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肾远曲小管转录因子Prox_1缺失与低镁血症关联数据集
数据集概述 本数据集围绕肾远曲小管中特异性删除转录因子Prox-1导致低镁血症的机制研究,包含原始研究文献、LC-MS/MS分析原始数据及实验相关元数据,为探索TRPM6和NCC表达变化与低镁血症的关联提供数据支持。 文件详解 原始研究文献文件: 10.1007_s00424-020-02491-1.pdf:PDF格式,为该研究的原始发表文献。 LC-...
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人类肠道噬菌体携带孢子形成基因数据集
数据集概述 本数据集围绕人类肠道噬菌体携带的孢子形成基因展开,通过挖掘基因组和肠道宏基因组,识别出噬菌体编码的与细菌孢子形成相关的基因(如spo0A等转录因子、染色体分区及DNA修复相关基因),为研究噬菌体对肠道细菌孢子形成的调控机制提供数据支持。 文件详解...
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子囊菌和担子菌真菌中转录因子流行率数据集
数据集概述 该数据集基于对77种子囊菌和31种担子菌真菌基因组的分析,涵盖37类调控因子家族的成员数量差异,以及64种子囊菌特征调控因子在108个基因组中的存在情况,揭示了两类真菌在调控因子家族和个体调控因子层面的显著差异,为研究真菌调控系统演化提供数据支持。 文件详解 文件名称: Figure3.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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scTFBridge转录因子结合先验数据集
数据集概述 该数据集包含转录因子(TF)基序结合先验数据,是深度学习模型scTFBridge的关键组成部分,用于生成转录因子-调控元件(TF-RE)掩码矩阵,以增强模型从单细胞多组学数据中推断基因调控网络的能力。 文件详解 文件名称:TF_RE_binding_matrix.zip 文件格式:ZIP压缩文件(.zip)...
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拟南芥冷响应转录组的可变剪接动态数据集
数据集概述 本数据集通过RNA测序分析拟南芥在低温胁迫下的转录组变化,聚焦可变剪接(AS)的动态响应。核心内容包括早期冷响应AS基因、转录因子及剪接调控因子的鉴定,揭示AS在植物低温适应中的作用,为研究植物低温耐受性的分子机制提供数据支持。 文件详解 该数据集包含17个文件,具体说明如下: - 数据文件(共16个,.xlsx格式): -...
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Msn2转录因子动态信息转导限制研究数据集
数据集概述 该数据集围绕酵母转录因子Msn2的激活动态(振幅与频率)展开,通过信息论量化其向靶基因传递的表达信息,分析启动子顺式元件调控及多基因信息整合对信息转导的影响,估算外噪校正后的信息转导上限。 文件详解 文件名称: README_for_Supplementary_Source_Data.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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神经_tube_类器官_人类胚胎_斑马鱼胚胎的TF_MInDi_bed文件集
数据集概述 该数据集包含针对神经 tube 类器官、人类胚胎及斑马鱼胚胎的TF-MInDi bed文件,所有文件以压缩包形式存储,未提供文件内容预览及说明文档。 文件详解 文件名称:zebrafish_bed.zip,文件格式:ZIP压缩包,无字段映射信息 文件名称:embryo_bed.zip,文件格式:ZIP压缩包,无字段映射信息...
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猪繁殖性状基因功能分析数据集_GWAS到后GWAS
数据集概述 本数据集围绕猪繁殖性状(如乳头数、均匀度、窝产仔数)展开基因功能分析,通过系统综述筛选14篇文献,结合结构变异数据,从2077个候选基因中筛选出306个构建生物过程与转录因子网络,重点识别窝产仔数和乳头数相关的关键候选基因与转录因子。 文件详解 该数据集包含21个文档文件,具体说明如下: - 文档文件: -...
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人胰腺ε细胞基因特征数据集
数据集概述 本数据集基于单细胞RNA测序技术,探究成人非糖尿病供体胰腺ε细胞的分子特征,包括转录因子、细胞表面受体及代谢通路相关基因,对比ε细胞与其他胰岛内分泌细胞的差异基因,为研究该罕见细胞类型的发育与功能提供资源。 文件详解 数据文件(共5个.xlsx格式文件): Supplemental table 1.xlsx:补充表1,存储ε细胞相关基因数据...
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肉牛饲料效率候选基因功能注释与鉴定数据集
数据集概述 本数据集为肉牛饲料效率候选基因功能注释与鉴定研究的补充材料,包含基因本体论(GO)富集分析结果表、研究文献特征表及生物过程网络等补充图表,支持从组学到后组学层面解析肉牛饲料效率相关基因功能。 文件详解 文件名称: Tabela S1- Informações sobre país, raça, constituição da amostra...
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植物氮信号传导与利用动态调控网络的时间转录逻辑数据集
数据集概述 本数据集聚焦植物氮信号传导与利用的动态调控网络,通过时间序列转录组数据分析,揭示氮响应基因的时间转录逻辑,构建包含155个转录因子和608个靶基因的高置信度调控网络,为氮利用效率研究提供基础数据。 文件详解 原始计数数据文件: RootRawCounts.txt:...
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普遍染色质开放元件分子机制与应用研究数据集
数据集概述 该数据集围绕普遍染色质开放元件(UCOE®)的分子机制展开,包含蛋白质与转录因子列表、生物过程富集分析结果、基因ID转换表及相关可视化图表,为理解UCOE功能及推动其生物技术应用提供数据支持。 文件详解 表格文件(.xlsx格式): Tables_A1_A2_A3.xlsx:包含三个表格 Table...
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六个豆科植物基因组中碱性亮氨酸拉链转录因子基因家族全基因组分析数据集
数据集概述 该数据集围绕六个豆科植物(大豆、蒺藜苜蓿、菜豆、鹰嘴豆、木豆、百脉根)的碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子基因家族展开全基因组分析,包含基因鉴定、系统发育分类、结构特征、表达模式及胁迫响应等核心数据,为研究豆科bZIP家族的分子功能与进化提供支持。 文件详解 文件名称: Phylogenetic tree of all bZIP...
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Cosby_et_al_2020_Based_脊椎动物转录因子转座酶捕获演化完整数据
数据集概述 本数据集是Cosby等人2020年研究论文《Recurrent evolution of vertebrate transcription factors by transposase capture》的补充数据,包含序列文件与实验结果文件,为研究脊椎动物转录因子通过转座酶捕获的演化机制提供补充资料。 文件详解 文件名称:...
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甘蔗茎秆转录因子系统数据集
数据集概述 本数据集围绕甘蔗茎秆转录因子系统(TFS)展开,包含15个相关文件,核心为14个PNG格式的图表文件及1个PDF补充文档,涉及生物量等生物学关键词,为甘蔗茎秆转录因子相关研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含15个独立文件,具体说明如下: - 文档文件: - supp_TFS.pdf: PDF格式文档,可能为补充说明文件 -...
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婴儿利什曼原虫JPCM5株拼接前导RNA_PSE启动子转录因子数据集
数据集概述 该数据集聚焦婴儿利什曼原虫(JPCM5株)的拼接前导RNA PSE启动子转录因子,包含该蛋白质的基础信息数据,为相关分子生物学研究提供支持。 文件详解 文件名称:LINF_260010900.txt 文件格式:TXT 字段映射:包含Wikidata编号、蛋白质名称(英文及西班牙文)、宿主生物等基础信息字段 适用场景...
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基因组序列转录因子结合位点数据集
基因组序列转录因子结合位点数据集_Genomic_Sequence_Transcription_Factor_Binding_Site_Dataset 数据来源:互联网公开数据 标签:基因组学, 生物信息学, 序列分析, 转录因子, 结合位点, 染色体, 机器学习, 基因调控 数据概述:...
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基因转录因子信息数据集GeneTranscriptionFactorInformation-visualcomments
基因转录因子信息数据集GeneTranscriptionFactorInformation-visualcomments 数据来源:互联网公开数据 标签:基因组学, 转录因子, 基因表达, 生物信息学, 基因注释, 蛋白质编码, 数据库, 结构化数据 数据概述:...
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基因序列比对与转录因子结合分析数据集GeneSequenceAlignmentandTranscriptionFactorBindingAnalysis-...
基因序列比对与转录因子结合分析数据集GeneSequenceAlignmentandTranscriptionFactorBindingAnalysis-renadalaa 数据来源:互联网公开数据 标签:基因组学, 生物信息学, 序列比对, 转录因子, Motif, 蛋白质结合, 生物序列, 数据分析 数据概述:...
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基因信息数据集
基因信息数据集 数据来源:互联网公开数据 标签:基因信息,人类基因,转录因子,激酶,细胞周期,基因ID,生物信息学,基因功能,疾病机制,药物开发 数据概述:...



