找到23个数据集

分类: 公开数据 标签: RADseq

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  • Habronattus_Salticidae_Based跳蛛物种复合体渐渗杂交进化影响研究数据

    2026年1月11日 30 106 17

    数据集概述 本数据集聚焦跳蛛Habronattus americanus物种复合体,探究渐渗杂交对其进化的影响。通过RADseq、超保守元件(UCEs)及形态学数据,分析基因组与形态的进化模式,揭示快速辐射与频繁渐渗导致的网状进化历史,包含267个文件,以基因序列数据为主。 文件详解 基因序列文件...
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  • RAD_seq_SNP_Based欧洲鳗鲡变态期自然选择信号研究数据

    2026年1月23日 30 109 11

    数据集概述 本数据集为欧洲鳗鲡生命周期变态阶段自然选择信号研究相关数据,包含编码基因SNP标记与RAD-seq全基因组SNP数据,用于分析玻璃鳗(幼体)与银鳗(成体)阶段受选择的基因及通路,验证变态期适应性解耦假说。数据支持研究不同生命周期阶段的选择压力差异及进化机制。 文件详解 文件名称:SNP_Table_BMCGenomicspaper.xlsx...
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  • Ligidium_Japan_Based_陆生等足类系统地理分析数据

    2026年1月23日 30 53 4

    数据集概述 本数据集包含日本陆生等足类Ligidium属的系统地理分析相关数据,基于721个个体的线粒体分析和83个个体的全基因组分析结果,揭示该属在日本东北与西南弧之间的系统发育分化及种群扩张历史,可用于研究地质历史与生物地理的关联。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Soldanella_Based_欧洲高山植物基因渐渗与物种分化研究数据

    2026年1月22日 30 63 1

    数据集概述 本数据集聚焦欧洲高山植物Soldanella属(报春花科)的基因渐渗研究,整合了质体基因组、核基因组(RAD-seq)及细胞遗传学数据,分析杂交与渐渗在该属快速分化中的作用。数据覆盖属内物种演化历史中的基因流动模式,尤其关注喀尔巴阡物种的核型变异与渐渗程度,揭示杂交对物种形成和遗传多样性的影响。 文件详解 README文件...
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  • Undaria_pinnatifida_Based_群体基因组学研究数据

    2026年1月22日 30 43 14

    数据集概述 本数据集为引入栽培太平洋海带Undaria pinnatifida的群体基因组学研究数据,包含码头、养殖场及自然岩礁三种栖息地种群的遗传信息。通过RAD-seq和微卫星两种方法分析,探究栖息地对种群遗传多样性、连通性及野外定殖的影响,共含2个文件。 文件详解 Guzinski-et-al-Undaria-RADseqVCF file.vcf...
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  • 蓝鱼_Scomber_scombrus_基于大西洋的蓝鱼种群结构研究数据

    2026年1月21日 30 78 60

    数据集概述 本数据集来自大西洋鲭鱼(Scomber scombrus)种群结构研究,包含高质量基因组测序及注释结果(741 Mb),并利用RAD-seq技术进行SNP标记发现与基因分型。研究基于数千个SNP标记分析,结果显示大西洋鲭鱼分为西北大西洋、东北大西洋、地中海三个遗传单元,未发现产卵群体存在遗传分化的证据。数据集包含9个相关文件。 文件详解...
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  • plains_zebra_Based_种群结构遗传多样性条纹异常分析数据

    2026年1月21日 30 33 26

    数据集概述 本数据集围绕平原斑马的种群结构、近交情况及条纹异常展开研究,包含140个平原斑马样本(含7个条纹异常个体)的遗传数据,覆盖非洲9个采样点。通过RAD-seq和WGS技术分析,探究种群结构、遗传多样性与异常表型的关系,为斑马保护策略提供科学依据。 文件详解 README 文件格式:无扩展名...
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  • RAD_seq_Evidence_Pitcairnia_lanuginosa局部适应研究数据

    2026年1月17日 30 64 57

    数据集概述 本数据集包含Neotropical凤梨科植物Pitcairnia lanuginosa的RAD-seq基因数据与性状数据,用于研究该斑块状分布物种在强遗传漂变下的局部适应证据。数据涵盖巴西塞拉多和安第斯永加斯种群的SNP标记及常见园实验的生理生态性状,支持种群分化、遗传漂变与选择作用的分析,共3个文件。 文件详解 种群基因数据压缩包...
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  • RAD_seq_MassARRAY_北美东部橡树核DNA条形码及植物园杂交研究数据

    2026年1月15日 30 121 6

    数据集概述 本数据集为北美东部8种常见白橡树核DNA条形码研究及植物园杂交分析相关数据。研究通过RAD-seq技术开发含80个SNP的条形码工具包,结合MassARRAY技术验证,分析Morton Arboretum中移栽橡树与本地树种的杂交情况。包含5个文件,涉及SNP提取脚本、不同筛选阶段的SNP矩阵及基因座序列压缩包。 文件详解...
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  • Pacific_cod_FISH_546_Based华盛顿大学课程基因数据分析项目数据

    2026年1月14日 30 202 20

    数据集概述 本数据集为华盛顿大学FISH 546课程期末项目的成果,包含太平洋鳕鱼RADseq基因数据的分析代码与中间结果。项目未完全完成,但已生成基因种群文件子集的DAPC分析结果及群体间成对Fst值计算结果,以压缩包形式存储相关分析脚本与笔记本。 文件详解 文件名称:FISH546-3.0.zip 文件格式:ZIP...
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  • Data_Like_a_rolling_stone_灰礁鲨种群进化历史与基因结构研究数据

    2026年1月13日 30 134 116

    数据集概述 本数据集包含灰礁鲨(Carcharhinus amblyrhynchos)种群进化历史研究的关键数据,涵盖印度-太平洋区域173个个体的RAD-seq基因位点分析结果,涉及种群扩张、基因连通性及遗传结构等内容,为该濒危物种的保护管理提供科学依据。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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  • Ecol_Apps_Morissette_et_al_2019_湖鳟生态型环境互作与营养生态位数据

    2026年1月7日 30 171 45

    数据集概述 本数据集围绕湖鳟(Salvelinus namaycush)的生态型-环境互作展开,包含养殖、本地及杂交个体的稳定同位素分析数据,以及遗传标记与生态性状关联分析结果,旨在研究养殖对种内营养生态位分化的影响,为渔业管理和保护提供数据支持。 文件详解 说明文档类...
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  • RADseq_Data_from_Hawaiian_Myrsine辐射进化系统发育与杂交分析数据集

    2026年1月7日 30 173 165

    数据集概述 本数据集包含夏威夷Myrsine属(报春花科)辐射进化的RADseq和Sanger测序系统发育分析结果,涉及近全部夏威夷Myrsine物种及全球Myrsine属和近缘属样本。数据支持夏威夷Myrsine单系性、三大分支结构的结论,并提供杂交事件的分子证据,共四十四份文件。 文件详解 系统发育树文件...
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  • 系统发育基因组学测序方案计算机模拟比较数据集

    2025年12月23日 30 122 2

    数据集概述 本数据集基于23种灵长类动物基因组,对四种常用系统发育基因组学测序方案(UCE捕获、外显子捕获、RADseq、ddRADseq)进行计算机模拟比较,涵盖系统发育分辨率与分歧时间估算结果,为方案选择提供参考。 文件详解 文件名称: README_for_beast.tar.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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  • 红衣主教唐纳雀属系统基因组学测序方法比较数据集

    2025年12月23日 30 44 40

    数据集概述 本数据集围绕红衣主教唐纳雀属(Piranga)的系统基因组学研究展开,对比了RAD-seq和UCEs两种测序方法在不同分类水平下的系统发育推断效果,包含两种方法的测序数据、物种树分析结果及补充信息,为鸟类系统发育研究提供数据支持。 文件详解 压缩文件(.zip格式): uce_raxml.zip:UCE数据的RAxML分析结果文件...
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  • RAD_seq系统发育学缺失数据误解研究数据集_开花植物案例

    2025年12月20日 30 202 47

    数据集概述 本数据集围绕RAD-seq系统发育学中的缺失数据误解展开,分析10个RAD-seq数据集的缺失数据分布,通过模拟区分突变干扰与测序覆盖度导致的缺失模式,并以开花植物荚蒾属为实证案例,探讨测序深度对系统发育信息的影响,提供实用建议。 文件详解 数据文件:...
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  • SNP系统发育推断的获取偏差校正数据集

    2025年12月20日 30 79 71

    数据集概述 本数据集围绕单核苷酸多态性(SNPs)在系统发育研究中的应用展开,包含计算机模拟数据及蜥蜴科(Phrynosomatidae)的双酶切RADseq(ddRADseq)实证数据,旨在评估RAD位点用于系统发育推断的准确性,并引入两种新的获取偏差校正方法。 文件详解 文件名称: SupplementMaterials.pdf 文件格式: PDF...
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  • 南极磷虾种群基因组学研究数据集

    2025年12月19日 30 39 29

    数据集概述 本数据集为南极磷虾种群基因组学研究的成果数据,包含线粒体DNA(mtDNA)与RAD-seq(限制性位点相关DNA测序)分析结果,涉及五个采样点(含两个东极地点)的磷虾样本,验证了其种群遗传结构的泛交性特征,并探讨了大基因组生物RAD-seq分析的复杂性。 文件详解 项目说明文档(PDF格式): README_for_1 RAD-seq...
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  • 熊蜂物种分子数据支持的结构分析补充材料2024

    2025年12月18日 30 68 17

    数据集概述 该数据集为2024年发表的熊蜂物种分子研究的补充材料,包含基于RADseq数据的STRUCTURE分析结果,通过Clumpak工具输出,用于支持Bombus sonorus与Bombus pensylvanicus为不同物种的结论,为膜翅目昆虫分类学研究提供分子数据佐证。 文件详解 文件名称: oo_1155517.pdf 文件格式:...
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  • 家燕基因组分化与选择地理隔离关联数据集

    2025年12月18日 30 134 49

    数据集概述 该数据集聚焦家燕(Hirundo rustica)近缘种群的基因组分化研究,结合基因型与表型数据,探究选择与地理隔离对种群分化的相对贡献。数据涵盖8个种群350个样本的9493个单核苷酸多态性(SNPs)及迁徙行为、性信号等表型指标,为解析隔离适应(IBA)与隔离距离(IBD)机制提供支持。 文件详解 文件名称:...
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