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Tryblionella_Based_基因比对与AU测试结果数据集
数据集概述 本数据集包含Tryblionella属生物的基因比对相关文件,涵盖基因序列比对数据、GenBank ID信息及AU测试结果,共6个文件,涉及.xlsx、.fas、.txt三种格式,用于生物信息学领域的基因序列分析与实验测试。 文件详解 Excel文件(.xlsx格式,共2个) 文件名称:genbank ID...
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Liocichla_Based鸟类属多基因位点分子系统发育研究数据
数据集概述 本数据集包含鸟类Liocichla属(雀形目:噪鹛科)的多基因位点分子系统发育研究数据,涵盖5个已识别物种的基因序列比对、系统发育分析文件及相关辅助数据,用于构建物种进化树、估算分化时间,支持亚洲鸟类多样化的生物地理假说验证。 文件详解 分析配置文件(XML)...
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Cavernacmella_Based_海洋岛屿小蜗牛表型进化研究数据
数据集概述 本数据集记录小笠原群岛微陆栖蜗牛Cavernacmella的表型进化研究数据,包含表型数据与基因序列比对文件,用于分析表型分化与基因型分化的关联模式,揭示其长期表型稳定与短期分化的特征。 文件详解 DA_morphological_data.xls 文件格式:XLS 字段映射介绍:包含小蜗牛表型数据,具体字段未提供预览...
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Lopez_Uribe_Based_昆虫社会性生活细胞免疫反应研究数据
数据集概述 本数据集围绕昆虫社会性生活对个体细胞免疫反应的影响展开,包含11种真社会性与非社会性昆虫谱系的包囊反应测量数据,以及基因序列比对和系统发育树文件,用于验证社会群体假说与放松选择假说,探究群体大小、行为等因素对细胞免疫反应的作用。 文件详解 原始数据文件 文件名称:Lopez-Uribe_RawEncapsulationData.xlsx...
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OGRDB_Based_小鼠MRL_MpJ品系IGKV基因种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的小鼠MRL/MpJ品系IGKV基因种系参考集,包含该品系免疫球蛋白κ轻链可变区(IGKV)的基因种系序列数据及相关说明文件,支持免疫学领域对小鼠基因序列的研究与参考。 文件详解 基因序列文件 文件名称:MpJ...
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OGRDB_Based_小鼠PWD_PhJ品系免疫球蛋白重链生殖系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠PWD/PhJ品系的免疫球蛋白重链(IGH)生殖系参考集,包含基因序列及元数据文件,由Open Germline Receptor Database(OGRDB)发布,适用于免疫遗传学领域的基因序列分析研究。 文件详解 基因序列文件 PhJ...
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OGRDB_Based_小鼠AKR_J品系IGKV基因胚系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠AKR/J品系的IGKV基因胚系参考序列集,包含未加间隙、加间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可文件,共4个文件,由Open Germline Receptor Database(OGRDB)发布,用于免疫学领域基因序列相关研究。 文件详解 未加间隙序列文件 文件名称:J...
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Mytilus_Based_入侵与本地海洋贻贝基因分化与杂交结果数据
数据集概述 本数据集围绕入侵海洋贻贝Mytilus galloprovincialis与本地近缘种的基因分化及杂交结果展开,包含非杂交(南非、加州)和杂交(澳大利亚贝特曼斯湾、悉尼港)场景下的基因数据,涉及大西洋与地中海谱系的平行分化、长链非编码RNA演化约束及不同杂交区的基因渗入差异分析。 文件详解...
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OGRDB_Based_小鼠NOR_LtJ品系IGLV种系参考基因集
数据集概述 本数据集是小鼠NOR/LtJ品系的免疫球蛋白轻链可变区(IGLV)种系基因参考集,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB),包含未间隙化、间隙化的基因序列文件、许可证文件及JSON格式数据,共4个文件,用于生物信息学领域的基因序列分析。 文件详解 基因序列文件 文件名称:LtJ...
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Haemosporida_Phylogeny_多基因系统发育分析数据
数据集概述 本数据集基于多基因方法开展血孢子虫(Haemosporida)的系统发育研究,包含7种血孢子虫的21个核基因片段序列及25种顶复门物种的基因组数据,总比对长度达20,580碱基对。通过贝叶斯推断、最大似然法等分析揭示血孢子虫的深层系统发育关系,为理解其进化历史、宿主转换及生物学多样性提供数据支持。 文件详解 README.txt...
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蓝灯鱼_Lamprologus_的完整线粒体基因组及河流慈鲷相关数据
数据集概述 本数据集包含河流生丽鱼属(Lamprologus)物种的完整线粒体基因组数据,重点关注盲丽鱼(L. lethops)。数据涵盖基因组特征文件、基因序列比对文件、分区文件及样本信息表,支持丽鱼科物种的分子生物学研究,共包含18个文件。 文件详解 线粒体基因组特征文件(*.gff)...
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arthropod_TRP_植物源天然驱避剂节肢动物分子靶点研究数据
数据集概述 本数据集为植物源天然驱避剂的节肢动物分子靶点研究相关数据,包含13个Excel数据文件与1个Word说明文档。通过行为学筛选马氏正钳蝎基因组,识别出感知香茅属植物源驱避剂的瞬时受体电位通道sTRP1,验证果蝇同源蛋白dTRPϒ为天然驱避剂的化学感受受体,为害虫防控策略设计提供分子靶点依据。 文件详解 数据文件(共13个)...
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Impatiens_Based_墨西哥凤仙花系统发育比对与遗传距离数据
数据集概述 本数据集包含用于墨西哥凤仙花(Impatiens mexicana Rydb.)系统发育分析的基因序列比对文件及遗传距离数据,涉及ITS、atpb-rbcL、trnL-F三个基因片段及其串联矩阵,共5个文件,支持该物种的形态与系统发育研究及地理分布更新。 文件详解 串联矩阵比对文件...
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Anopheles_Genus_Based_按蚊属分化与新热带支系数据集
数据集概述 本数据集围绕按蚊属的系统发育关系与分化时间展开,包含COI、COII和5.8S rRNA基因的综合数据。通过最大似然法和贝叶斯推断,分析了按蚊属七个亚属中的六个,揭示新热带支系(Stethomyia、Kerteszia、Nyssorhynchus)的单系性及其在晚白垩纪的分化时间。数据集包含3个文件,用于支持按蚊属进化研究。 文件详解...
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Katz_Data_from_原核生物与真核生物域间横向基因转移研究数据
数据集概述 本数据集聚焦原核生物与真核生物的域间横向基因转移(LGT)研究,通过系统发育组学流程生成13465个单基因树,纳入487种真核生物、303种细菌和118种古菌。重点分析存在-...
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Archerythroxylum_Based古柯属系统发育与驯化研究数据
数据集概述 本数据集为古柯属Archerythroxylum组的系统发育研究数据,通过杂交捕获427个基因,使用串联和基因树 reconciliation方法构建系统发育树,分析种类关系、生物地理学及驯化历史。数据包含样本信息、基因序列比对和系统发育树文件,共3个文件,支持古柯属分类修订与驯化起源研究。 文件详解 样本信息文件:...
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Schott_et_al_蛙类视觉视蛋白基因多样性复制与正选择进化分析数据
数据集概述 本数据集包含蛙类和蟾蜍视觉视蛋白基因进化分析相关数据,涉及基因多样性、复制及正选择研究。共20个文件,涵盖基因序列比对、系统发育树、引物文档及选择压力分析结果等,为蛙类视觉基因进化研究提供基础数据支持。 文件详解 基因序列比对文件(.fas格式,8个)...
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Veronica_Hebe_Based新西兰高山植物辐射生物多样性研究数据
数据集概述 本数据集为新西兰高山植物辐射生物多样性研究的配套数据,聚焦Veronica属Hebe组植物。包含系统发育分析所需的基因序列比对文件、时间校准的系统发育树文件及分析参数设置文件,用于量化高山生境的原地分支发生与低海拔 colonization贡献,探究生态位适应与分化在物种多样性积累中的作用。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
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Tuatara_Genome_Based_大蜥蜴视觉系统分子进化支持数据集
数据集概述 本数据集为《大蜥蜴基因组:来自古老爬行纲唯一现存物种的脊椎动物进化洞察》论文的补充数据,聚焦大蜥蜴视觉系统的分子进化研究。包含基因树、补充文件、PAML结果表和基因序列比对等四类文件,总计4个文件,用于支持相关进化分析。 文件详解 Schott Tuatara Vision Gene Trees.zip 文件格式:ZIP...
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OGRDB_Source_小鼠CAST_EiJ品系IGH基因胚系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠CAST/EiJ品系的IGH基因胚系参考序列,发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)。包含无间隙、有间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可证文件,共4个文件,可用于免疫受体基因的序列分析与研究。 文件详解 EiJ IGH_rev_1_ungapped.fasta...



