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Evaluation_蜘蛛RNA保存方法对转录组组装影响评估数据
数据集概述 本数据集为蜘蛛RNA保存方法对从头转录组组装影响的评估研究数据,包含3个文件。研究针对野外采集蜘蛛样本,测试不同温度、防腐剂及样本浸没状态对RNA质量及转录组组装结果的影响,为非模式生物(如蜘蛛)的野外样本保存提供指导。 文件详解 文件名称:18S_all_comp.fasta 文件格式:FASTA...
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Sebastes_Based岩鱼性别鉴定PCR_RFLP实验数据
数据集概述 本数据集包含用于Sebastes属8种岩鱼性别鉴定的PCR-RFLP检测实验相关文件,涵盖8种岩鱼的样本信息表及各物种雌雄个体在Sch.182255-210250基因座的DNA序列数据,共2个文件,为岩鱼性别鉴定研究提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:Sebastes-samples1.xlsx 文件格式:XLSX...
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硬珊瑚_Acropora_的共生藻多样性_454_焦磷酸测序数据
数据集概述 本数据集为西澳大利亚地理极端区域鹿角珊瑚(Acropora)共生藻(Symbiodinium)多样性与宿主特异性研究的相关数据,通过454焦磷酸测序技术获取,包含测序数据、分析文件、代码脚本等8个文件,用于分析珊瑚共生藻群落结构、多样性及宿主特异性。 文件详解 数据文件 文件名称:colonies.csv 文件格式:CSV...
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FMDV_Based_O型口蹄疫病毒持续感染牛基因组突变研究数据
数据集概述 本数据集为Litz等人研究的附加数据,聚焦O型口蹄疫病毒(FMDV)在牛持续感染过程中的基因组突变。包含7个文件,涵盖序列比对、元数据、进化树等类型,记录病毒基因组变异、样本信息及实验关联数据,支持病毒基因组进化与持续感染机制研究。 文件详解 CSV文件(共2个) 文件名称:NT_alignment_FMDV_ORF_consensus-...
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Abedinium_Source_单细胞转录组与进化分析补充数据
数据集概述 本数据集包含甲藻Abedinium的单细胞转录组学研究相关补充文件,涵盖两个物种(A. dasypus和新种A. folium)的转录组序列、系统发育分析比对文件、补充视频及电子表格,用于支撑其作为新早期分支甲藻谱系的研究结论,涉及转录组特征、质体功能及线粒体基因组等分析内容。 文件详解 转录组序列文件...
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hABC_Based_巴西东北部爬行动物群落同步种群变化估计数据
数据集概述 本数据集包含用于分析巴西东北部季节性干旱热带森林(Caatinga)爬行动物群落同步种群变化的遗传数据,涉及七种有鳞目动物和四种两栖动物。数据通过分层近似贝叶斯计算(hABC)模型,验证更新世干旱增加对相关物种多样化的影响,支持Caatinga在晚更新世扩张的结论。 文件详解 遗传序列文件(.fas格式,10个文件)...
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Dryad_Based高等白蚁肠道细菌群落结构与饮食关系研究数据
数据集概述 本数据集围绕高等白蚁肠道细菌群落结构展开,通过16S rRNA基因扩增子文库分析18种高等白蚁,探究饮食对其肠道细菌群落结构的影响。数据显示饮食是决定群落结构的主要因素,相同饮食组内同亚科白蚁肠道群落更相似,为微生物共生消化研究提供支撑。 文件详解 系统发育与分类数据文件...
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PR2_Based_温带湖泊纤毛虫群落古重建生态变化研究补充数据
数据集概述 本数据集是温带湖泊纤毛虫群落古重建生态变化研究的补充数据,包含PR2数据库的 curated 版本相关文件,用于高通量测序(HTS)数据的分类学分配,支持湖泊生态系统长期变化的研究。 文件详解 pr2_database_curation_procedure.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:记录PR2数据库 curated...
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Helianthus_Based_二倍体向日葵属系统发育研究数据
数据集概述 本数据集包含二倍体向日葵属(Helianthus)物种树估计的相关数据,基于37个物种/亚种的103个样本,通过目标富集技术获取170个基因进行系统发育分析。数据涵盖合并与联合分析结果,支持向日葵属三大分支(一年生分支、两个多年生分支)的划分,为研究该属进化、生态过程及形态特征演变提供基础。 文件详解...
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OGRDB_Based小鼠DBA_1J品系IGLV种系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠DBA/1J品系的IG受体种系参考数据,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB),包含DBA/1J IGLV的种系序列及相关文件,共4个文件,支持免疫受体基因组的研究与分析。 文件详解 数据文件(.fasta格式) 文件名称:1J...
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OGRDB_Based_人类IGH_VDJ免疫受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的人类IGH_VDJ免疫受体种系参考集,包含7个文件,涵盖FASTA格式的序列文件、JSON格式的元数据文件及许可说明文件,为免疫受体相关研究提供标准化参考数据。 文件详解 许可文件 文件名称:licence.txt 文件格式:TXT...
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M_roreri_Based可可病原菌交配基因与繁殖方式研究数据
数据集概述 本数据集围绕可可病原菌Moniliophthora roreri的交配基因与繁殖方式展开,包含该菌A/B交配位点的基因序列比对、系统发育分析用ITS序列比对及微卫星标记数据,用于支持其虽具有双等位基因交配位点但以克隆方式繁殖的研究结论,涉及47株全球地理分布菌株的遗传分析。 文件详解 Gblocks alignment of...
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基因表达与宿主_寄生虫相互作用_蚂蚁行为与寿命调控的分子机制数据
数据集概述 本数据集聚焦寄生虫诱导宿主表型改变的分子机制,对比被绦虫Anomotaenia brevis寄生的Temnothorax nylanderi蚂蚁工蚁、未寄生巢友及未寄生蚁群工蚁的脑基因表达模式,识别出400余个差异表达基因,涉及寿命延长、肌肉功能下调等表型相关机制,为寄生虫操纵宿主行为与生活史的近端机制研究提供基因表达与形态测量数据。...
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基于差异性渗入的野生小麦杂交区逆转录转座子基因渗入与重组研究数据
数据集概述 本数据集围绕野生小麦(Aegilops geniculata与Aegilops triuncialis)杂交区的逆转录转座子展开,包含实验与自然杂交种群的基因数据,旨在分析生殖隔离机制下逆转录转座子的基因渗入模式与基因组重组特征,为物种完整性维持研究提供支持。 文件详解 文件名称:SampleCode.xlsx 文件格式:XLSX...
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OGRDB_Based_AKR_J小鼠IGLV受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于开放种系受体数据库(OGRDB)的小鼠AKR/J亚群IGLV受体种系参考集,包含4个相关文件,涵盖种系序列的带间隙、无间隙FASTA格式文件、JSON格式数据及许可文件,为免疫受体序列分析提供标准化参考数据。 文件详解 J IGLV_rev_1_gapped.fasta 文件格式:FASTA...
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布里利安蒂亚属科迪波拉藻科新属种_太平洋珊瑚礁绿藻新属种研究数据
数据集概述 本数据集为太平洋南莱恩群岛偏远珊瑚礁发现的绿藻门刚毛藻目新属种Brilliantia kiribatiensis的研究关联数据,包含系统发育分析用的核酸序列文件、序列来源表格、藻类覆盖度调查表格及形态测量数据,支撑该新属种的分类学与生态学研究。 文件详解 核酸序列文件(.fasta格式,共7个)...
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Scaup_Based_小潜鸭与大潜鸭种群混合个体世代分类研究数据
数据集概述 本数据集聚焦小潜鸭(Aythya affinis)与大潜鸭(A. marila)种群的杂交现象,通过线粒体控制区序列和ddRADseq数据识别混合个体世代分类,分析基因流方向与强度,并通过模拟实验验证混合历史检测能力,为物种保护中杂交问题研究提供支持。 文件详解 R代码文件...
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Ledebouriinae_Based_植物历史生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集为Ledebouriinae属(天门冬科绵枣儿亚科)的历史生物地理学研究数据,涵盖195个类群(含86个内群类群)的系统发育重建、分化时间估算及生物地理分析结果,包含23个相关文件,支持探究该类群在撒哈拉以南非洲、马达加斯加及欧亚大陆的分布历史与演化机制。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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Caribbean_Based_加勒比红树林繁殖体扩散差异研究数据
数据集概述 本数据集围绕加勒比地区两种红树林(白红树Laguncularia racemosa与红树Rhizophora mangle)的繁殖体扩散差异展开,包含叶绿体基因组、核标记序列、海洋洋流数据及补充文档,用于研究海漂适应性陆生植物的遗传变异地理分布机制,涉及基因流、洋流影响等关键问题。 文件详解 基因组序列文件(.fasta格式)...
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Amblypygi_Based鞭蛛全球系统发育与DNA序列研究数据
数据集概述 本数据集为鞭蛛(Amblypygi)全球系统发育研究相关数据,包含DNA序列比对、UCE序列比对及说明文档,支持鞭蛛分子系统发育分析、分化时间估算等研究,共5个文件,覆盖3种文件格式。 文件详解 README.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:数据集说明文档,包含研究背景、数据采集与处理方法、文件内容说明等信息...



