文件详解

  • 目录00_LearnedModels:包含cassette外显子模型的*.katmap文件,可用于外显子评分,含best_model_per_SF(高置信度SF模型)、models_for_both_cells(手稿使用的多细胞类型模型)子目录
  • 目录01_ModelOutputs:包含显著模型的推理结果,含00_CassetteExons(cassette外显子模型)、01_A3SS(A3SS事件模型)、02_A5SS(A5SS事件模型)子目录,每个子目录含模型、后验样本、摘要、靶标预测及可视化文件
  • 目录02_TargetPredictions:包含cassette外显子模型的靶标预测表
  • 压缩文件:KatmapModels.zip,包含上述所有目录及文件

适用场景

  • 分子生物学研究:分析剪接因子对不同剪接事件的调控机制
  • 计算生物学应用:利用KATMAP模型进行外显子剪接活性预测
  • 转录组学分析:探究RNA-seq实验中剪接扰动的分子效应
  • 生物信息学工具开发:基于*.katmap文件扩展剪接调控分析功能
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 456.2 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。