找到19个数据集

分类: 公开数据 标签: BEAST2

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  • Feliformia_Mosaic_猫型亚目形态差异进化研究数据

    2026年1月28日 30 101 10

    数据集概述 本数据集来自论文“Mosaic evolution underlies feliform morphological...
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  • Pronophila_Based蝴蝶分支系统发育与分类学研究完整数据

    2026年1月26日 30 156 128

    数据集概述 本数据集为Pronophila分支系统发育与分类学研究的配套数据,包含用于分析的分子序列比对、系统发育树、模型参数及时间校准分析文件等,支持解析原多系属Pseudomaniola的分类问题,共包含七个文件。 文件详解 concatenated.phy 文件格式:PHY...
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  • Tursiops_Based宽吻海豚北大西洋后冰川期殖民化基因研究数据

    2026年1月26日 30 193 134

    数据集概述 本数据集为宽吻海豚后冰川期殖民化研究相关的基因数据,包含基因序列文件和进化分析输入文件,用于重建东北大西洋宽吻海豚的殖民化历史,探究冰期对当代种群遗传结构与多样性的影响。数据集共5个文件,涵盖海豚基因序列拼接、比对及进化分析模型输入等内容。 文件详解 基因序列文件(.fas格式)...
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  • Cycadaceae_Based古热带地区苏铁科物种丰富度模式研究数据

    2026年1月26日 30 61 24

    数据集概述 本数据集围绕古热带地区苏铁科物种丰富度模式的成因展开,以苏铁科为模型系统,测试扩散频率、定殖时间、多样化速率及其组合对区域丰富度模式的影响。包含时间校准的系统发育树相关数据、生物地理重建结果、性状状态数据及序列比对文件,共7个文件,用于支撑古热带地区生物多样性驱动因素的研究。 文件详解 序列比对文件(.phy格式)...
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  • StarBeast3_Based_多物种溯祖模型贝叶斯推断基准测试数据集

    2026年1月21日 30 204 77

    数据集概述 本数据集包含StarBeast3软件的基准测试数据集,涵盖3个真实数据集和2个合成数据集,以BEAST 2 XML格式提供,用于验证该软件在多物种溯祖模型下的贝叶斯推断性能,支持系统发育分析相关研究。 文件详解 文档文件 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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  • Niphargus_Based_地下水端足类多样性热点研究补充数据_2022

    2026年1月20日 30 146 28

    数据集概述 本数据集是论文《A hotspot of groundwater amphipod diversity on a crossroad of evolutionary...
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  • Atriophallophorus_Based_新西兰寄生虫分子数据与分析规范

    2026年1月19日 30 171 102

    数据集概述 本数据集为新西兰Atriophallophorus属吸虫寄生虫研究的配套数据,包含SNP数据、样本信息、系统发育分析结果、序列比对文件及分析输入文件,支持研究该属寄生虫的系统发育地理格局与隐存种结构,共含17个文件。 文件详解 数据文件(.fasta格式,共8个)...
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  • Paranthropus_Based_非洲南方傍人牙釉质蛋白基因多样性与性别鉴定数据

    2026年1月18日 30 186 102

    数据集概述 本数据集包含非洲南方傍人(Paranthropus robustus)的牙釉质蛋白序列、参考数据及序列分析结果,源于相关研究论文。数据涵盖原始未对齐序列、参考数据集及系统发育分析数据集与树结构,支持傍人种群的生物性别鉴定和遗传多样性研究。 文件详解 Paranthropus_Raw_AA_Sequences_Unaligned文件夹...
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  • Trilobite_Evolutionary_Rates_寒武纪大爆发持续时间研究数据

    2026年1月14日 30 9 6

    数据集概述 本数据集为三叶虫进化速率与寒武纪大爆发持续时间研究的配套数据,包含三叶虫分类单元、年代信息、形态特征数据及相关分析文件。通过贝叶斯尖端定年法分析,验证三叶虫寒武纪起源及进化速率稳定性,为寒武纪大爆发已在约5.21亿年前基本结束的结论提供量化证据。 文件详解 文件名称:Dataset_1_Taxa,Dates,CodingRefs.xlsx...
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  • Fejervarya_mtDNA_Based_小巽他群岛蛙类线粒体基因系统发育分析文件

    2026年1月14日 30 68 23

    数据集概述 本数据集包含小巽他群岛Fejervarya属三种(或物种复合体)蛙类的线粒体DNA(mtDNA)序列数据及系统发育分析结果,涉及F. cancrivora、F. iskandari和F....
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  • Nesotrochidae_Based_新世界洞穴秧鸡新科命名线粒体基因组与系统发育数据

    2026年1月13日 30 120 64

    数据集概述 本数据集为Nesotrochidae新科命名相关研究的配套数据,包含两种鸟类(马达加斯加林秧鸡、福布斯林秧鸡)的线粒体基因组组装数据、11个线粒体基因的串联编码序列比对数据,以及基于BEAST2的系统发育分析输入输出文件,用于支持新世界洞穴秧鸡与新西兰adzebills亲缘关系的研究。 文件详解...
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  • 基于Euphonia和Chlorophonia的雀科鸟类线粒体基因组及超保守元件分类学与生物地理学研究数据

    2025年12月30日 30 190 85

    数据集概述 本数据集包含Euphonia和Chlorophonia雀类(雀形目:燕雀科)的线粒体基因组序列、数千个超保守元件(UCE)序列及相关系统发育树文件,用于解析该类群的分类学关系与历史生物地理学。数据集涵盖样本元数据、序列矩阵、系统发育分析结果等12个文件,支持物种分类修订与生物地理历史重建研究。 文件详解 元数据与索引文件...
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  • Mixtecan语系贝叶斯系统发育分析补充材料数据集

    2025年12月22日 30 23 8

    数据集概述 本数据集是关于Mixtecan语系方言连续体分组贝叶斯系统发育分析的补充材料,包含样本语言元数据、自定义词表、同源词编码说明、系统发育分析文件及可视化结果等18个文件,为该语系的语言演化研究提供支持。 文件详解 该数据集包含18个文件,具体说明如下: - 元数据文件: - sm0_metadata.tsv:...
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  • 兽脚类恐龙化石不同尖端定年方法的拓扑结构_分化时间与宏进化推断数据集

    2025年12月16日 30 36 32

    数据集概述 该数据集围绕兽脚类恐龙化石的尖端定年分析展开,对比不同尖端定年方法(如BEAST2)与传统后验时间校准方法(如cal3)的结果差异,探究其对系统发育拓扑结构、分化时间及宏进化推断(如体型演化模式)的影响,为古生物学研究提供多方法定年的对比数据支持。 文件详解 该数据集包含23个文件,主要类型及内容如下: - 文档与说明文件: -...
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  • 谱系特异性出生死亡率贝叶斯推断的多类型生死模型数据集

    2025年12月15日 30 168 81

    数据集概述 该数据集围绕多类型生死模型(MTBD)展开,用于贝叶斯推断谱系特异性的出生死亡率。模型无需预设驱动速率差异的特征,可应用于物种系统发育的分化灭绝率及病原体传播树的传播恢复率研究,提供模型实现代码、数据文件及补充文档。 文件详解 数据压缩包: data_files.zip:ZIP格式压缩包,包含模型验证及实证分析所用的数据集 代码压缩包:...
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  • 短柄草多倍体同源亚基因组与幽灵亚基因组溯源数据集

    2025年12月14日 30 68 3

    数据集概述 本数据集围绕短柄草属多倍体植物的亚基因组溯源展开,包含通过转录组系统发育、亚基因组检测算法及染色体条形码分析得到的结果,涉及现存二倍体物种及未知幽灵祖先基因组的鉴定,为解析多倍体形成机制提供数据支持。 文件详解 文档类文件: README_DRYAD_files.pdf: PDF格式,可能包含数据集文件说明、使用方法等文档内容...
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  • 黄病毒科系统发育研究补充材料数据集

    2025年12月12日 30 162 122

    数据集概述 本数据集为黄病毒科系统发育研究的补充材料,包含基因组数据、基因注释、系统发育树分析结果及相关配置文件等,支持对黄病毒科进化关系的深入研究,提供标准化的实验参数与可视化结果。 文件详解 表格文件(CSV格式): tableS1.csv:基因组数据,含ID、终端名称、属分类及注释信息...
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  • 美洲雏菊多倍体物种网络定年与重复DNA进化数据集

    2025年12月10日 30 73 7

    数据集概述 该数据集聚焦美洲雏菊(Melampodium属)多倍体物种的进化研究,结合多物种溯祖模型(BEAST2)的定年分析与RepeatExplorer的重复DNA表征,探究异源四倍体及衍生异源六倍体的起源时间与基因组重复序列动态,为理解多倍体化驱动的植物进化提供数据支持。 文件详解 补充信息文档:...
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  • 中生代哺乳动物中侏罗世适应性辐射证据数据集

    2025年12月5日 30 7 5

    数据集概述 该数据集围绕中生代哺乳动物的中侏罗世适应性辐射研究,包含分析结果、补充图表及代码文件,支持早至中侏罗世冠群哺乳动物全球适应性辐射的“短保险丝”模型及兽亚纲“长保险丝”模型的论证,为早期哺乳动物多样化研究提供数据支撑。 文件详解 文件名称:Dryad Supplementary Figures for Close et al....
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