数据集概述
本数据集是Trenner等2022年关于植物U-box蛋白（PUBs）进化与功能研究的补充资料，包含支持主研究的方法、参考文献、系统发育树图表、序列比对文件及序列信息表，为植物U-box蛋白的进化分析提供完整数据支撑。
文件详解
- Additional_information.pdf：PDF格式，包含补充方法和参考文献，为研究提供方法细节与文献依据。
- Supp_Fig1_Ubox_full_protein_maximum_likelihood_phylogram_linear.pdf：PDF格式，基于1121条U-box全长蛋白序列与4条外群RING结构域序列的最大似然系统发育树图表。
- Supp_Fig2_Ubox_domain_maximum_likelihood_phylogram_linear.pdf：PDF格式，基于1121条U-box结构域序列与4条外群RING结构域序列的最大似然系统发育树图表。
- MAFFT_alignment _1121seqs_Ubox_full_protein_plus_4seqs_RING_outgroup.fasta：FASTA格式，1121条U-box全长蛋白序列与4条外群RING结构域序列的MAFFT多序列比对文件。
- MAFFT_alignment _1121seqs_Ubox_domain_plus_4seqs_RING_outgroup.fasta：FASTA格式，1121条U-box结构域序列与4条外群RING结构域序列的MAFFT多序列比对文件。
- Ubox_protein_sequences_information.xlsx：Excel格式，包含1121条U-box蛋白序列的ID信息及来源数据库的表格。
适用场景
- 植物分子生物学研究：分析植物U-box蛋白家族的系统发育关系与进化模式
- 蛋白质结构域进化研究：探究U-box结构域的独立进化路径与保守性
- 比较基因组学分析：跨物种比较U-box蛋白的序列特征与功能分化
- 生物信息学方法验证：复现基于MAFFT比对与IQ-TREE构建系统发育树的流程
