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DPPC_Slipids_Based_全水合磷脂双分子层MD模拟数据_原始文件
2026年1月20日 30 31 5
数据集概述 本数据集包含全水合DPPC磷脂双分子层的分子动力学（MD）模拟轨迹及相关文件。采用Slipids力场与Gromacs 4.6.6软件，模拟条件为温度323K、128个脂质分子、3840个TIP3P水分子，共10个文件，涵盖模拟参数、结构、轨迹等关键数据。 文件详解 力场与拓扑文件...
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二价阳离子与磷脂酰肌醇结合诱导双层膜纳米簇起始的离子特异性数据集
2025年12月19日 30 61 46
数据集概述 本数据集包含基于全原子分子动力学模拟的研究数据，核心探究二价阳离子（如钙、镁）与磷脂酰肌醇（如PI(4,5)P2、PI(3,5)P2）的相互作用机制，以及其对双层膜纳米簇起始的离子和异构体特异性影响，为膜信号复合物形成的分子机制研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含16个文件，涵盖模拟输入、结构、输出及说明文档，具体如下： -...
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亚平宁棕熊ND5亚基G527E突变线粒体复合物I分子动力学模拟数据集
2025年12月19日 30 62 7
数据集概述 本数据集包含亚平宁棕熊线粒体复合物I ND5亚基G527E突变的分子动力学模拟后处理数据，对比野生型、对照型及突变型三个系统的结构与功能特征，支持相关生物能量学研究的验证与可重复性。 文件详解 该数据集为压缩包文件，内部包含按分析主题分类的目录，具体如下： - 文件名称: Apennine_Brown_Bear.zip - 文件格式:...
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DPPC双层膜全水合分子动力学模拟轨迹及相关文件
2025年12月13日 30 144 24
数据集概述 该数据集包含DPPC脂质双层膜在全水合条件下的分子动力学模拟轨迹及相关文件，基于GROMOS 53A6_L力场和Reaction Field静电计算方法，模拟时长100纳秒，温度323K，含128个DPPC分子与5841个水分子，为膜结构研究提供数据支持。 文件详解 文件名称: md.tpr，文件格式:...
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聚合物_脂质溶液分子动力学模拟的RNN预测数据集2022
2025年12月8日 30 113 53
数据集概述 本数据集包含用于研究聚合物-脂质溶液分子动力学模拟的文件与脚本，涉及GROMACS拓扑结构、初始结构文件，以及用于计算相互作用能、PyTorch模型训练和期望最大化聚类的脚本，还包括势能与相互作用能时间序列数据及相关预印本。 文件详解 GROMACS相关文件： DSPE+PEG.top：GROMACS拓扑文件，描述DSPE-...
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DPPC_Berger_OPLS06_NaCl分子动力学模拟数据集
2025年12月5日 60 139 82
数据集概述 本数据集包含使用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场进行的、含150mM NaCl的完全水合DPPC双层膜分子动力学模拟轨迹及相关文件，模拟条件为323K、72个脂质分子、2880个SPC水分子及8个Na和Cl离子，轨迹时长120ns，分析了最后60ns数据。 文件详解 模拟配置文件：...
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ECC_CHARMM36_POPC双层膜模拟数据集_100脂质_940mM_NaCl_310K_GROMACS5_1_4
2025年12月6日 30 76 62
数据集概述 本数据集为ECC-CHARMM36力场下POPC双层膜的分子动力学模拟数据，包含100脂质/叶、940mM NaCl溶液、310K温度条件，由GROMACS 5.1.4生成，是6组模拟中的第6组，用于研究CHARMM力场缩放对离子结合的影响。 文件详解 该数据集包含12个GROMACS格式文件，具体说明如下： - 结构与拓扑文件： -...
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溶液共混石墨烯纳米片_聚醚醚酮纳米复合材料力学性能数据集
2025年11月27日 30 138 59
数据集概述 本数据集聚焦溶液共混法制备的石墨烯纳米片/聚醚醚酮（PEEK）纳米复合材料的力学性能研究，包含实验数据、计算数据及分子模型相关文件，为探究该类复合材料的力学特性提供多维度数据支持。 文件详解 该数据集按目录分类组织，具体说明如下： - 计算数据文件（位于 Computational data/ 目录下）： -...
