找到630个数据集

分类: 公开数据 标签: FASTA

过滤结果
  • Rye_Reference_NLRome_黑麦抗性基因注释数据

    2026年1月28日 30 106 69

    数据集概述 本数据集包含对近期发布的黑麦(Rye)参考基因组'Lo7'和'Weining'中核苷酸结合富亮氨酸重复序列(NB-LRR或NLR,主要抗性基因家族)的注释信息。旨在为黑麦NLRome的进一步研究及新型抗病品种选育提供有价值且易于获取的资源,共包含3个文件。 文件详解 文件名称:Lo7_NLRome_NB-ARC.fasta...
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  • Avian_influenza_virus_生物学基因序列数据

    2026年1月28日 30 20 2

    数据集概述 本数据集包含禽流感病毒(AIV)相关的基因序列数据,以FASTA格式压缩存储,核心文件为aiv-rate-heterogeneity-v1.1.zip。数据聚焦生物学基因领域,未划分训练/测试、数据/标签或原始/处理集,仅含一个压缩文件,无额外目录层级。 文件详解 文件名称:aiv-rate-heterogeneity-v1.1.zip...
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  • Sulawesi_Based标志性偶蹄类动物同步分化研究数据集

    2026年1月28日 0 85 80

    数据集概述 本数据集围绕苏拉威西标志性偶蹄类动物(鹿豚、倭水牛、苏拉威西疣猪)的同步分化展开,整合了基因数据与形态测量数据,用于验证近期地质事件对物种分化的驱动作用,为理解该区域特有生物多样性形成机制提供支撑。 文件详解 基因序列文件(.fasta)...
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  • HiBC人类肠道细菌16S_rRNA基因序列数据20240620

    2026年1月28日 30 131 55

    数据集概述 本数据集包含人类肠道细菌集合(HiBC)中分离菌株的16S rRNA基因序列,涵盖已知细菌及待分类命名的新物种菌株。序列以FASTA核苷酸格式存储,通过Sanger测序技术或基因组序列提取获得,为微生物研究社区提供标准化基因序列资源。 文件详解 文件名称:HiBC_16S_rRNA_gene_sequences_20240620.zip...
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  • HiBC_Based人类肠道细菌基因组序列数据集20240717

    2026年1月28日 30 75 50

    数据集概述 本数据集为人类肠道细菌集合(HiBC)的基因组序列数据,包含从人类肠道分离的细菌菌株的16S rRNA基因序列、基因组序列及培养条件,涵盖已知细菌及新物种菌株,定期更新。本次提供的是FASTA核苷酸格式的基因组序列压缩包,质粒序列位于文件末尾,已修正前期错误及分类学拼写问题。 文件详解...
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  • Evaluation_蜘蛛RNA保存方法对转录组组装影响评估数据

    2026年1月28日 30 3 1

    数据集概述 本数据集为蜘蛛RNA保存方法对从头转录组组装影响的评估研究数据,包含3个文件。研究针对野外采集蜘蛛样本,测试不同温度、防腐剂及样本浸没状态对RNA质量及转录组组装结果的影响,为非模式生物(如蜘蛛)的野外样本保存提供指导。 文件详解 文件名称:18S_all_comp.fasta 文件格式:FASTA...
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  • Sebastes_Based岩鱼性别鉴定PCR_RFLP实验数据

    2026年1月28日 30 59 7

    数据集概述 本数据集包含用于Sebastes属8种岩鱼性别鉴定的PCR-RFLP检测实验相关文件,涵盖8种岩鱼的样本信息表及各物种雌雄个体在Sch.182255-210250基因座的DNA序列数据,共2个文件,为岩鱼性别鉴定研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:Sebastes-samples1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • 硬珊瑚_Acropora_的共生藻多样性_454_焦磷酸测序数据

    2026年1月28日 30 26 10

    数据集概述 本数据集为西澳大利亚地理极端区域鹿角珊瑚(Acropora)共生藻(Symbiodinium)多样性与宿主特异性研究的相关数据,通过454焦磷酸测序技术获取,包含测序数据、分析文件、代码脚本等8个文件,用于分析珊瑚共生藻群落结构、多样性及宿主特异性。 文件详解 数据文件 文件名称:colonies.csv 文件格式:CSV...
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  • FMDV_Based_O型口蹄疫病毒持续感染牛基因组突变研究数据

    2026年1月28日 30 137 69

    数据集概述 本数据集为Litz等人研究的附加数据,聚焦O型口蹄疫病毒(FMDV)在牛持续感染过程中的基因组突变。包含7个文件,涵盖序列比对、元数据、进化树等类型,记录病毒基因组变异、样本信息及实验关联数据,支持病毒基因组进化与持续感染机制研究。 文件详解 CSV文件(共2个) 文件名称:NT_alignment_FMDV_ORF_consensus-...
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  • Abedinium_Source_单细胞转录组与进化分析补充数据

    2026年1月28日 30 173 4

    数据集概述 本数据集包含甲藻Abedinium的单细胞转录组学研究相关补充文件,涵盖两个物种(A. dasypus和新种A. folium)的转录组序列、系统发育分析比对文件、补充视频及电子表格,用于支撑其作为新早期分支甲藻谱系的研究结论,涉及转录组特征、质体功能及线粒体基因组等分析内容。 文件详解 转录组序列文件...
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  • hABC_Based_巴西东北部爬行动物群落同步种群变化估计数据

    2026年1月28日 30 28 21

    数据集概述 本数据集包含用于分析巴西东北部季节性干旱热带森林(Caatinga)爬行动物群落同步种群变化的遗传数据,涉及七种有鳞目动物和四种两栖动物。数据通过分层近似贝叶斯计算(hABC)模型,验证更新世干旱增加对相关物种多样化的影响,支持Caatinga在晚更新世扩张的结论。 文件详解 遗传序列文件(.fas格式,10个文件)...
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  • Dryad_Based高等白蚁肠道细菌群落结构与饮食关系研究数据

    2026年1月28日 30 97 81

    数据集概述 本数据集围绕高等白蚁肠道细菌群落结构展开,通过16S rRNA基因扩增子文库分析18种高等白蚁,探究饮食对其肠道细菌群落结构的影响。数据显示饮食是决定群落结构的主要因素,相同饮食组内同亚科白蚁肠道群落更相似,为微生物共生消化研究提供支撑。 文件详解 系统发育与分类数据文件...
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  • PR2_Based_温带湖泊纤毛虫群落古重建生态变化研究补充数据

    2026年1月28日 30 48 21

    数据集概述 本数据集是温带湖泊纤毛虫群落古重建生态变化研究的补充数据,包含PR2数据库的 curated 版本相关文件,用于高通量测序(HTS)数据的分类学分配,支持湖泊生态系统长期变化的研究。 文件详解 pr2_database_curation_procedure.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:记录PR2数据库 curated...
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  • Helianthus_Based_二倍体向日葵属系统发育研究数据

    2026年1月28日 30 103 64

    数据集概述 本数据集包含二倍体向日葵属(Helianthus)物种树估计的相关数据,基于37个物种/亚种的103个样本,通过目标富集技术获取170个基因进行系统发育分析。数据涵盖合并与联合分析结果,支持向日葵属三大分支(一年生分支、两个多年生分支)的划分,为研究该属进化、生态过程及形态特征演变提供基础。 文件详解...
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  • OGRDB_Based小鼠DBA_1J品系IGLV种系参考数据集

    2026年1月28日 30 117 111

    数据集概述 本数据集为小鼠DBA/1J品系的IG受体种系参考数据,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB),包含DBA/1J IGLV的种系序列及相关文件,共4个文件,支持免疫受体基因组的研究与分析。 文件详解 数据文件(.fasta格式) 文件名称:1J...
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  • OGRDB_Based_人类IGH_VDJ免疫受体种系参考数据集

    2026年1月28日 30 122 88

    数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的人类IGH_VDJ免疫受体种系参考集,包含7个文件,涵盖FASTA格式的序列文件、JSON格式的元数据文件及许可说明文件,为免疫受体相关研究提供标准化参考数据。 文件详解 许可文件 文件名称:licence.txt 文件格式:TXT...
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  • M_roreri_Based可可病原菌交配基因与繁殖方式研究数据

    2026年1月28日 30 156 23

    数据集概述 本数据集围绕可可病原菌Moniliophthora roreri的交配基因与繁殖方式展开,包含该菌A/B交配位点的基因序列比对、系统发育分析用ITS序列比对及微卫星标记数据,用于支持其虽具有双等位基因交配位点但以克隆方式繁殖的研究结论,涉及47株全球地理分布菌株的遗传分析。 文件详解 Gblocks alignment of...
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  • 基因表达与宿主_寄生虫相互作用_蚂蚁行为与寿命调控的分子机制数据

    2026年1月28日 30 63 33

    数据集概述 本数据集聚焦寄生虫诱导宿主表型改变的分子机制,对比被绦虫Anomotaenia brevis寄生的Temnothorax nylanderi蚂蚁工蚁、未寄生巢友及未寄生蚁群工蚁的脑基因表达模式,识别出400余个差异表达基因,涉及寿命延长、肌肉功能下调等表型相关机制,为寄生虫操纵宿主行为与生活史的近端机制研究提供基因表达与形态测量数据。...
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  • 基于差异性渗入的野生小麦杂交区逆转录转座子基因渗入与重组研究数据

    2026年1月28日 30 180 9

    数据集概述 本数据集围绕野生小麦(Aegilops geniculata与Aegilops triuncialis)杂交区的逆转录转座子展开,包含实验与自然杂交种群的基因数据,旨在分析生殖隔离机制下逆转录转座子的基因渗入模式与基因组重组特征,为物种完整性维持研究提供支持。 文件详解 文件名称:SampleCode.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • OGRDB_Based_AKR_J小鼠IGLV受体种系参考数据集

    2026年1月27日 0 31 15

    数据集概述 本数据集是发布于开放种系受体数据库(OGRDB)的小鼠AKR/J亚群IGLV受体种系参考集,包含4个相关文件,涵盖种系序列的带间隙、无间隙FASTA格式文件、JSON格式数据及许可文件,为免疫受体序列分析提供标准化参考数据。 文件详解 J IGLV_rev_1_gapped.fasta 文件格式:FASTA...
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