数据集 - 海数据

挪威西部中石器时代至新石器时代过渡时期石器生产文化变化贝叶斯系统发育分析补充数据集

2025年12月23日

数据集概述本数据集是期刊文章《挪威西部中石器时代至新石器时代过渡时期石器生产文化变化贝叶斯系统发育分析》的补充资料，包含分析所用的原始数据、代码文件及相关软件包，支持复现研究中的系统发育分析与图表生成。文件详解数据文件： main_data.zip：包含系统发育分析所需的核心数据，如用于BEAUti和BEAST的nexus文件 data for...

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嗜旱曲霉_曲霉亚属_系统发育与Restricti组分类修订数据集

2025年12月23日

数据集概述本数据集围绕曲霉亚属中Restricti组的分类修订展开，通过多基因位点测序、系统发育分析及表型研究，明确了该组21个物种（含14个新种）的分类边界，为嗜旱曲霉的物种鉴定与系统发育研究提供数据支持。文件详解该数据集包含22个文件，按类型分为以下几类： - 说明文档（.txt格式，共11个）： -...

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红衣主教唐纳雀属系统基因组学测序方法比较数据集

2025年12月23日

数据集概述本数据集围绕红衣主教唐纳雀属（Piranga）的系统基因组学研究展开，对比了RAD-seq和UCEs两种测序方法在不同分类水平下的系统发育推断效果，包含两种方法的测序数据、物种树分析结果及补充信息，为鸟类系统发育研究提供数据支持。文件详解压缩文件（.zip格式）： uce_raxml.zip：UCE数据的RAxML分析结果文件...

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北美及夏威夷高倍体紫罗兰物种网络与基因树推断数据集

2025年12月22日

数据集概述本数据集围绕北美及夏威夷高倍体紫罗兰（堇菜属）展开，通过基因树推断物种网络，解决多倍体系统发育无法用二叉树表示的问题。包含基因扩增数据、拓扑冲突分析及最简约物种网络构建结果，支持多倍体进化研究。文件详解文件名称: Online_appendix_1_BEAST_input_file.xml 文件格式: XML 内容说明:...

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沙特阿拉伯西南部吉赞和阿西尔地区利什曼病白蛉媒介鉴定补充材料数据集

2025年12月19日

数据集概述本数据集为沙特阿拉伯西南部吉赞和阿西尔地区利什曼病白蛉媒介鉴定研究的补充材料，包含基于形态学和分子技术整合方法的序列比对、系统发育分析及可视化文件，支持相关研究的复现与验证。文件详解该数据集包含十个文件，具体说明如下： - 系统发育分析文件： -...

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蛇尾纲高级分类系统重建的广域系统基因组学数据集

2025年12月19日

数据集概述本数据集基于广域系统基因组学方法，重建现存蛇尾纲（Ophiuroidea）的高级分类系统。通过外显子捕获技术从576个物种的博物馆标本中获取基因序列，构建系统发育树，并据此修订分类体系，包含分类修订方案、系统发育树、分布数据及补充图表等13个相关文件。文件详解说明文档与分类修订：...

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基于最小二乘准则的快速定年算法数据集

2025年12月14日

数据集概述本数据集围绕基于最小二乘准则的快速定年算法展开，针对大型系统发育树（如含数千分类群的病毒数据），提出近线性时间复杂度的定年方法，可估计替代率、祖先节点日期及根位置，支持带时间采样的序列数据，提供约束与非约束两种设置的算法实现。文件详解文件名称:...

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岛屿植物分类群多样化动态与海洋岛屿生物地理学通用动态模型数据集

2025年12月11日

数据集概述本数据集围绕岛屿植物分类群Cyrtandra的多样化动态展开，验证其是否符合海洋岛屿生物地理学通用动态模型（GDM）预测。核心内容包括生物地理分析、扩散方向推断及多样化速率模拟，覆盖东南亚及太平洋岛屿区域，提供多类型分析文件与结果。文件详解说明文档与数据描述: README.md:...

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东太平洋深渊矿区蛇尾类生物多样性数据集

2025年12月11日

数据集概述本数据集聚焦东太平洋克拉里昂-克利珀顿断裂带（CCZ）和秘鲁海盆的蛇尾类（ brittle-stars）生物多样性研究，通过DNA序列分析揭示深渊蛇尾类的系统发育多样性，包括至少三个未知的古老进化支系，为深海矿区环境管理和生物多样性评估提供科学数据支持。文件详解说明文档:...

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基因流对物种树估计影响的模拟研究数据集

2025年12月11日

数据集概述该数据集基于模拟研究，探究基因流与不完全谱系分选对物种树估计的影响。通过模拟不同模型、规模、时间尺度和迁移率下的多基因座序列数据，分析贝叶斯方法及汇总统计方法对物种树拓扑结构、种群大小和分化时间的估计误差，为系统发育研究提供数据支持。文件详解文件名称: Supplemental Materials.pdf 文件格式: PDF...

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Manilkarinae亚族分化时间估算表

2025年12月11日

数据集概述该数据集是关于山榄科Manilkarinae亚族内类群分化时间的估算表，包含关键节点的平均分化年龄（百万年）及95%最高后验密度区间数据，为研究该类群的系统发育关系提供时间尺度支持。文件详解文件名称: table.html 文件格式: HTML (.html) 文件内容: 表格数据包含以下字段映射：...

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树懒系统发育宏进化趋势与历史生物地理数据集

2025年12月10日

数据集概述该数据集基于树懒形态数据超矩阵，通过贝叶斯推断、系统发育与形态钟方法分析64种树懒属的演化。核心内容包括不同支系分化时间、多样性、形态差异及生物地理历史，支持常见树懒类群分支分类，提供分子方法无法测定的主要分支分化时间估计。文件详解数据矩阵文件： Matrix.nex：NEX格式数据矩阵，包含树懒形态特征超矩阵数据贝叶斯分析文件：...

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BEAST计算性能与统计准确性及方法比较数据集

2025年12月6日

数据集概述本数据集围绕多物种溯祖模型下*BEAST方法的计算性能与统计准确性展开，通过模拟研究分析其与其他系统发育方法（如超级矩阵拼接法）的差异，探究基因座数量、分支长度等参数对结果的影响，为贝叶斯物种树估计的实践应用提供数据支持。文件详解 New Supplementary...

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Pilbara地区Bathynellidae科甲壳动物系统发育数据集

2025年12月6日

数据集概述本数据集为研究澳大利亚西部Pilbara地区Bathynellidae科甲壳动物的异域物种形成及古老起源提供分子系统发育分析数据。包含多个基因序列比对文件及构建的串联基因树，记录了不同基因片段的比对信息、最优模型及分析所用序列数量，支持RaxML、MrBayes和BEAST等方法的系统发育分析。文件详解文件名称: table.html...

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爬行动物胎生进化祖先状态重建与速率异质性数据集

2025年12月5日

数据集概述本数据集围绕爬行动物胎生进化研究，分析祖先状态重建中忽略进化速率异质性导致的异常结果，对比三种速率可变方法（随机局部时钟法、拆分BiSSE、隐藏速率模型）的重建效果，结合蜥蜴类爬行动物胎生进化实证分析及模拟验证传统模型不足。文件详解图表文件： Fig1_Expanded.pdf：PDF格式，扩展版图1...