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酵母有丝分裂双链断裂中异源双链DNA长度调控数据集
数据集概述 本数据集包含酵母有丝分裂双链断裂过程中异源双链DNA（hetDNA）长度调控研究的原始测序数据及相关文件，涉及多种酵母菌株的PacBio原始测序数据和条形码序列，为解析不同基因（如mlh1、mre11等）对hetDNA长度的调控机制提供基础数据。 文件详解 条形码序列文件（TXT格式，共10个）： 示例文件：Barcodes for...
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杜鹃花目被子植物系统发育历史生物地理学与多样化数据集
数据集概述 本数据集是Rose等（2018）发表于《Molecular Phylogenetics and Evolution》的相关研究数据，包含杜鹃花目被子植物系统发育分析、BioGeoBEARS生物地理学分析和BAMM多样化分析的输入文件，为研究杜鹃花目演化关系及地理分布提供支持。 文件详解 数据集包含4个目录共10个文件，具体说明如下： -...
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抗体亲和力预测用中和数据与ENV序列比对数据集
数据集概述 该数据集包含用于预测抗体亲和力的中和数据（IC50值）及HIV ENV基因序列比对数据，适配人工神经网络模型。中和数据样本源自相关研究，ENV序列来自HIV序列数据库，共4907条序列，比对长度为1369。 文件详解 文件名称: Neutralization_data_-_sample.csv 文件格式: CSV 字段映射:...
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孟加拉国砷污染含水层微生物群落结构与砷生物地球化学支持信息2017
数据集概述 本数据集是2017年MBio期刊发表的关于孟加拉国两个砷污染含水层微生物群落结构与砷生物地球化学研究的补充支持信息，包含多种格式的实验数据、文档及序列文件，为研究提供详细补充资料。 文件详解 该数据集包含9个文件，具体说明如下： - 文档类文件： - Gnanaprakasam et al MBIO 2017...
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锌抗病毒蛋白对感染脊椎动物RNA病毒基因组组成的影响数据集
数据集概述 本数据集围绕锌抗病毒蛋白（ZAP）对感染脊椎动物RNA病毒基因组组成的影响展开，包含系统发育分析、蛋白结构、病毒组成等多维度数据，支撑研究ZAP起源进化及与病毒基因组CpG抑制的关联。 文件详解 该数据集包含多个目录及文件，具体说明如下： - 病毒组成数据（Viral composition/ 目录）： -...
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巴拉圭冬青YMM1核基因组注释关联数据集
数据集概述 该数据集包含巴拉圭冬青（Ilex paraguariensis）YMM1核基因组注释的关联数据，涵盖基因预测、基因注释及组装转录本列表三类文件，为基因组功能解析提供基础数据支持。 文件详解 基因预测文件（共16个）： 文件示例：BRAKER3 37732 gene models.gff.gz、Augustus (1) 33227 gene...
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双孢虫草预测基因集
数据集概述 本数据集包含双孢虫草（Ophiocordyceps bispora）的预测基因集，来源于其基因组测序草案数据，关联ENA数据库特定登录号，为研究该物种的基因结构与功能提供基础数据支持。 文件详解 O.bispora_predicted_genes.fasta：FASTA格式文件，可能存储双孢虫草预测基因的核苷酸序列...
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西班牙国家公园海洋底栖群落入侵藻类影响元条形码数据集2017
数据集概述 该数据集包含西班牙两个国家公园硬底浅海海洋底栖群落的元条形码数据，通过COI Leray-XT和18S_allshorts（V7区域）引物组获取，对比三种入侵海藻群落与其非入侵对照群落，分析不同粒径组分的群落效应。 文件详解 样本元数据文件： Samples...
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伪黑珊瑚从头双端转录组组装的序列长度评估数据集
数据集概述 本数据集是通过SeqLengthPlot工具对伪黑珊瑚（Savalia savaglia）从头双端转录组组装结果进行序列长度评估的输出文件集合，包含转录组序列的长度分布统计数据、分类序列文件及可视化图表，共七个文件。 文件详解 数据集包含一个目录及其下的七个文件，具体说明如下： - 目录:...
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鳉科鱼类系统基因组学分析数据集
数据集概述 该数据集包含基于RNA测序数据的鳉科（Fundulidae）系统基因组学分析数据，涵盖十六种内群鳉科鱼类及参考外群的152个基因的组装、拼接与比对序列，支持系统发育关系研究。 文件详解 核心分析文件：...
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Lymexyloidea与Mordelloidea系统基因组学数据集
数据集概述 本数据集为Lymexyloidea与Mordelloidea（鞘翅目：多食亚目：扁甲总科）系统基因组学研究的支撑数据，包含甲虫转录组与基因组的蛋白质序列比对文件、序列裁剪结果及系统发育树分析结果，用于相关研究论文的结果计算。 文件详解 该数据集包含12个文件，分布在2个目录中，具体说明如下： - 主目录文件： -...
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冠状病毒重塑成熟人类转运RNA组以促进感染数据集
数据集概述 本数据集围绕人类冠状病毒重塑宿主成熟转运RNA组（tRNAome）的机制展开，包含7种冠状病毒的密码子使用分析、宿主tRNA组定量数据及氨基酸剥夺/酶敲低实验结果，揭示不同冠状病毒对宿主tRNA组的调控模式差异，为病毒-宿主相互作用研究提供支撑。 文件详解 该数据集按研究图表分类存储，核心文件说明如下： -...
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抗体工作表与FASTA文件数据集
数据集概述 本数据集包含抗体实验相关的工作表文件和蛋白质组数据搜索用的FASTA文件，涵盖实验背景信息、孔板布局、荧光染色曝光时间、抗体列表及蛋白质组序列数据，为抗体实验与蛋白质组分析提供支持。 文件详解 文件名称：Document S1_Antibody worksheet.xlsm 文件格式：XLSM (.xlsm)...
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恒河猴热量限制肝脏反应分子谱数据集
数据集概述 本数据集包含恒河猴在热量限制（CR）条件下肝脏反应的分子谱数据，基于威斯康星大学麦迪逊分校1989年启动的研究中雄性恒河猴的肝脏活检样本，涵盖RNA-Seq、脂质组学、代谢组学等多组学数据，用于分析短期CR的纵向分子变化。 文件详解 该数据集包含4个文件，具体说明如下： - 数据文件（.xlsx格式）： -...
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本科生物化学实验课程数据集_串联质谱与X_Tandem分析
数据集概述 本数据集专为本科生物化学实验课程设计，聚焦串联质谱技术及在Google Colab平台运行X!Tandem分析工具的教学应用。包含样本MS/MS数据及运行X!Tandem所需的配置文件，为学生实践提供完整数据支持。 文件详解 文件目录: Dataset for an undergraduate biochemistry laboratory...
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热带鲨鱼多样性环境DNA序列数据集2017
数据集概述 该数据集为2017年研究中使用的热带鲨鱼多样性环境DNA（eDNA）序列数据，包含经质量过滤、双端比对和长度筛选后的唯一序列，未经过聚类或分类学分配，记录了样本读取丰度、总读取数和序列长度等信息。 文件详解 文件名称: SHAK.new.fasta 文件格式: FASTA（.fasta） 内容说明:...
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猪带绦虫遗传分析数据集
数据集概述 本数据集包含用于猪带绦虫遗传分析的相关数据，支持题为《日本猪带绦虫的系统发育特征：对其神秘进化史的启示》的研究。数据涵盖基因序列、系统发育分析文件、图表及补充表格等，为猪带绦虫的进化与遗传研究提供基础资料。 文件详解 该数据集按研究图表和内容分类组织，具体文件说明如下： - 基因序列文件（.fasta格式）： -...
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土壤线虫OTU序列及代表性OTU序列数据集
数据集概述 该数据集包含通过MiSeq焦磷酸测序法从日光温室土壤线虫总DNA样本中获取的土壤线虫18S rDNA序列，以及对应的代表性OTU序列，为土壤线虫群落结构研究提供分子数据支持。 文件详解 文件名称: Soil nematode OTUs sequences.fasta 文件格式: FASTA (.fasta) 内容说明:...
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马来西亚黄带燕弄蝶线粒体基因组完整数据集
数据集概述 本数据集包含马来西亚黄带燕弄蝶（Hasora schoenherr）的完整线粒体基因组序列，通过二代测序技术获得，总长15353bp，涵盖13个蛋白编码基因、22个转运RNA、2个核糖体RNA及1个控制区，已在GenBank注册（登录号PQ149492）。 文件详解 文件名称：Complete mitogenome of Hasora...
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萨拉托加温泉数据集
数据集概述 该数据集是Lollar等人研究的支持数据，围绕萨拉托加温泉的地质微生物学展开，包含原始测序数据、处理后的OTU表、分类学信息、多样性分析结果、元数据及分析代码等，为温泉环境微生物群落研究提供全面数据支持。 文件详解 该数据集包含多个目录和文件，具体说明如下： - 根目录文件： - Data...
