数据集 - 海数据

Artocarpus_spp_基于转录组的面包果驯化正向选择分析数据

2026年1月23日

数据集概述本数据集是面包果（Artocarpus altilis）及其野生近缘种驯化过程中正向选择的转录组筛选研究数据，包含转录组组装、变异检测及系统发育分析相关文件，可用于识别面包果驯化相关的候选基因，支撑改良品种开发与种质资源保护研究。文件详解文件名称：breadfruit.vcf.gz 文件格式：VCF（压缩格式）...

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CX_5461_第一阶段试验中DNA修复缺陷实体瘤患者的变异性分析报告

2026年1月22日

数据集概述本数据集包含CX-5461（首创新型G-四链体稳定剂）I期临床试验中，DNA修复缺陷晚期实体瘤患者的变异位点数据（Variant Calls），对应试验编号为CCTG IND.231。数据集共88个文件，涵盖患者样本的变异位点信息及数据映射文件，可用于分析药物相关的基因变异特征。文件详解变异位点文件（VCF格式）...

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Undaria_pinnatifida_Based_群体基因组学研究数据

2026年1月22日

数据集概述本数据集为引入栽培太平洋海带Undaria pinnatifida的群体基因组学研究数据，包含码头、养殖场及自然岩礁三种栖息地种群的遗传信息。通过RAD-seq和微卫星两种方法分析，探究栖息地对种群遗传多样性、连通性及野外定殖的影响，共含2个文件。文件详解 Guzinski-et-al-Undaria-RADseqVCF file.vcf...

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Midas_cichlids_Based鱼类嘴唇形态驱动物种形成研究数据

2026年1月22日

数据集概述本数据集为中美洲丽鱼科鱼类（Midas cichlids）嘴唇形态分化研究相关数据，包含野外围栏实验、觅食行为、形态测量、遗传变异等多方面数据，用于探究肥厚嘴唇性状在物种形成早期阶段的作用，涉及尼加拉瓜多个湖泊的种群样本，共包含10个文件。文件详解野外实验数据文件（.xlsx格式）...

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Hucho_taimen_Based_哲罗鲑转录组从头组装与特征分析数据

2026年1月21日

数据集概述本数据集为哲罗鲑（Hucho taimen）的转录组从头组装与特征分析结果，包含转录组序列、功能注释、基因家族分析、正选择基因鉴定及微卫星标记等数据，共11个压缩文件，可用于研究该濒危物种的保护遗传学、系统发育及进化机制。文件详解文件名称：Index_and_primers_for_genotype.zip 文件格式：ZIP...

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SNP_Discovery_Based_蓝鲶鱼野生与养殖群体遗传标记数据

2026年1月21日

数据集概述本数据集记录了蓝鲶鱼野生与养殖群体的SNP标记发现与验证过程，通过基因分型测序技术对5个群体190个个体进行分析，筛选出4275个SNP位点，并使用Sequenom MassARRAY验证了64个SNP标记。数据包含合并的SNP文件及说明文档，支持蓝鲶鱼群体遗传结构分析与遗传标记开发。文件详解...

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Amphiprion_clarkii_黄尾小丑鱼基因组空间选择信号研究数据

2026年1月21日

数据集概述本数据集聚焦黄尾小丑鱼（Amphiprion clarkii）从分布核心到北部边缘的基因组研究，包含38个文件，涉及元数据、基因频率、候选基因注释、群体遗传分析脚本及结果等内容，用于探究选择、基因流与遗传漂变的相互作用，揭示边缘种群的局部适应机制，尤其与年度最低海表温度相关的56个SNP位点及25个候选基因的适应性特征。文件详解数据文件...

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Taxus_baccata_Based_非模式树种多尺度适应性选择检测数据

2026年1月21日

数据集概述本数据集为非模式树种欧洲红豆杉（Taxus baccata L.）的多尺度适应性选择检测数据，整合表型与基因组信息，包含表型实验数据及基因组SNP数据，用于探究其局部适应分子基础及选择驱动因素，支持非模式物种适应性研究。文件详解基因组数据文件文件名称：taxus_filtered_HWE3.vcf 文件格式：VCF...

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Dryad_Pedicularis_dudleyi种群遗传学与进化历史数据

2026年1月21日

数据集概述本数据集包含加州红木林特有濒危植物Dudley's lousewort（Pedicularis dudleyi）的种群遗传学、种群动态及进化历史数据。通过ddRAD SNP和Sanger测序技术，分析其遗传多样性、种群结构、近期瓶颈效应及与近缘种P. rigginsiae的遗传分化，为濒危物种保护提供科学依据。数据集包含6个相关文件。...

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Alpine_ibex_Based_阿尔卑斯羱羊多年度测序批次效应研究数据

2026年1月21日

数据集概述本数据集为多年度高通量测序研究中的批次效应案例数据，涉及阿尔卑斯羱羊（Capra ibex）基因组分析。因测序读长变化与种群样本增量加入的非随机分布，导致数据产生假阳性选择信号。数据集包含变异位点文件、过滤工具及解复用文件，可用于研究批次效应对测序结果的影响及校正策略。文件详解...

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弗林索玛_Phrynosoma_物种的参考分类学_生物多样性及系统发育评估

2026年1月21日

数据集概述本数据集为角蜥属（Phrynosoma）物种的系统基因组生物多样性评估数据，包含ddRADseq和线粒体DNA等分子数据文件，用于构建参考分类框架，解决大短角蜥物种复合体的物种界定争议，支持物种树构建、分歧时间估算及种群遗传分析，共9个相关文件。文件详解文件名称：README.txt 文件格式：TXT...

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Dryad_Based所罗门群岛特有鸟类种群规模与遗传风险评估数据2021

2026年1月21日

数据集概述本数据集围绕所罗门群岛科伦班加拉岛两种特有绣眼鸟（Z. murphyi和Z. kulambangrae）展开，整合野外调查与基因组序列数据，对比分析成体种群数量（N）与有效种群数量（Ne），揭示种群遗传风险，为长期保护提供基线数据。文件详解说明文档...

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Ostrea_lurida_Based_北美西海岸种群结构与适应性研究数据

2026年1月21日

数据集概述本数据集围绕北美西海岸奥林匹亚牡蛎（Ostrea lurida）的种群结构、遗传连通性及适应性展开，通过13,424个单核苷酸多态性（SNPs）分析其区域种群结构、基因流障碍及适应性分化，含中性位点与235个候选选择位点数据，覆盖从加州南部到温哥华岛的物种分布范围，共9个文件。文件详解配置与参数文件文件名称：params-...

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Haplotype_Threading_Based_人类样本二倍体VCF数据

2026年1月20日

数据集概述本数据集包含三个人类样本的二倍体VCF文件，是论文“Haplotype Threading: Accurate Polyploid Phasing from Long Reads”的评估数据基础，用于生成多倍体数据集。数据包含通过样本自身及其父母的 trio 定相得到的金标准单倍型。文件详解文件名称：vcf-diploid.zip...

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Pooled_RNA_Seq_Based_田鼠等位基因频率估计准确性研究数据

2026年1月20日

数据集概述本数据集为验证混合RNA-Seq是否能准确预测真实等位基因频率的研究数据，以10只银行田鼠肝脏转录组为研究对象，对比单样本测序与混合样本测序的等位基因频率差异，包含参考转录组、基因型数据、频率估计结果及分析脚本等9个文件。文件详解参考转录组文件文件名称：C3W_final_transcriptome.fasta 文件格式：FASTA...

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Zostera_marina_Based_系统地理分化与转录组热适应研究数据

2026年1月20日

数据集概述本数据集围绕全球重要海草Zostera marina展开，聚焦其跨热梯度种群的系统地理分化与转录组热适应机制。通过空间代时间设计，在欧洲和北美沿岸南北种群的公共花园中模拟热浪，记录控制、热应激及恢复阶段的转录组响应，包含约1.3万个注释基因数据，可用于解析热适应的分子基础及系统地理分化对适应的影响。文件详解...

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BRCA_CN_Supplementary_Data_实验验证与复现补充数据

2026年1月20日

数据集概述本数据集为BRCA-CN相关实验提供验证与复现的测试数据，需结合开源资源使用。包含4个文件，覆盖压缩包、表格、JSON、VCF等格式，可支持论文所述实验的结果验证与流程复现。文件详解 Supplementary_Data.zip 文件格式：ZIP 内容说明：压缩包文件，具体内容需解压后查看...

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Citrus_Genetic_Basis_柑橘杂交驯化细胞质核冲突研究数据集

2026年1月20日

数据集概述本数据集围绕柑橘杂交、驯化及多样化过程中的细胞质核冲突遗传基础展开，包含184份样本的叶绿体、线粒体及核基因组变异图谱，线粒体异质性分析序列，基因表达归一化数据，GWAS分析文件，基因注释结果及基因组组装文件等，共14个文件，为柑橘细胞质核互作机制研究提供全面数据支撑。文件详解基因组变异图谱类...