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manabuishii_yevis_getting_started_基因序列格式转换工作流数据
数据集概述 本数据集是manabuishii/yevis-getting-started项目中的一个工作流，包含14个文件，涉及基因序列数据格式转换相关的工作流定义、输入配置、示例数据及说明文档，支持CRAM与BAM、FASTQ与BAM等格式转换任务，适用于生物信息学序列数据处理场景。 文件详解 工作流定义文件（.wdl） 文件名称：cram-to-...
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metabarcoding_biovolume_correction_硅藻分子生物监测定量偏差校正数据
数据集概述 本数据集为论文补充数据，核心内容是硅藻分子生物监测中细胞生物量校正因子的应用相关数据，包含5个模拟群落、3次重复的原始测序数据及对应信息表，用于解决 metabarcoding 定量偏差问题，支持硅藻分子生物监测方法优化。 文件详解 15 fastq files raw reads (5 mock communities, 3...
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基于Platygonus_compressus的已灭绝北美平头野猪古DNA及现存物种线粒体基因组研究数据
数据集概述 本数据集包含已灭绝北美平头野猪（Platygonus compressus）的古DNA数据，以及现存野猪科物种的完整线粒体基因组序列。数据用于分子系统发育分析，以明确古生物与现存物种的亲缘关系、分化时间，并初步探究平头野猪的种群遗传多样性。数据集共9个文件，涵盖测序数据、分析脚本及结果文件。 文件详解 测序数据文件...
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Metabarcoding_eDNA通过Obitools教程训练数据集
数据集概述 本数据集是用于"Metabarcoding/eDNA through Obitools"教程的训练数据，包含多种格式的文件，支持使用Galaxy平台进行生物信息学分析实践，为学习宏条形码和环境DNA（eDNA）数据处理提供基础数据资源。 文件详解 文件名称: wolf_tutorial.zip，文件格式:...
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帕金森病患者与健康对照者MTG靶向富集单核RNA测序数据集
数据集概述 本数据集包含帕金森病患者与健康对照者的人类中颞叶皮层（MTG）样本经靶向富集的单核RNA测序（snRNAseq）原始FASTQ数据，是PD5D队列研究的一部分，该队列还包含基因分型、单细胞ATACseq及空间转录组学等多组学数据。 文件详解 文件名称: scherzer-pmdbs-sn-rnaseq-mtg-...
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代谢型谷氨酸受体4靶向癌症免疫治疗研究数据集
数据集概述 本数据集围绕代谢型谷氨酸受体4（GRM4）在癌症免疫治疗中的作用展开，包含基因敲除、药物抑制实验及单细胞测序等相关数据，支撑GRM4靶向作为癌症免疫治疗新策略的研究结论。 文件详解 差异表达基因数据文件：...
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昆士兰野生考拉口腔微生物组16S_rRNA基因测序数据集
数据集概述 该数据集包含澳大利亚昆士兰8只野生考拉口腔菌斑样本的Illumina MiSeq 16S rRNA基因测序原始数据（FASTQ格式）及关联元数据，围绕不同年龄组（幼崽、少年、成年、老年）和牙周健康状况（健康、牙龈炎、牙周炎）展开，支持相关研究发现。 文件详解 数据集为一个ZIP压缩包，包含以下内容： - 测序数据文件: -...
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鸡肠道微生物组成员限制大肠杆菌中抗菌耐药质粒传播数据集
数据集概述 本数据集围绕鸡肠道乳酸菌对大肠杆菌中IncI1型ESBL耐药质粒（携带blaCTX-M-1）传播的影响展开，包含体外实验的生长、质粒转移数据及测序文件，结合数学模型参数，为研究微生物互作与质粒传播的关系提供支持。 文件详解 说明文档与元数据： Data_description.pdf：PDF格式，数据集内容描述文档...
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EAW_2018_FASTQ_18S核糖体RNA基因生物信息学课程数据集
数据集概述 本数据集包含2018年9月在意大利加尔达湖不同区域及深度采集的6个样本的18S核糖体RNA基因测序数据，采用Illumina MiSeq技术生成，含正向（R1）和反向（R2）测序文件，以及相关描述文档和元数据，用于生物信息学课程教学与分析实践。 文件详解 描述文档：...
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BeerDEcoded纳米孔测序运行数据集_智美_2019
数据集概述 该数据集记录了2019年11月26日使用纳米孔测序技术对智美（Chimay）啤酒进行DNA提取与测序的实验数据，包含测序原始数据及相关说明文档，用于支持啤酒相关微生物或成分的分子分析研究。 文件详解 BeerDEcoded_Chimay_Flongle_2019_11_26.zip：压缩文件格式，可能包含测序实验的相关数据文件...
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陆生脊椎动物环境DNA检测底物对比研究数据集
数据集概述 本数据集围绕陆生脊椎动物环境DNA（eDNA）检测的底物对比研究展开，包含法国 Landes 森林及蒙彼利埃动物园的样本采集、测序数据及分析脚本，用于评估土壤、树叶拭子、蜘蛛网三种底物的检测效果，为生物监测提供数据支持。 文件详解 样本采集数据文件：...
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斯利科克溪流域生物资源调查2016年扫网样本宏基因组原始数据集
数据集概述 该数据集包含2016年美国阿拉斯加基奈半岛斯利科克溪流域生物资源调查中扫网样本的宏基因组原始数据，含125个样本的高通量测序FASTQ文件及采集数据，用于分析流域内节肢动物等生物多样性。 文件详解...
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帕金森病5D图谱中颞中回单核RNA测序数据集
数据集概述 该数据集包含来自帕金森病患者与健康对照者的九十四例人类颞中回样本的单核RNA测序（snRNAseq）原始FASTQ数据，属于帕金森病5D图谱的一部分，同一受试者还包含基因分型、单细胞ATACseq及空间转录组学等多组学数据。 文件详解 文件名称: scherzer-pmdbs-sn-rnaseq-mtg_README.pdf 文件格式:...
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EAW_16S_rRNA基因生物信息学课程FASTQ文件2018
数据集概述 本数据集包含二零一八年九月在意大利加尔达湖不同区域及深度采集的六个样本的十六S核糖体RNA基因测序数据，采用Illumina MiSeq技术生成，含正向（R1）和反向（R2）测序文件及相关描述文档，适用于生物信息学课程教学与实践。 文件详解 该数据集包含十四份文件，具体说明如下： - 描述文档: -...
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ASAP_CRN_Cloud_PD5D_MTG_snRNAseq_Based_人类中颞叶皮层单细胞转录组完整数据
数据集概述 该数据集包含来自帕金森病患者和健康对照者的九十四个人类中颞叶皮层（MTG）样本的单细胞核RNA测序（snRNAseq）原始FASTQ数据，是PD5D图谱的一部分，同一受试者还进行了基因分型、单细胞ATACseq等多组学分析。 文件详解 文件名称: scherzer-pmdbs-sn-rnaseq-mtg_README.pdf 文件格式:...
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建筑废弃物作为人工湿地基质可用性提升研究数据集
数据集概述 本数据集围绕提升建筑废弃物作为人工湿地基质可用性的研究展开，聚焦于基质混合与碳氮比调整对相关生物指标的影响，包含24个原始测序数据文件，为研究建筑废弃物在人工湿地中的应用潜力提供数据支持。 文件详解 数据集包含一个目录及24个FASTQ格式文件，具体说明如下： - 目录: Data-Enhancing the availability of...
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BE_2_C神经母细胞瘤细胞Brunello全基因组敲除文库INKV存活筛选数据集
数据集概述 该数据集包含BE(2)-C神经母细胞瘤细胞中Brunello全基因组敲除文库经INKV存活筛选后的下一代测序（NGS）数据，记录了筛选后文库群体的基因敲除相关序列信息。 文件详解 数据集包含一个目录及6个FASTQ格式文件，具体如下： - 目录: Brunello Whole Genome Knockout library in...
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酵母有丝分裂双链断裂中异源双链DNA长度调控数据集
数据集概述 本数据集包含酵母有丝分裂双链断裂过程中异源双链DNA（hetDNA）长度调控研究的原始测序数据及相关文件，涉及多种酵母菌株的PacBio原始测序数据和条形码序列，为解析不同基因（如mlh1、mre11等）对hetDNA长度的调控机制提供基础数据。 文件详解 条形码序列文件（TXT格式，共10个）： 示例文件：Barcodes for...
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长期施肥稻田氨氧化古菌多样性与群落结构数据集
数据集概述 该数据集聚焦韩国密阳研究站长期施肥稻田实验，探究不同施肥处理对氨氧化古菌种群数量、群落组成及与土壤参数关系的影响，包含土壤酶活性、硝化潜力测定及基于454焦磷酸测序的古菌多样性数据。 文件详解 该数据集包含一个目录下的十五个FASTQ格式文件，具体说明如下： - 目录名称: Diversity and community structure...
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条形码标记SARS_CoV_2病毒在仓鼠模型中暴露持续时间和途径对传播瓶颈影响的数据集
数据集概述 本数据集围绕条形码标记的SARS-CoV-2病毒展开，通过仓鼠模型研究暴露持续时间和途径对病毒传播瓶颈的影响。包含下一代测序的fastq文件、条形码计数矩阵及RT-qPCR病毒滴度结果，为病毒传播机制研究提供数据支持。 文件详解 主说明文件: 文件名称: Master-README.txt 文件格式: TXT 内容:...
