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欧亚水獭线粒体基因组数据集
2025年11月29日 30 52 29
数据集概述 该数据集包含濒危物种欧亚水獭(Lutra lutra)的完整线粒体基因组序列,总长16,537 bp,涵盖13个蛋白编码基因、22个转运RNA、2个核糖体RNA及1个控制区,为欧亚水獭的遗传学研究提供基础数据。 文件详解 文件名称: MW573979_Lutra luta.fasta 文件格式: FASTA (.fasta) 内容说明:...
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昆虫抗病毒Mx样蛋白形成生物分子凝聚体促进病毒衣壳泛素化降解序列数据集
2025年11月29日 30 187 12
数据集概述 本数据集为发表于CELL REPORT期刊的相关研究论文的序列数据,核心内容是昆虫抗病毒Mx样蛋白形成生物分子凝聚体促进病毒衣壳泛素化降解相关的蛋白序列信息。 文件详解 文件名称:Insect antiviral Mx-like protein forms biomolecula/protein-seq.fasta 文件格式:FASTA...
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婴儿利什曼原虫基因组大环序列数据集2018
2025年11月29日 30 151 88
数据集概述 本数据集包含从Illumina测序读段组装的3条婴儿利什曼原虫基因组大环序列,编码区以大写字母标注,基于Bussotti等(2018)的测序数据及Camacho等(2019)的组装方法构建,为研究该寄生虫基因组结构提供数据支持。 文件详解 文件名称: Maxicircles_Linf-Bussotti_2018.fas 文件格式:...
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隼科鸟类线粒体序列数据集
2025年11月29日 30 203 141
数据集概述 本数据集包含用于研究鸟类系统发育中假基因化现象的隼科鸟类线粒体序列,重点关注隼科中核线粒体DNA片段(numts)的特征,为分析其在系统发育中的影响提供基础数据。 文件详解 文件名称:...
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TP53基因蛋白序列数据集
2025年11月29日 30 27 2
数据集概述 该数据集包含TP53基因对应的蛋白序列数据,源自NCBI数据库中与基因ID 7157关联的蛋白参考序列,为研究TP53基因编码的蛋白结构与功能提供基础序列信息。 文件详解 文件名称: sequence (1).fasta 文件格式: FASTA (.fasta) 内容说明:...
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日本奈良县高见川河流宏基因组样本扩增子测序数据集2017
2025年11月29日 30 121 31
数据集概述 本数据集包含2017年日本奈良县高见川河流宏基因组样本的扩增子测序数据,涉及线粒体cox1、核组蛋白H3及18S rRNA基因的部分编码区序列,涵盖不同采样位点、环境类型的样本,以及分类单元(OTUs)和物种界定分析结果。 文件详解 实验信息文件: Table 1_Takamigawa amplicon...
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绿藻目叶绿体基因数据集
2025年11月29日 30 78 51
数据集概述 该数据集包含绿藻目(Cladophorales)多种绿藻的叶绿体基因序列数据,涉及Chaetomorpha aerea、Cladophora albida等9个物种,以.fas和.fasta格式存储,主要用于研究其叶绿体基因组特征。 文件详解 基因序列文件:...
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须腹菌属_黄杉属外生菌根共生基因组规模序列分型数据集
2025年11月29日 30 150 9
数据集概述 本数据集为研究须腹菌属(Rhizopogon)与黄杉属(Pseudotsuga)外生菌根共生关系的基因组规模序列分型(GSST)数据,包含核苷酸序列比对、系统发育树文件、基因座坐标文件及相关分析脚本,支持共生演化与共迁移研究。 文件详解 系统发育树文件: RAxML_bipartitions_ITS_alignment.tre:...
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绿藻目叶绿体基因比对数据集
2025年11月27日 30 83 79
数据集概述 该数据集包含绿藻目叶绿体基因的核苷酸与氨基酸序列比对数据,支持相关研究对叶绿体基因组结构的分析,共含40个文件,以序列比对格式为主。 文件详解 文件类型与分布: .fasta格式文件(21个,占52.5%):如aa_01_atpA.fasta、aa_02_atpB.fasta等,存储氨基酸序列比对数据...
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节旋藻16S核糖体RNA基因序列数据集
2025年11月28日 30 110 6
数据集概述 本数据集包含92条节旋藻(Arthrospira platensis)及相关类群的16S核糖体RNA基因序列,序列长度为1294个字符。数据来源于NCBI数据库及相关研究文献,用于分析节旋藻IBSS-31菌株的亲缘关系。 文件详解 该数据集包含一个FASTA格式的序列文件,具体说明如下: - 文件名称:...
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宝石轴孔珊瑚转录组从头组装与注释数据集
2025年11月28日 30 14 5
数据集概述 本数据集包含宝石轴孔珊瑚(Acropora gemmifera)的转录组从头组装与注释结果,样本采集于中国台湾南部3-4米水深区域,为研究该珊瑚的基因表达与功能提供基础数据。 文件详解 文件名称:Agemmifera.V10.Trinity.annotated.gff3 文件格式:GFF3(通用特征格式3)...
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Aporocotylidae寄生虫MUSCLE比对数据集_含双壳类感染新数据
2025年11月28日 30 154 39
数据集概述 本数据集包含基于MUSCLE算法的Aporocotylidae寄生虫序列比对结果,其中整合了来自双壳类感染的新数据,为研究该类寄生虫的分子特征提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: Aporocotylidae aligment.fasta 文件格式: FASTA(.fasta) 文件内容:...
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北大西洋深海长尾鳕Macrourus_berglax遗传同质性研究数据集
2025年11月28日 30 128 105
数据集概述 本数据集聚焦北大西洋深海长尾鳕Macrourus berglax的遗传同质性研究,包含微卫星等位基因数据(Genepop格式)和对应地理坐标的DNA序列数据(FASTA格式),为分析该物种跨北大西洋的遗传结构提供基础数据支持。 文件详解 文件名称:macrourus.fas 文件格式:.fas 内容说明:包含DNA序列数据及对应地理坐标信息...
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拟南芥sORF分析流程数据集
2025年11月28日 30 56 37
数据集概述 该数据集包含运行《分子生物学方法》中sORF分析流程所需的拟南芥相关数据,涵盖基因组序列、索引文件、RNA序列及注释文件等,为sORF分析提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: sORF_pipeline/TAIR10.fa.fai,文件格式: .fai,为TAIR10.fa的索引文件 文件名称:...
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针毛虫类系统基因组学分析数据集
2025年11月28日 30 59 27
数据集概述 本数据集用于解析环节动物门游走亚门针毛虫类(Aciculata)的系统发育关系,包含转录组矩阵、物种树(ASTRAL和串联超矩阵方法构建)及用于数据探索的基因树,支持相关类群进化关系的研究。 文件详解 根目录文件: 80pAciculata.supermatrix.fa:FA格式文件,可能为80%物种覆盖度的超矩阵序列文件...
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地中海托湖冬季水华新微藻物种Picochlorum_tauri系统基因组学数据集
2025年11月27日 30 80 59
数据集概述 本数据集围绕地中海托湖冬季水华新微藻物种Picochlorum tauri展开,包含其基因组序列、注释数据及与其他绿藻门物种的比较基因组学分析结果,为研究该物种代谢潜力提供系统基因组学数据支持。 文件详解 目录:Phylogenomics untangles the metabolic potential of/ 文件列表:...
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人类单根不同长度毛发轴蛋白质测序评估数据集
2025年11月27日 30 97 66
数据集概述 该数据集包含用于评估人类单根不同长度毛发轴蛋白质测序的定制化蛋白质序列数据库,分为野生型和突变型两种,基于Uniprot和NCBI SNP数据库信息构建,支持毛发蛋白质测序相关研究。 文件详解 文件名称:2017_Nov_CFSRU_CustomDB_database(Wildtype).fasta 文件格式:FASTA(.fasta)...
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果蝇纳苏亚种全基因组Illumina测序与数据分析数据集
2025年11月27日 30 115 92
数据集概述 该数据集包含果蝇纳苏亚种(Coorg品系)的全基因组Illumina短读长测序组装及分析结果。基于Illumina HiSeq 2500技术对40只5日龄雄性果蝇基因组DNA进行双端测序,涵盖基因组组装、注释及质量评估等核心内容。 文件详解 该数据集包含多个目录和文件,具体说明如下: - 基因组组装目录(Genome_assembly/):...
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CGMCC8198的部分基因序列及对应蛋白质序列数据集
2025年11月27日 30 15 12
数据集概述 本数据集包含CGMCC8198的部分基因序列及其对应的蛋白质序列,以FASTA格式存储,为生物学领域相关研究提供基础序列数据支持。 文件详解 文件目录:The partial gene sequences and corresponding protein sequences of CGMCC8198/...
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病原菌Ceratocystis_manginecans与Ceratocystis_fimbriata基因组数据集
2025年11月27日 30 7 4
数据集概述 本数据集包含病原菌Ceratocystis manginecans与Ceratocystis fimbriata的基因组数据,用于Fourie等人2019年发表的QTL定位研究。数据涵盖MinION组装基因组序列及Illumina HiSeq测序读段,同时提供将SNP数据转换为二进制数据的Python脚本,支持下游分析。 文件详解...



