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Pocillopora_Symbiodiniaceae_Based莫雷阿岛隐存珊瑚与共生体协同进化研究数据
数据集概述 本数据集为2019年8月在法属波利尼西亚莫雷阿岛采集的隐存珊瑚(Pocillopora spp.)及其共生体(Symbiodiniaceae)的协同进化与特异性研究数据,包含16个文件,涵盖基因组序列、系统发育树、样本元数据及分析代码,用于支撑相关论文的图表生成与数据分析。 文件详解 代码文件(.R格式) Figure 2...
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基于Euphonia和Chlorophonia的雀科鸟类线粒体基因组及超保守元件分类学与生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集包含Euphonia和Chlorophonia雀类(雀形目:燕雀科)的线粒体基因组序列、数千个超保守元件(UCE)序列及相关系统发育树文件,用于解析该类群的分类学关系与历史生物地理学。数据集涵盖样本元数据、序列矩阵、系统发育分析结果等12个文件,支持物种分类修订与生物地理历史重建研究。 文件详解 元数据与索引文件...
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Supplementary_material_1_Based_非本地天牛甲虫DNA元条形码技术基准测试补充数据
数据集概述 本数据集是论文《Benchmarking three DNA metabarcoding technologies for efficient detection of non-native cerambycid beetles in trapping...
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Fragile_foundations_Based_长期微气候影响下细木质残体与土壤细菌群落演替模式研究数据集
数据集概述 本数据集为论文配套的序列数据与元数据,聚焦长期微气候影响下细木质残体和土壤中细菌群落的演替模式,包含2012年样本的信息表及序列文件,共2个文件,用于支撑相关微生物生态学研究。 文件详解 Sample_info_for_2012_samples.xlsx 文件格式:XLSX...
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维得利珠单抗治疗CD患者的PBMC单细胞RNA测序与CD14_单核细胞_bulk_RNA测序处理计数数据集
数据集概述 该数据集包含维得利珠单抗治疗的CD患者相关RNA测序处理数据,涵盖PBMC单细胞RNA测序和CD14+单核细胞bulk RNA测序的处理计数,以及样本和细胞元数据,为研究治疗响应机制提供数据支持。 文件详解 bulkrnaseq.zip: 压缩文件,包含CD14+单核细胞的bulk RNA测序处理计数数据 scrnaseq.zip:...
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安乐蜥喉部扇色彩研究数据与R代码复现包
数据集概述 本数据集是研究论文《A Picture is Worth a Thousand Dollars: A photographic approach to studying color in anoles》的配套数据与代码包,包含喉部扇色彩数据、样本元数据、光谱文件及分析代码,支持论文结果的完整复现。 文件详解 分析代码文件:...
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酸奶与燕麦对肠道菌群影响的短链脂肪酸数据集
数据集概述 本数据集包含一项随机交叉干预研究的短链脂肪酸(SCFA)数据,研究通过让健康参与者分别每日摄入酸奶、酸奶+燕麦,分析其对肠道菌群及健康标志物的影响,重点关注个体反应与菌群稳定性。 文件详解 说明文档: README.md: Markdown格式的数据集说明文档,包含研究背景、数据处理方法及文件结构等信息 数据文件:...
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蜜蜂肠道微生物组宏基因组分析结果数据集_PRJNA977416
数据集概述 本数据集包含对PRJNA977416项目原始数据进行宏基因组Galaxy工作流分析的输出结果,涵盖分类学注释、功能信息及相关元数据与分析工作流文件,为蜜蜂肠道微生物组研究提供多维度数据支持。 文件详解 该数据集包含12个文件,具体说明如下: - 元数据文件: -...
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医院环境真菌评估的DNA宏条形码贡献数据集
数据集概述 该数据集围绕西班牙三家医院的环境真菌评估展开,结合DNA宏条形码与定量PCR技术,分析空气、表面、灰尘和土壤等样本的真菌群落多样性、组成及空气载量,对比培养法数据,揭示医院真菌组特征及影响因素。 文件详解 元数据文件:...
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热带城乡交错带本地与入侵小型哺乳动物宿主_微生物组关联数据集
数据集概述 本数据集包含热带城乡交错带小型哺乳动物的宿主-微生物组关联研究数据,涵盖16Sv4 rRNA基因测序数据、生物信息学分析脚本、样本元数据及统计分析文件,为探究宿主物种、环境因素与微生物组的关系提供支持。 文件详解 该数据集由测序数据清单、生物信息学文件、统计分析数据及脚本组成,具体说明如下: - 测序数据清单文件: -...
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比利时LUCAS生物点土壤生物多样性采样与eDNA宏条形码协议比较数据集
数据集概述 该数据集围绕比利时LUCAS生物点土壤生物多样性监测展开,对比2018年LUCAS协议与新开发的国家方法,测试不同采样深度、样本量、子样本数量及引物组合对土壤生物多样性检测的影响。数据集包含交互式Krona分类图表及样本元数据,用于可视化不同采样方案和引物下的类群多样性与相对丰度,为土壤生物多样性监测方法优化提供支持。 文件详解...
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HTSinfer_Supplementary_Materials_Based_生物信息学RNA测序元数据推断完整数据
数据集概述 本数据集包含用于测试HTSinfer工具的补充材料,HTSinfer是一款基于Python的工具,可从Illumina平台生成的批量RNA测序数据中直接推断元数据。数据集涵盖样本表、结果文件及功能对比表等。 文件详解 README.pdf:PDF格式,提供数据集相关说明...
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野生啮齿动物肠道微生物群与栖息地影响研究数据集
数据集概述 本数据集是关于"过去与当前栖息地对野生啮齿动物肠道微生物群影响"研究的配套数据与代码文件。包含研究分析工作流文件、QIIME2提取的输入数据文件及结果文件,为复现该研究的数据分析过程提供完整支持。 文件详解 分析工作流文件: RT_workflow.qmd:Quarto格式文件,包含完整的R代码实现...
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Ha等人关于生物防治线虫感染灰田蛞蝓的微生物组动态研究数据产品
数据集概述 该数据集是Ha等人关于生物防治线虫(Phasmarhabditis hermaphrodita)感染灰田蛞蝓的微生物组动态研究的数据产品,包含处理后的微生物组数据文件及补充材料,支持相关微生物组结构与变化的分析。 文件详解 该数据集包含处理后数据文件和补充材料,具体说明如下: - 处理后数据产品: -...
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四棘球海胆分类重新评估研究样本与基因库登录号数据集
数据集概述 本数据集为四棘球海胆(Tetrapygus niger)分类重新评估研究中的样本信息表,包含不同物种的采集地点、样本编号、坐标、28S与COI基因的GenBank登录号及参考文献等核心信息,支持棘皮动物分类学研究。 文件详解 文件名称:table.html 文件格式:HTML(.html)...
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马提尼克岛流域悬浮沉积物与土壤样本数据库_2022_2023
数据集概述 该数据集包含2022年6月至2023年7月期间,在马提尼克岛三个流域(加利翁河、莱扎尔德河、萨莱河)采集的悬浮沉积物与土壤样本数据及元数据,测量了放射性核素活度、同位素等多项属性,用于分析沉积物来源及污染物。 文件详解 数据文件(.xlsx格式):...
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Trichodesmium蛋白质鉴定宏基因组数据集2025
数据集概述 本数据集是Anderson等人2025年研究的补充数据,包含Trichodesmium宏基因组序列、KEGG注释、补充表格及图表,用于分析海洋不同区域资源可用性对该生物蛋白质丰度模式的影响,支持蛋白质组学相关研究。 文件详解 宏基因组与注释文件:...
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海洋固氮光合自养生物Trichodesmium与UCYN_A全球系统地理学及微多样性补充文件数据集
数据集概述 本数据集是关于海洋固氮光合自养生物Trichodesmium和UCYN-A的全球系统地理学及微多样性研究的补充文件,包含5个CSV格式的核心数据文件与1个PDF格式的补充文档,为相关研究提供数据支持。 文件详解 数据文件(CSV格式,共5个):...
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干旱胁迫下甘薯叶片转录组谱PCA分析数据集
数据集概述 本数据集为论文配套资源,支持图1a中干旱胁迫下甘薯叶片转录组谱的主成分分析(PCA)。包含基因表达矩阵、样本元数据、分析脚本、结果图表等文件,可复现实验结果,助力植物干旱转录组研究。 文件详解 该数据集包含一个压缩文件,内部具体文件说明如下: - 压缩文件:...
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深海克拉里昂_克利珀顿区细菌和古菌群落空间综合结果数据集
数据集概述 本数据集整合已发表结果与新数据,聚焦深海克拉里昂-克利珀顿区的细菌和古菌群落组成,覆盖深层海水、沉积物及多金属结核中的群落,包含15个相关文件,为研究该区域微生物空间分布提供数据支持。 文件详解 文档类文件: readme.txt:TXT格式,说明数据集文件内容...



