找到23个数据集

格式: ZIP 标签: GTF

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  • Drosophila_simulans_M252_马达加斯加菌株基因组组装注释数据

    2026年1月14日 30 13 7

    数据集概述 本数据集包含马达加斯加起源的果蝇Drosophila simulans M252菌株的基因组组装与注释结果,该菌株来自D. simulans的祖先分布区。数据验证了M252基因组的高质量,记录了52%多外显子基因的可变剪接、70%基因的UTR注释、225个新基因及781个假基因,为果蝇遗传学研究提供资源。 文件详解...
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  • Lasallia_pustulata_Based_地衣真菌海拔梯度生物气候适应性分化研究数据

    2026年1月12日 30 210 169

    数据集概述 本数据集围绕地衣真菌Lasallia pustulata沿地中海海拔梯度的适应性分化展开,包含6个种群的基因组重测序数据及分析结果。通过检测高度分化的基因组区域、基因-环境关联,并结合生理实验验证,揭示其适应不同生物气候条件的遗传基础,涉及应激响应、环境适应及有性生殖相关基因。 文件详解 基因组分化与群体遗传分析文件...
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  • ENA_PRJEB62664_Symphonia_globulifera全基因组组装与注释数据

    2026年1月12日 30 163 160

    数据集概述 本数据集包含热带雨林物种Symphonia globulifera的从头组装核基因组、叶绿体基因组及线粒体基因组相关数据,涉及基因组组装、注释、编码序列提取及基因比对结果,可用于研究该物种的种内遗传变异特性,共包含7个文件。 文件详解...
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  • OryCun2_0_Based_家兔肾脏上皮细胞EHV_1感染时间进程扩展转录本注释数据2024

    2026年1月7日 30 88 50

    数据集概述 本数据集为基于CF_000003625.3_OryCun2.0参考基因组的扩展转录本注释GTF文件压缩包,数据来自家兔肾脏上皮细胞系感染马α疱疹病毒1型的时间进程实验,是2024年Tombácz等人相关研究的补充材料。 文件详解 文件名称:Supporting_Data_observed_transcripts.gtf.zip...
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  • Phytophthora_infestans_Based_爱尔兰马铃薯晚疫病病原菌效应分泌组注释数据

    2026年1月3日 30 17 11

    数据集概述 本数据集包含马铃薯晚疫病病原菌Phytophthora infestans T30-4菌株的效应分泌组注释信息,以及基因组组装和转录本注释文件。数据源自2009年公布的基因组序列,2015年起固定效应因子列表,采用PITG_xxxxx编号体系,可关联至GenBank组装版本GCA_000142945.1,支持植物病原菌效应蛋白的研究与分析。...
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  • Cactophilic_Drosophila_Genomes_Based_嗜仙人掌果蝇物种基因组及注释数据

    2025年12月30日 30 127 52

    数据集概述 本数据集包含嗜仙人掌果蝇物种的基因组序列、基因注释、转座元件(TE)注释及质量控制数据,用于支持“转座元件促进嗜仙人掌果蝇宿主转移相关基因进化”的研究。数据集涵盖多种果蝇物种的基因组组装、注释文件及测序质量控制文件,共27个文件,是研究果蝇基因组进化与功能的基础数据资源。 文件详解 基因组组装文件...
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  • Drosophila_Y_to_autosome_reversal_Genomic_changes_data

    2025年12月29日 30 41 13

    数据集概述 本数据集记录果蝇伪暗果蝇中Y染色体逆转自染色体后的基因组变化,包括约10-15百万年前祖先Y染色体与点状染色体融合事件的研究数据,涉及基因组组装、基因表达及注释等信息,共包含3个文件。 文件详解 文件名称:merged_de.gtf 文件格式:GTF...
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  • ewas_suite_Based_黑色素瘤耐药甲基化分析完整数据

    2025年12月22日 30 175 11

    数据集概述 该数据集是Galaxy Training Network教程的训练数据,用于分析Hugo等人2015年发表研究中的EWAS数据,识别与黑色素瘤MAPKi耐药相关的差异甲基化区域和位点,包含基因表达、表型等多类型文件。 文件详解 核心数据文件:...
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  • IF1Ty_IF1KO_IF1Over弓形虫株RNAseq分析脚本数据集

    2025年12月19日 30 188 128

    数据集概述 本数据集包含用于IF1Ty、IF1KO和IF1Over三种弓形虫株RNAseq分析的脚本、NGS文库质量控制文档及参考基因组文件,支持基因表达分析流程的复现与验证。 文件详解 文件名称: ToxoDB-65_TgondiiME49_Genome.fasta,文件格式: FASTA,内容: 弓形虫ME49株v65版本参考基因组序列 文件名称:...
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  • 长读长蛋白质基因组学增强蛋白质异构体表征测试数据集

    2025年12月15日 30 195 63

    数据集概述 该数据集为长读长蛋白质基因组学方法提供测试数据,该方法整合长读长RNA测序与质谱蛋白质组学数据以增强蛋白质异构体表征,包含转录本、肽段、基因注释等相关测试文件。 文件详解 该数据集包含122个文件,主要类型及示例如下: -...
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  • 帚虫基因组支持触手冠动物单系性数据集

    2025年12月14日 30 56 16

    数据集概述 本数据集包含帚虫Phoronis australis的染色体水平基因组组装、基因模型及转录组数据,还涵盖腕足动物、苔藓动物等相关物种的基因模型与转录组组装,为研究触手冠动物(Lophophorata)的单系性提供基因组结构与转录组表达证据。 文件详解 帚虫(Phoronis australis)相关文件:...
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  • 大鼠lncRNA_Bdnf_as定位扩展补充材料数据集

    2025年12月13日 30 30 2

    数据集概述 本数据集是“Mapping rat lncRNA Bdnf-as”研究的扩展补充材料,包含序列比对文件、BAM文件、从头组装GTF文件等,为大鼠长链非编码RNA Bdnf-as的定位研究提供支持。 文件详解 该数据集包含20个文件,具体说明如下: - 序列比对与组装文件: -...
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  • 甲壳动物肢体发育与再生基因表达动态补充数据集

    2025年12月12日 30 143 26

    数据集概述 本数据集为《甲壳动物肢体发育与再生过程中的基因表达动态》研究论文的补充数据,包含基因表达量、聚类分析结果、序列注释等多类型文件,支持论文结论的验证与扩展分析。 文件详解 数据文件(CSV格式,共26个):...
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  • IF1Ty_IF1KO_IF1Over弓形虫株RNAseq分析脚本

    2025年12月12日 30 191 119

    数据集概述 本数据集包含用于IF1Ty、IF1KO和IF1Over三种弓形虫株RNAseq分析的脚本文件、NGS测序文库质控报告及参考基因组文件,为该实验的转录组数据分析提供了完整的计算流程支持。 文件详解 分析脚本文件(.sh格式,共3个): 1_mkindices_STAR_Tg_ME49_v65.sh:用于构建STAR比对索引的脚本...
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  • 南美牡蛎基因组草图数据集

    2025年12月10日 30 131 14

    数据集概述 该数据集包含南美牡蛎(Crassostrea gasar和Crassostrea rhizophorae)的基因组草图相关文件,涵盖基因组组装注释结果、实验图表及数据表,为大西洋西南部牡蛎养殖研究提供关键资源。 文件详解 gasar_annotation.gtf.bz2: .bz2压缩格式,可能包含Crassostrea...
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  • 多样性远交系小鼠肝脏性别偏向性lncRNA与性别相反基因共表达网络负相关数据集

    2025年12月7日 30 179 70

    数据集概述 本数据集围绕多样性远交系(DO)小鼠肝脏中性别偏向性长链非编码RNA(lncRNA)展开研究,分析其与性别相反基因共表达网络的负相关关系,包含基因结构、表达模式及垂体切除响应类别的调控机制相关数据。 文件详解 README文件(PDF格式): README_for_Suppl Figs...
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  • 绵羊免疫相关长链非编码RNA转录组学荟萃分析数据集

    2025年12月6日 30 123 74

    数据集概述 本数据集为绵羊免疫相关长链非编码RNA(lncRNA)转录组学荟萃分析研究的补充数据,包含lncRNA注释文件、基因表达量数据及研究相关的补充表格与材料,支持对绵羊免疫应答中lncRNA功能的深入分析。 文件详解 基因注释文件(GTF格式): lncrnas.gtf:所有新发现lncRNA转录本的注释文件...
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  • 外源性化学物暴露大鼠肝脏长非编码RNA调控网络数据集

    2025年12月4日 30 172 10

    数据集概述 本数据集围绕外源性化学物暴露对大鼠肝脏长非编码RNA(lncRNA)调控网络的影响展开,包含通过RNA-seq技术分析27种不同作用机制化学物处理后,大鼠肝脏中lncRNA与蛋白编码基因的表达及相互作用数据,为研究外源性化学物的转录组干扰效应提供支持。 文件详解 转录组结构文件:...
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  • 阿利亚尼科与法兰吉娜葡萄品种序列多态性结构变异及泛转座子数据集

    2025年11月28日 30 39 26

    数据集概述 本数据集包含阿利亚尼科(AGL)和法兰吉娜(FA)两个葡萄品种的基因组数据,涵盖重构基因组的FASTA序列及对应的GTF格式注释文件,为研究葡萄品种的遗传特征提供基础数据支持。 文件详解 数据集包含一个目录下的四个压缩文件,具体说明如下: - 阿利亚尼科品种相关文件: -...
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  • 生物信息学数据处理与分析数据集Bio-informaticDataset-shivammishra3

    2025年4月26日 30 100 54

    生物信息学数据处理与分析数据集Bio-informaticDataset-shivammishra3 数据来源:互联网公开数据 标签:生物信息学,数据处理,数据集,基因分析,机器学习,生物医学,数据分析,计算生物学 数据概述: 该数据集包含来自生物信息学研究领域的相关数据,记录了基因序列,蛋白质结构,基因组注释等生物信息学核心内容。主要特征如下:...
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