-
Arceuthobium_Based_矮槲寄生种群基因组与宿主动态研究数据
数据集概述 本数据集为矮槲寄生属（Arceuthobium）种群基因组研究数据，包含通过RAD-sequencing技术获取的SNP数据及相关分析文件，覆盖北美和墨西哥不同宿主上的矮槲寄生样本，用于研究其系统发育分类、宿主特异性及地理因素对遗传结构的影响。 文件详解 文件名称：1_Arceuthobium_sample_info.xlsx...
-
RAD_Based_深海八放珊瑚Chrysogorgia属物种界定研究数据
数据集概述 本数据集为RAD测序技术在深海八放珊瑚Chrysogorgia属物种界定中的应用研究数据，包含12个候选物种的系统发育关系分析结果，对比了Stacks和PyRAD两种分析流程，验证线粒体标记的物种界定假设，揭示物种内遗传结构与地理分布的关联，共含2个文件。 文件详解...
-
PSMC_RAD_Based_PSMC方法RAD测序数据适用性研究_data
数据集概述 本数据集包含用于PSMC（成对序列马尔可夫合并）方法分析RAD（限制性位点关联DNA）测序数据的代码文件和实证数据。内容涉及PSMC方法在RAD数据中的适用性研究，包括模拟分析和实证案例，旨在为RAD数据的PSMC分析提供指导，共包含4个文件。 文件详解 代码文件（.r格式）...
-
RAD_Sequencing_Based_大扇贝种群结构与表型可塑性研究数据
数据集概述 本数据集为RAD测序研究大扇贝种群结构的配套数据，包含大扇贝的微卫星基因型信息。研究通过对比微卫星与RAD测序技术解析种群结构的能力，探究北爱尔兰周边9个大扇贝种群的遗传差异及表型可塑性，数据可支持分子生态学中种群遗传与表型关联的分析。 文件详解 文件名称：Pmaximus_Microsatellite_genotypes.xlsx...
-
vent_barnacle_深海热液喷口特有藤壶进化历史与生物地理模式研究数据
数据集概述 本数据集聚焦深海热液喷口特有藤壶的进化历史与生物地理模式，包含基于多基因座和RAD测序的遗传多样性分析数据，用于推断其辐射时间、起源地、扩散模式及多样化过程，为研究深海生物多样性驱动因素提供支撑。 文件详解 文件名称：vent_barnacle_sanger-based_dating.zip 文件格式：ZIP...
-
RAD_Sequencing_Based_湖白鲑基因流物种形成遗传结构研究数据
数据集概述 本数据集通过RAD测序分析北美湖白鲑物种对在基因流物种形成过程中的遗传结构，比较五个湖泊中物种对的基因组分化模式，识别抗基因渗入区域并推导屏障强度。数据反映遗传分化受选择位点连锁、生态位分化强度及湖泊特有种群特征影响，为解析物种形成机制提供支撑。 文件详解 5_Lakes_Mapped_2734_FST.txt 文件格式：TXT...
-
Mugil_cephalus_Based_澳大利亚东部鲻鱼种群遗传SNP标记数据
数据集概述 本数据集包含澳大利亚东部海域鲻鱼（Mugil cephalus）种群遗传分析的关键数据，涵盖新开发的单核苷酸多态性（SNP）和微卫星标记，以及空间遗传分化的初步估计和后续研究的功率测试结果，为该经济鱼类的可持续管理提供遗传依据。 文件详解 文件名称：Mugil_cephalus_RRL_454.zip 文件格式：ZIP...
-
Cimex_lectularius_Based臭虫抗药性连锁图谱与QTL分析完整数据
数据集概述 本数据集为温带臭虫（Cimex lectularius）拟除虫菊酯抗药性的连锁图谱构建与QTL分析相关数据，包含基因分型数据、参考基因组重组、抗药性相关QTL定位等研究内容，涉及334个SNP标记、14个连锁群及抗药性候选基因定位，支持昆虫抗药性遗传机制研究。 文件详解 代码文件（.r、.sh格式）...
-
Oreochromis_niloticus_Based刚果民主共和国引入种群基因组研究数据集
数据集概述 本数据集用于研究刚果民主共和国引入的尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）种群基因组特征，包含213份尼罗罗非鱼样本（来自原生及引入区域）和48份其他罗非鱼物种样本的基因分型数据，通过RAD测序获得27611个SNP位点，可分析种群分化、遗传混杂及入侵后果。 文件详解 文件名称：README.docx 文件格式：DOCX...
-
RAD_Based_Alvord_Basin丘头鱼种群遗传结构与演化历史研究数据
数据集概述 本数据集为美国俄勒冈州东南部及内华达州北部Alvord Basin区域的Alvord丘头鱼与Borax Lake丘头鱼遗传结构研究数据，通过RAD测序技术获取遗传变异信息，分析种群遗传结构、物种间亲缘关系及演化历史，包含8个相关文件。 文件详解 数据文件 文件名称：Data1_batch_1.catalog.tags.tsv...
-
波罗等人基于绿海葵_Anemonia_viridis_共生菌获取遗传数据_补充资料
数据集概述 本数据集为Porro et al.关于地中海蛇锁海葵（Anemonia viridis）共生菌水平获取机制研究的补充数据，包含宿主动物单核苷酸多态性（SNPs）数据、共生菌ITS2序列数据及共生菌组成表格，用于分析宿主与共生菌群落的关联模式及水平获取能力。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
-
CFR植物生物多样性热点地区Restio_capensis种群分化基因组学研究数据
数据集概述 本数据集聚焦南非开普植物区（CFR）特有植物Restio capensis，通过叶绿体DNA序列和RAD测序获得的14400余个核DNA多态性位点，结合空间、气候及植物地理数据，分析种群分化驱动因素。结果显示环境隔离（IBE）而非地理距离隔离（IBD）是主要驱动因素，为分子生态学研究提供支撑。 文件详解...
-
Anopheles_gambiae_Based_冈比亚按蚊染色体倒位选择靶点机器学习识别研究数据
数据集概述 本数据集围绕冈比亚按蚊染色体倒位选择靶点识别展开，包含RAD测序数据的分析结果及相关辅助文件。聚焦2La、2Rb等多态性倒位，通过机器学习方法识别选择靶点，对比传统离群值分析，揭示干湿栖息地相关倒位的选择模式，为疟疾媒介快速适应研究提供数据支持。 文件详解 SamplingInfo.csv（CSV格式）...
-
RAD_sequencing_Zebra_Finch_Genome_留尼汪灰绣眼鸟SNP标记数据
数据集概述 本数据集通过RAD测序技术结合与斑胸草雀基因组比对，为非模式雀形目鸟类留尼汪灰绣眼鸟生成大量SNP标记。研究使用6个混合样本池测序，构建约60万个contigs，其中38.6万个可比对至斑胸草雀基因组，最终获得8万余个可准确定位且分布均匀的SNP标记，展示了该方法在非模式鸟类中高效开发SNP的潜力。 文件详解...
-
RAD_SNP_Lontra_canadensis_Based_北美河獭种群监测用SNP阵列开发数据
数据集概述 本数据集围绕北美河獭（Lontra canadensis）的SNP开发展开，包含通过RAD测序发现的20,772个SNP位点信息，以及经筛选后开发的52个SNP qPCR基因分型检测方案相关内容，可支持河獭种群的遗传监测与个体识别研究。 文件详解 文件名称：StetzEtAl_River_otter SNPs_COGR_si.docx...
-
MPB_Dendroctonus_ponderosae_山松大小蠹生殖隔离与环境适应系统地理学研究数据
数据集概述 本数据集基于北美西部山松大小蠹全分布区的RAD测序数据，分析Y染色体单倍型与常染色体、X连锁位点的系统地理差异，揭示生殖隔离、环境适应对种群分化的作用，以及更新世冰期避难所与冰后期扩张的历史。数据含4个文件，支持种群遗传结构与环境适应性研究。 文件详解 集合信息文件 文件名称：S2CollectionInformation.xlsx...
-
Salvelinus_fontinalis_Based_加拿大魁北克Brook_Charr遗传影响预测数据
数据集概述 本数据集聚焦加拿大魁北克Brook Charr（Salvelinus fontinalis）人工放流的遗传影响研究，通过RAD测序获取29个湖泊862个样本的4580个高质量SNP位点数据，结合放流历史、水温等环境变量建模，分析放流对野生种群遗传完整性的影响，揭示放流停止后种群遗传恢复潜力。 文件详解...
-
蛾类属系统发育基因组学信息缺失模式与多基因座桑格数据比较数据集
数据集概述 本数据集围绕蛾类属Eupithecia的系统发育研究展开，对比了RAD测序与多基因座桑格测序的系统发育假设，分析了RAD数据的基因座缺失效应及其对系统发育信息（SNP、PIS）的影响，包含研究相关的代码、补充材料和图表文件。 文件详解 该数据集包含三类文件，具体说明如下： - 代码文件（.r格式）： -...
-
黄铜色环蝶物种界定基因组数据分析数据集
数据集概述 本数据集围绕黄铜色环蝶（Erebia tyndarus复合体）的物种界定研究，包含基因组测序数据、基因型聚类结果、地理与形态测量数据及相关分析文档，用于检验传统物种属性与当代基因组数据的匹配性。 文件详解 基因组分析文件：...
-
太平洋鲱鱼种内DNA污染与漂白去污对RAD测序及群体遗传统计影响数据集
数据集概述 本数据集围绕太平洋鲱鱼样本的种内DNA污染问题展开，验证漂白去污方法对限制位点相关DNA（RAD）测序的有效性，以及污染对群体遗传统计结果的影响，为海洋鱼类群体遗传研究中的样本处理提供数据支持。 文件详解 文件名称：README_for_DataS1.pdf 文件格式：PDF（.pdf）...
