数据集概述
本数据集包含同源导入小鼠线粒体DNA谱分析项目中所有使用和生成的处理数据文件，涵盖变异数据、频率统计、深度数据等关键分析结果，通过配套PDF文档提供文件和字段说明，为线粒体DNA变异与功能研究提供结构化数据支持。
文件详解
- 核心分析文件（包含于压缩包中）：
- somatic_mutations.vcf：VCF格式，体细胞变异数据文件
- haplotype_mutations.vcf：VCF格式，单倍型变异数据文件
- supertable.txt：TXT格式，综合数据表
- cleaned_read_depth_per_pos.txt：TXT格式，每个位点的清洁读取深度数据
- adjusted_mut_freq_for_haplotypes.csv：CSV格式，单倍型调整后的突变频率数据
- mut_freq_per_type.csv：CSV格式，按类型分类的突变频率数据
- 文档与压缩包文件：
- serrano2023_directory_of_files.pdf：PDF格式，数据集文件及字段说明文档
- selection_analysis.zip：ZIP格式，选择分析相关文件压缩包
- reversion analysis.zip：ZIP格式，回复突变分析相关文件压缩包
- fasta_files.zip：ZIP格式，FASTA序列文件压缩包
- raw_data.zip：ZIP格式，原始数据压缩包
- change_in_mutfreq_w_age.zip：ZIP格式，随年龄变化的突变频率数据压缩包
- input_files.zip：ZIP格式，输入文件压缩包
- annotating_variants.zip：ZIP格式，变异注释相关文件压缩包
适用场景
- 线粒体遗传学研究：分析同源导入小鼠线粒体DNA的变异特征与遗传规律
- 突变频率分析：探究不同单倍型线粒体DNA的突变频率及随年龄变化趋势
- 生物信息学方法验证：作为线粒体DNA谱分析流程的测试数据集
- 分子进化研究：研究线粒体DNA变异的选择压力与回复突变机制
