数据集概述
本数据集为三文鱼虱基因组研究的补充数据，包含基因组组装、基因注释、重复序列分析等相关文件，支持对三文鱼虱寄生适应性及进化特征的研究，涉及基因表达、解毒基因、血红素稳态等生物学过程的分析。
文件详解
- 文档说明文件：
- Supplementary Material 30062021 REVISED.pdf：PDF格式，详细解释补充数据内容，与手稿内容对应。
- 基因组组装评估文件：
- BUSCO-V5-results-species-comparison.tar.gz：压缩包，包含BUSCO V5.0.0分析的原始输出和结果。
- Supplementary_Table_GenomeStats.xlsx：Excel格式，基因组统计数据补充表格。
- 重复序列分析文件：
- 多个RepMasker输出文件（如GCA_000181255.2_ASM18125v2_genomic.fna.RepMasker.out.gz等）：压缩格式，RepeatMasker原始输出结果。
- Lsalmonis-RepeatModeler-families.fa.gz、Lsalmonis-RepeatModeler-families.stk.gz：压缩格式，RepeatModeler生成的重复序列家族文件。
- 基因与功能分析文件（Excel格式）：
- Supplementary_Table_GeneProtein-stats.xlsx：基因和蛋白质统计数据。
- Supplementary_Table_GO_Cops.xlsx：基因本体论（GO）分析数据。
- Supplementary_Table_Compara_Domains.xlsx、Supplementary_Table_Compara_Genes.xlsx：基因比较分析数据。
- Supplementary_Table_Heme.xlsx：血红素相关基因数据。
- Supplementary_Table_Detox.xlsx：解毒基因数据。
- 其他文件：
- Pex_genes.fa：FASTA格式，过氧化物酶体相关基因序列。
- Supplementary_Table_IR.docx：Word格式，倒置重复序列补充表格。
适用场景
- 基因组学研究：分析三文鱼虱基因组结构、重复序列特征及基因注释结果。
- 进化生物学研究：探究三文鱼虱寄生适应性的进化机制，如血红素稳态、解毒基因等。
- 功能基因组学：研究三文鱼虱基因表达模式及关键功能基因（如过氧化物酶体相关基因）的作用。
- 比较基因组学：通过BUSCO分析结果进行物种间基因组完整性比较。
- 寄生生物研究：支持对三文鱼虱寄生行为及与宿主相互作用的分子机制研究。
