甲烷球菌属苹果酸脱氢酶热适应与潜在变构关联数据集

数据集概述

本数据集为研究论文《Unraveling the link between thermal adaptation and latent allostery in malate dehydrogenase from Methanococcales》的配套数据,围绕甲烷球菌属苹果酸脱氢酶的热适应与潜在变构关联展开,包含不同系统和模拟温度下的分子动力学模拟数据。

文件详解

该数据集以ZIP压缩包形式组织,按系统(野生型WT、突变体C7、突变体C7GP)和模拟温度分类,具体如下: - 系统目录(如WT、C7、C7GP): - md目录:无约束分子动力学轨迹文件,格式为GROMACS的.xtc,每100皮秒保存一次蛋白质坐标;含meta_min子目录(从元动力学模拟提取结构启动的运行)和其他从参考模型启动的运行文件 - meta目录:元动力学输出文件,包括自由能谱文件fes_A.dat和对应的HILLS文件

适用场景

  • 蛋白质结构生物学研究:分析甲烷球菌属苹果酸脱氢酶的热适应机制
  • 分子动力学模拟分析:探究蛋白质潜在变构效应与结构动态变化的关联
  • 酶工程应用:为苹果酸脱氢酶的热稳定性改造提供数据支持
  • 计算生物学研究:验证元动力学模拟在蛋白质功能研究中的应用价值
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1014.19 MiB
最后更新 2025年12月23日
创建于 2025年12月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。