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Villiers等人急性早幼粒细胞白血病PML_RARA基因调控多组学源数据
数据集概述 本数据集是论文“Multi-omics and machine learning reveal context-specific gene regulatory activities of PML::RARA in Acute Promyelocytic...
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Oligohymenophorea_PL0344_微生物基因组转录组测序数据
数据集概述 本数据集包含Oligohymenophorea sp. PL0344的基因组与转录组测序数据，以压缩包形式存储，无分层目录结构及数据划分，未提供说明文档或内容预览。 文件详解 文件名称：Oligohymenophorea_PL0344.zip 文件格式：ZIP...
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Thalassiosirales_硅藻_海洋淡水过渡_系统发育基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为硅藻（主要是盘藻目Thalassiosirales）海洋淡水过渡研究的补充材料，包含59个硅藻类群的基因组与转录组系统发育数据，用于解析其栖息地转换的进化机制，涉及基因树冲突、祖先状态重建及适应性基因分析等内容。 文件详解 README-dryad.txt 文件格式：TXT...
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Phylogenetic_Data_系统发育信号分析_串联比对与基因树研究数据
数据集概述 本数据集围绕原核生物与真核生物的串联比对及基因树展开分析，包含原核生物3个分类深度（γ变形菌、变形菌、原核生物）的248个基因树（315个基因组），以及真核生物2个分类深度（动植物真菌跨类群、真菌内部）的279个基因树（85个基因组），用于探究系统发育树不一致的来源及单基因与串联比对的重叠程度。 文件详解...
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Hemiptera_UCE_Based_半翅目系统发育研究诱饵集与基因组资源整合数据
数据集概述 本数据集基于为半翅目系统发育设计的超保守元件（UCE）诱饵集，包含36个半翅目样本（覆盖3个亚目、7个异翅亚目下目、23科、34属）及1个缨翅目外群的UCE数据，同时整合了已发表基因组/转录组的UCE位点挖掘结果，可支持系统发育、种群遗传及分子进化研究。 文件详解 RAxML_alignInput_&_Trees.zip...
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Rosa_Supplementary_Material_玫瑰基因组代谢物分析补充数据
数据集概述 本数据集为论文《The Rosa genome provides new insights into the domestication of modern roses》的补充材料，包含通过GC-MS技术对6个玫瑰品种、3种植物部位进行的靶向代谢物分析数据，支持玫瑰基因组研究及驯化机制分析。 文件详解 文件名称：Supplementary...
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Birkbeck_Thesis_Supplemental_Tables_结核分枝杆菌研究数据
数据集概述 本数据集是伦敦大学伯克贝克学院博士论文的补充表格数据，围绕结核分枝杆菌复合体的宿主特异性及非编码RNA的作用展开，采用基因组和转录组学方法研究。包含12个Excel格式的补充表格文件，为论文研究提供结构化支撑数据。 文件详解...
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线虫反义转录进化研究数据_Pristionchus_pacificus_2016年
数据集概述 本数据集基于线虫Pristionchus pacificus的链特异性RNA-seq文库测序结果，包含1112个反义转录结构配置信息，核心为465个嵌入宿主基因内含子的反义转录本（ASTs）。同时涵盖20种线虫基因组反义基因对的进化分析数据，涉及vps-4、ddx-27等保守基因座的结构变化研究。 文件详解...
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Genomic_basis_coral_climate_resilience_研究数据
数据集概述 本数据集聚焦珊瑚对气候变化的基因组适应性机制，通过RNA-Seq技术比较热敏和耐热珊瑚的转录组基因表达差异，识别与珊瑚抗逆性相关的分子通路，包括热休克蛋白、抗氧化酶等关键基因的表达特征，为理解珊瑚应对环境胁迫的生理机制提供基础数据。 文件详解 文件名称：33496_Ahyacinthus_CoralContigs.fasta.zip...
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snakes_phylogenomics_Based_蛇类科间系统发育基因组关系研究数据
数据集概述 本数据集为蛇类科间系统发育关系研究的基因组数据，包含3776个核基因座的超保守元件序列，涉及29种蛇类（覆盖几乎所有科），是此前研究数据量的约100倍。数据用于解析蛇类主要类群间的亲缘关系，揭示了3个新分支，为脊椎动物系统发育研究提供支撑。 文件详解 序列文件（.phy格式）...
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CBGP_Inrae_Source_蚜虫线粒体核共生体基因组系统发育研究补充数据_2024
数据集概述 本数据集为论文“蚜虫系统发育中线粒体、核与共生体基因组的不一致性：谁在说真话？”的补充数据，包含补充表格、补充图表、实验方案文档及4个存档文件，覆盖蚜虫样本信息、基因扩增数据、基因组矩阵、系统发育树及共生菌基因组草案等内容，支持蚜虫系统发育的多组学分析。 文件详解 补充表格文件 文件名称：Supplementary_Tables.xlsx...
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IStraw90_Strawberry_Based_佛罗里达大学草莓基因组SNP阵列探针数据
数据集概述 本数据集为佛罗里达大学草莓育种项目所用的全基因组IStraw90 SNP阵列探针数据，包含1558个独特草莓个体的9908个SNP标记基因型信息，用于基因组预测模型构建，以优化草莓育种亲本选择，缩短育种周期。数据集仅含一个文件。 文件详解 文件名称：GenoT2468.10.xlsx 文件格式：XLSX...
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Eurycea_spelaea_Based_Ozark高原洞穴蝾螈系统发育基因组数据_2017
数据集概述 本数据集聚焦Ozark高原洞穴蝾螈（Eurycea spelaea...
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Genome_Transcriptome_Based_Calanus物种核插入缺失标记开发数据
数据集概述 本数据集为Calanus属桡足类物种鉴定的核插入缺失标记开发相关数据，基于C. finmarchichus和C. glacialis两个近缘物种的基因组与转录组测序分析，包含12个物种特异性扩增子长度标记的开发成果，可用于Calanus属多个物种及杂交种的分子鉴定，共含5个文件。 文件详解...
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Trissolcus_basalis_Genome_Based寄生蜂基因组补充材料数据2023
数据集概述 本数据集为寄生蜂Trissolcus basalis（膜翅目，缘腹细蜂科）的基因组补充材料，该寄生蜂是研究蝽类害虫生物防治的模式生物。数据源自2023年发表的相关研究论文，包含一个文件，用于支撑该寄生蜂基因组研究的补充信息。 文件详解 文件名称：oo_809128.xlsx 文件格式：XLSX...
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Snake_Phototransduction_Genes_选择压力变化与光感受器转导研究数据
数据集概述 本数据集聚焦蛇类视觉系统进化的分子机制，包含蛇类光转导基因的转录组、基因组及选择压力分析相关数据。通过测序7个蛇眼转录组，结合全基因组和靶向捕获测序数据，分析基因丢失及选择压力变化，为蛇类进化起源、光感受器转导的分子基础提供支撑。 文件详解 Transcriptome Assemblies.zip 文件格式：ZIP...
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Cyanistes_caeruleus_Based_蓝山雀基因组转录组多态性与选择信号研究数据
数据集概述 本数据集为蓝山雀（Cyanistes caeruleus）的基因组与转录组特征研究数据，包含参考基因组组装、雌雄转录组映射、全基因组变异鉴定及性别差异表达分析结果，涉及性腺、脑等组织，可用于探究自然选择与性选择的遗传基础，共8个文件。 文件详解 选择信号分析文件...
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Perfect_microsatellite_Based_36种爬行动物基因组完美微卫星分布数据
数据集概述 本数据集通过Krait软件识别并定位了36种爬行动物基因组中的完美微卫星DNA序列，核心内容为这些微卫星在基因组内的分布信息，共包含1个压缩文件，可用于爬行动物基因组结构与微卫星特征的相关研究。 文件详解 文件名称：Perfect-microsatellite distribution in the genomes of 36...
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COVID_19_Phylogenetic_Analysis_年龄组死亡风险评估补充数据2020
数据集概述 本数据集为COVID-19各年龄组死亡风险评估研究的配套数据，基于基因组系统发育分析方法，用于支持研究中关于病毒基因组与死亡风险关联性的分析。数据集包含一份压缩格式的补充材料，是理解COVID-19年龄相关死亡风险机制的重要参考。 文件详解 文件名称：Supplementary...
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Proteogenomic_Characterization_胆管癌临床关联蛋白质基因组学研究补充数据
数据集概述 本数据集为胆管癌蛋白质基因组学特征研究的补充表格集合，包含七份Excel文件，内容与胆管癌的蛋白质基因组学整合分析及临床结局关联相关，是该研究的重要补充资料。 文件详解...
