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Brassica_napus_Based_甘蓝型油菜两个近缘品种基因组组装与比较数据
数据集概述 本数据集包含甘蓝型油菜品种Tapidor的从头基因组组装，以及与改良组装的Darmor-bzh品种的比较数据。两者采用相同注释方法以实现基因内容对比，识别了各品种特有基因并区分组装注释差异导致的伪影，共含17个归档文件。 文件详解 基因组组装与注释文件...
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野生番茄_Solanum_pimpinellifolium基因组分化与非生物环境关联研究数据
数据集概述 本数据集围绕野生醋栗番茄（Solanum pimpinellifolium）展开，包含140份野生材料的基因组变异数据（6830个单核苷酸多态性位点）及对应的气候、地理等非生物环境数据，通过冗余分析等方法量化基因组变异与环境、地理的关系，探究该物种局部适应的遗传基础及关键非生物选择因子。 文件详解 基因型数据文件...
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Oregon_junco_Based_歌雀谱系分化基因组漂移与局部适应性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦北美西部俄勒冈歌雀的快速谱系分化过程，包含基因组水平的SNP位点数据及环境变量数据，用于研究中性漂移与局部适应性在种群分化中的相对作用，涉及孤立干旱山区种群与湿润北部种群的遗传结构差异，支持遗传-环境关联分析。 文件详解 基因组变异数据文件（.vcf格式，共4个）...
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Porubsky_etal_2023_Based_人类完整基因组组装倒位多态性研究数据
数据集概述 本数据集为期刊文章《Inversion polymorphism in a complete human genome assembly》的补充数据，包含研究相关的代码文件。数据集以压缩包形式提供，旨在支持人类基因组倒位多态性的分析与研究，为基因组学领域的相关探索提供结构化资源。 文件详解...
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Zosterops_borbonicus_based留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性进化数据
数据集概述 本数据集为留尼汪岛绣眼鸟羽毛颜色多态性研究的支撑数据，包含该鸣禽高地种群中棕色与灰色羽毛表型的表型记录、基因组变异及微卫星等分子数据，用于揭示染色体1上新基因座对黑色素表型多态性的调控机制及平衡选择下的进化过程。 文件详解 文件名称：Localities_Morphs_individuals_VCF.xlsx 文件格式：XLSX...
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数据1KG_ONT_VIENNA_Based_1000基因组计划长读长测序结构变异分析数据
数据集概述 本数据集为1000基因组计划中1019个样本的长读长测序数据的结构变异（SV）分析结果，存储于国际基因组样本资源库（IGSR）的1KG_ONT_VIENNA目录下，包含1个压缩文件，可用于基因组结构变异的相关研究。 文件详解 文件名称：1kg-ont-vienna/sv-analysis-v1.1.zip 文件格式：ZIP...
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Drosophila_melanogaster_Based_果蝇全基因组重测序数据_2016
数据集概述 本数据集包含Sussex-LHM和RG品系黑腹果蝇的全基因组重测序相关数据，涵盖比对代码、日志文件及质量控制数据。数据支持下一代测序数据的比对分析，可用于研究果蝇基因组特征及变异情况，总计包含12个文件。 文件详解 比对代码文件 文件名称：lhm_mapping_scripts.zip 文件格式：ZIP...
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Chlamydomonas_reinhardtii_Based_莱茵衣藻全基因组重测序自然变异研究数据
数据集概述 本数据集包含莱茵衣藻12株野外分离株和8株实验室常用菌株的全基因组重测序数据，用于表征其基因组多样性，支持自然变异研究。数据显示莱茵衣藻是真核生物中多样性最高的物种之一，核苷酸多样性约为百分之三，北美地理种群存在结构分化与混合迹象。数据集共包含十一份文件，涉及基因功能保守性、实验室菌株多态性模式等分析内容。 文件详解...
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Staphylococcus_aureus_Based_儿童骨关节感染金黄色葡萄球菌遗传分析数据
数据集概述 本数据集为儿童骨关节感染金黄色葡萄球菌的遗传分析数据，包含47例儿童样本的全基因组测序结果、毒力基因评估、系统发育树构建及生物膜形成能力检测数据，涉及皮肤定植、皮肤脓肿、骨关节感染（含 septic arthritis、osteomyelitis 等亚型）三类样本，用于探究金黄色葡萄球菌基因组变异与儿童骨关节感染发病机制的关联。 文件详解...
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Pseudomonas_fluorescens_Pf0_1_Based细菌种群瓶颈强度与趋异进化数据
数据集概述 本数据集记录了荧光假单胞菌Pf0-1在不同强度种群瓶颈下，适应抗生素补充培养基的进化实验数据。核心内容围绕瓶颈强度对平行进化的影响，包括表型适应速率、分子适应模式及抗生素抗性相关基因的进化机制差异，为研究种群瓶颈与趋异进化的关系提供支撑。 文件详解 文件名称：Vogwill Phillips Gifford Maclean...
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Eragrostis_tef_Based_埃塞俄比亚画眉草水分胁迫下生产力与形态生理性状基因组解析数据
数据集概述 本数据集为埃塞俄比亚画眉草（Eragrostis tef）在不同水分条件下的基因组与表型研究数据，包含297个基因型的28,837个SNP标记数据，以及2020-2021年两个生长季、两种水分处理（充足/有限）下的生产力、抗倒伏性及形态生理性状表型数据，用于解析目标性状的遗传基础。 文件详解 ReadMe for Zenodo.txt...
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SV_datas_ACB_Pangenome_and_Structure_variant_基因组学分析数据
数据集概述 本数据集包含ACB泛基因组与结构变异相关的压缩文件，文件总数为一个，无目录层级结构。数据集未区分训练/测试集、数据/标签集或原始/处理数据，主要文件类型为压缩包，占比百分之百。 文件详解 文件名称：SV-data.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：未提供README或内容预览，具体字段信息需解压后查看 适用场景 基因组学研究:...
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Next_Gen_phylogeography_rainforest_trees_叶绿体基因组变异研究数据
数据集概述 本数据集为雨林树木叶绿体基因组变异研究数据，通过下一代测序技术分析12种非模式雨林树木的叶绿体全基因组变异，涉及南北两个进化区域。数据包含叶绿体参考序列及核rDNA标记信息，可用于识别生物地理屏障、分析遗传多样性分布及进化历史。 文件详解...
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病原体先天免疫记忆进化实验数据集
数据集概述 本数据集为病原体先天免疫记忆进化实验相关研究的支撑数据，包含实验中死亡率比例、孢子负载、基因表达、基因组变异等多维度数据，以及用于分析和复现研究结果的脚本文件，可辅助理解病原体在先天免疫记忆压力下的毒力变异规律。 文件详解 数据文件：...
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大肠杆菌全基因组和核心基因组MLST方案及数据集2017
数据集概述 本数据集包含2017年4月从EnteroBase获取的2218个大肠杆菌公开基因组组装数据及元数据，另含119个INNUENDO项目的产志贺毒素大肠杆菌基因组。数据覆盖全基因组（wgMLST）和核心基因组（cgMLST）方案、等位基因谱及菌株元数据，支持大肠杆菌的基因分型研究。 文件详解 元数据文件：...
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农杆菌系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集为拟议新物种Agrobacterium bohemicum sp. nov.的系统发育分析提供完整数据支持，包含基因组序列、基因文件、系统发育树及相关分析文件，覆盖从原始序列到分析结果的全流程数据。 文件详解 该数据集包含82个文件，具体说明如下： - 基因组序列文件: -...
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中国四重奏单倍型解析组装与变异基准附加文件集
数据集概述 本数据集为中国四重奏基因组研究的补充文件集，包含人工整理的双胞胎候选CSV、新发与体细胞突变及基准测试潜在假阳性/阴性等PDF文档，为单倍型解析组装与变异基准分析提供支持。 文件详解 文件名称: Additional file4_CSV.evidence.pdf 文件格式: PDF 内容:...
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SARS_CoV_2废水测序基因组变异追踪补充材料
数据集概述 本数据集为论文《Tracking SARS-CoV-2 genomic variants in wastewater sequencing data with LolliPop》的补充材料，包含支持该研究的相关辅助文件。 文件详解 文件名称: lollipop_supplementary.zip 文件格式: ZIP（压缩包格式） 文件内容:...
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piRNA通路中的反复与近期选择性清除数据集
数据集概述 本数据集围绕piRNA通路基因的选择性清除展开，通过分子进化和群体遗传学方法，分析果蝇物种中rhino、krimper、aubergine等基因的正选择模式，探讨转座子与piRNA沉默机制的进化军备竞赛。 文件详解 该数据集包含三类文件，具体说明如下： - 文档类文件（PDF格式，共19个）： -...
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多组学尿路上皮抗PDL1分析数据文件
数据集概述 本数据集是用于支持多组学尿路上皮抗PDL1分析项目的数据文件集合，包含TCRS、Kallisto和VCFs三种类型的压缩数据文件，为相关生物信息学分析提供原始数据支持。 文件详解 文件名称: tcrs.zip 文件格式: ZIP (.zip) 内容说明: 可能包含T细胞受体（TCR）相关的测序或分析数据 文件名称: kallisto.zip...
