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高加索地区Phoxinus属鱼类分类修订补充材料2024
2026年1月30日 30 127 117
数据集概述 本数据集是高加索地区Phoxinus属（鱥属）鱼类分类修订研究的补充材料6，包含ModelFinder v.2.2.0（最大似然法ML）和PartitionFinder v.2.1.1（贝叶斯推断BI）生成的最佳分区方案，用于支持新窄域特有种的描述及分类学修订研究。 文件详解 文件名称：oo_1006510.docx 文件格式：DOCX...
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Dryad_Horornis_斐济灌木莺基因流与岛屿生物地理学研究数据
2026年1月26日 30 205 41
数据集概述 本数据集为论文配套的数据，基于斐济灌木莺（Horornis ruficapilla）的基因组数据，研究岛屿大小和距离对基因流的影响，验证岛屿生物地理学理论在基因组层面的适用性。包含基因序列、变异数据、分析配置及结果表格等8个文件，支持相关假设检验与后续研究。 文件详解 文档文件 文件名称：README.txt 文件格式：TXT...
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Doedicurus_Based_南美巨型雕齿兽古DNA进化关系研究数据
2026年1月21日 30 76 18
数据集概述 本数据集包含已灭绝南美巨型雕齿兽（Doedicurus sp.）的古DNA研究相关数据，涉及雕齿兽及现存犰狳的测序数据、系统发育分析文件、NGS流程脚本等，用于揭示雕齿兽的进化起源与系统发育关系，支持古生物进化研究。 文件详解 测序数据文件...
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Cardioglossa_Based非洲长指蛙属系统发育与物种分化研究数据
2026年1月21日 30 130 113
数据集概述 本数据集包含非洲长指蛙属（Cardioglossa）18个物种的系统发育分析相关文件，基于线粒体和核基因位点数据构建。涵盖系统发育树、分区方案、物种界定分析等结果，支持研究该属物种的分化时间、生物地理历史及体色分化机制，共8个文件。 文件详解 系统发育树文件（.tre）...
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PartitionFinder_Data_系统发育分析_分子进化模型选择数据
2026年1月20日 30 51 30
数据集概述 本数据集包含用于系统发育分析的相关数据，涉及分子序列数据的分区方案和替代模型的选择。数据支持对分区方案的客观选择，以提升系统发育重建的准确性，适用于大型多位点DNA数据集的分析。数据集共包含四个文件，分为压缩文件和文档文件两类。 文件详解 文档文件 文件名称：README_for_Table_1_and_2_datasets.txt...
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ZooKeys_补充材料_2_日本石磺线粒体基因组系统发育分析补充数据2025
2026年1月19日 30 62 61
数据集概述 本数据集是论文“The complete mitochondrial genome of Siphonaria japonica (Heterobranchia, Siphonariidae) and its phylogenetic implications”的补充材料2，包含通过PartitionFinder...
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Metazoa_Phylogenetic_Signal_后生动物系统发育基因组数据集
2026年1月18日 30 37 12
数据集概述 本数据集为后生动物系统发育研究的基因组数据，包含1080个直系同源基因座，源自36个公开基因组，覆盖主要动物类群。数据用于优化系统发育信号分区，支持栉水母作为其余后生动物姊妹群的结论，提供基因组系统发育分析的工作流与工具，共15个文件。 文件详解 RAxML_single_genes.zip 文件格式：ZIP...
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Hymenoptera_UCE_Based_叶蜂与树蜂系统发育及生物地理学研究数据
2026年1月15日 30 91 55
数据集概述 本数据集包含叶蜂与树蜂（膜翅目）系统发育与生物地理学研究的输入文件、分析脚本及系统发育树文件，用于构建该类群的综合系统发育关系并解析其生物地理历史，共包含40个文件。 文件详解 输入文件 文件名称：BEAST_input_phylo-...
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ZooKeys_补充材料_3_Paroedura系统发育分析替代模型数据_2023
2026年1月14日 30 209 64
数据集概述 本数据集为论文补充材料3，包含使用Partition Finder 2.1.1计算的Paroedura（壁虎科）系统发育分析的最佳替代模型及最佳分区方案，用于支持该物种系统发育关系的研究。 文件详解 文件名称：oo_917300.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：包含通过Partition Finder...
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Ancient_Mitochondrial_DNA_Based_巨型短面熊趋同演化研究数据
2026年1月13日 30 152 120
数据集概述 本数据集包含古代巨型短面熊（Tremarctinae亚科）的线粒体DNA研究数据，涉及南北美洲巨型短面熊（Arctodus simus与Arctotherium angustidens）及现生眼镜熊的演化关系分析，揭示其趋同演化特征。数据集含4个文件，支持分子系统发育分析。 文件详解 PartitionFinder_files.zip...
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Heliconius_Multilocus_Species_Trees_蝴蝶适应性辐射研究数据
2026年1月11日 30 23 3
数据集概述 本数据集为研究新热带区Heliconiini蝴蝶适应性辐射的多基因物种树数据，包含22个线粒体与核标记的测序数据，覆盖该族约百分之九十二的物种。数据用于分析系统发育信号冲突、比较不同物种树重建方法，并构建时间校准的系统发育树，以探究新热带区环境变化对蝴蝶多样化速率的影响，共包含五个关联文件。 文件详解 文档类文件...
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Lepilemur_mitogenomes_Based运动狐猴系统基因组重建及生物地理学分析数据
2026年1月8日 30 6 1
数据集概述 本数据集包含35个完整线粒体基因组的分析结果，覆盖运动狐猴属（Lepilemur）全部26个已识别类群，用于系统基因组重建及马达加斯加生物地理学推断。数据支持25个单系谱系的恢复，以及Lepilemur mittermeieri与Lepilemur...
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Brassicaceae_time_calibrated_十字花科物种辐射演化历史时间校准框架数据
2026年1月7日 30 134 30
数据集概述 本数据集提供基于29种十字花科物种全叶绿体序列数据的时间校准框架及关键分化时间估计。涵盖十字花科冠群多样化起始时间、主要演化分支分化时间、拟南芥冠群年龄等信息，分析多倍体化与物种丰富度的关联，为十字花科演化研究提供时间维度支撑。 文件详解 文件名称：Supplemental Data Set 1.xlsx 文件格式：XLSX...
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Phylogenomic_Inference_Based_系统发育基因组学位点与分区异质性研究数据
2026年1月7日 30 97 29
数据集概述 本数据集围绕系统发育基因组推断中位点模式异质性与分区异速性的相对重要性展开，包含模拟实验和实证分析数据。通过比较分区模型、位点异质性模型及组合模型的性能，探讨不同模型对系统发育推断准确性的影响，特别关注长枝吸引问题及模型选择策略。 文件详解 模拟实验数据（Simulated data）...
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基于Platygonus_compressus的已灭绝北美平头野猪古DNA及现存物种线粒体基因组研究数据
2026年1月1日 30 65 52
数据集概述 本数据集包含已灭绝北美平头野猪（Platygonus compressus）的古DNA数据，以及现存野猪科物种的完整线粒体基因组序列。数据用于分子系统发育分析，以明确古生物与现存物种的亲缘关系、分化时间，并初步探究平头野猪的种群遗传多样性。数据集共9个文件，涵盖测序数据、分析脚本及结果文件。 文件详解 测序数据文件...
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ZooKeys_Supplementary_material_3_Tapinoma蚂蚁遗传标记替代模型数据
2025年12月30日 30 30 21
数据集概述 本数据集是论文“Morphological and genetic evidence supports the separation of two Tapinoma ants from the Atlantic Forest biome”的补充材料3，包含使用PartitionFinder...
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Gobio_uralensis_Supplementary_material_2_鲤形目新种系统发育分析数据
2025年12月30日 30 109 65
数据集概述 本数据集为论文《On the border of Europe and Asia: Gobio uralensis, a new species of gudgeons (Cypriniformes, Gobionidae) from the Caspian Sea basin》的补充材料2，包含由ModelFinder...
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ZooKeys_补充材料_4_Microphysogobio_elongatus线粒体基因组系统发育分析数据2021
2025年12月27日 30 3 2
数据集概述 本数据集为论文《Microphysogobio elongatus（硬骨鱼纲，鲤科）的完整线粒体基因组及其系统发育意义》的补充材料4，包含PartitionFinder分析结果，用于支持该鱼类线粒体基因组的系统发育研究，共1个文件。 文件详解 文件名称：oo_594678.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：对应论文中的Table...
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树懒进化历史与生物地理学古线粒体基因组数据集2019
2025年12月23日 30 58 11
数据集概述 该数据集是《Current Biology》2019年发表论文的补充材料，包含树懒古线粒体基因组的捕获序列、多格式基因组数据集、系统发育树文件、祖先特征重建结果及实验方案等，为研究树懒的进化历史与生物地理学提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 序列捕获文件: - Delsuc-...
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九寨沟世界遗产地隐存生物多样性研究之新烙铁头蛇分子进化模型分区表
2025年12月21日 30 138 0
数据集概述 该数据集为《探索世界遗产地的隐存生物多样性：来自中国四川阿坝九寨沟的一种新烙铁头蛇》研究中的表3，记录了通过PartitionFinder 2.1.1软件选择的分子分区及其对应的进化模型，包含9个分区的基因位点、序列长度和模型信息。 文件详解 文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 字段映射:...
