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Hadza_Prevotella_Based基因组组装与CAZy预测完整研究数据2023
数据集概述 本数据集包含Gellman et al. 2023年研究中Hadza Prevotella的基因组组装、注释及CAZy（碳水化合物活性酶）预测结果，涉及相关菌株（如Pcopri、Btheta、Buniformis）的基因组支架、基因注释文件、CAZy酶分类数据及分析代码，共47个文件，用于支持饮食来源碳水化合物对肠道菌群定植影响的研究。...
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破伤风梭菌_Clostridium_perfringens_1_2_丙二醇细胞壁研究数据
数据集概述 本数据集围绕产气荚膜梭菌（Clostridium perfringens）对1,2-丙二醇的利用及其与细胞包膜的相互作用展开，包含微阵列杂交后的荧光强度数据，以及实验所用的组装注释基因组文件，为研究该菌的代谢机制与细胞包膜相互作用提供基础数据支持。 文件详解 Clostridium_MM2023_5.gff 文件格式：GFF...
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Melanaphis_sacchari_Based甘蔗蚜染色体级别基因组组装与注释数据_科研版
数据集概述 本数据集提供甘蔗蚜（Melanaphis sacchari）的染色体级别基因组组装与注释数据，包含356.1 Mb基因组序列（其中85.5%位于3条常染色体和X染色体）、16.29%重复序列注释、12,350个蛋白编码基因（BUSCO完整性达95.8%），以及系统发育分析相关信息，为蚜虫基因组进化研究和害虫防治提供基础资源。 文件详解...
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Rubioideae_Phylogenomics_Based_茜草亚科质体系统发育与核质不一致性研究数据
数据集概述 本数据集基于核基因组目标捕获测序项目的脱靶 reads 构建质体基因组系统发育树，探究茜草科茜草亚科的进化关系及核质不一致性。包含一百二十个质体基因组序列，通过公共双端 Illumina 测序数据组装得到，支持亚族内及亚族间多数关系的解析，识别出核质不一致案例，为植物系统发育研究提供数据支撑。 文件详解 README.md 文件格式：MD...
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Dryad_Based_superasterid基因组深度学习NLR注释数据集v250214_91366
数据集概述 本数据集通过深度学习工具Helixer对230个高质量superasterid基因组进行标准化从头注释，结合NLRtracker识别出91,366个NLRs及相关序列。数据按APG IV系统发育目分类存储，包含基因组组装、注释文件、NLR序列及补充元数据，支持superasterid植物NLR免疫受体的比较基因组学与进化研究。 文件详解...
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Cactophilic_Drosophila_Genomes_Based_嗜仙人掌果蝇物种基因组及注释数据
数据集概述 本数据集包含嗜仙人掌果蝇物种的基因组序列、基因注释、转座元件（TE）注释及质量控制数据，用于支持“转座元件促进嗜仙人掌果蝇宿主转移相关基因进化”的研究。数据集涵盖多种果蝇物种的基因组组装、注释文件及测序质量控制文件，共27个文件，是研究果蝇基因组进化与功能的基础数据资源。 文件详解 基因组组装文件...
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terranigra_dataset_Based_Fictibacillus_terranigra分析数据集
数据集概述 本数据集包含Fictibacillus terranigra的分析数据，共13个文件，涵盖基因注释、功能预测、代谢分析等内容，涉及blastKOALA、Prokka注释、microtrait筛选、dbcan3分析、DRAM及METABOLIC结果等多种类型文件，可用于研究该菌株的基因功能与代谢特征。 文件详解 基因功能注释文件...
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Tuber_melanosporum_Genome_Resequencing_SNP_Survey_Data
数据集概述 本数据集为佩里戈尔黑松露（Tuber melanosporum Vittad.）的全基因组单核苷酸多态性（SNP）调查数据，通过Illumina高通量重测序技术对6个地理来源的菌株基因组进行测序分析，识别出442326个核心基因组SNP，包含重复序列及编码区的SNP分布，为该真菌的群体遗传学和基因组学研究提供资源。 文件详解...
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加勒比胎生石龙子Spondylurus_nitidus与S_culebrae染色体水平参考基因组数据集
数据集概述 本数据集为加勒比胎生石龙子Spondylurus nitidus和S. culebrae的高质量染色体水平参考基因组组装结果，包含基因序列、注释信息、统计文件等，支撑对这两种石龙子基因组结构与功能的研究。 文件详解 基因序列文件：...
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烟草天蛾基因组从头组装数据集
数据集概述 本数据集提供烟草天蛾（Manduca sexta）的新参考基因组JHU_Msex_v1.0，通过现代技术从头组装，提升连续性、准确性和完整性。基因组大小470 Mb，连续性为原版本的约25倍，scaffold N50超14 Mb，注释含25,256个基因，可供公开使用。 文件详解...
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利什曼原虫与蜥蜴利什曼原虫跨亚属杂交支持材料数据集
数据集概述 本数据集为利什曼原虫与蜥蜴利什曼原虫跨亚属杂交研究的支持材料，包含基因表达计数、参考基因组及注释文件、直系同源群列表、基因分布与GO富集分析图表等，支撑寄生虫基因组兼容性与转录组适应性研究。 文件详解 基因表达计数文件： counts_on_hybrid.tsv：TSV格式，含杂交参考基因组（利什曼原虫与蜥蜴利什曼原虫拼接）的基因原始计数...
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五桠果属五桠果高质量基因组组装数据集
数据集概述 本数据集提供五桠果（Dillenia turbinata）的染色体级高质量基因组组装及注释结果。五桠果属于五桠果目，是理解被子植物演化的关键类群。基因组组装长度约7.24亿碱基对，BUSCO完整性达97%，包含36,967个蛋白编码基因模型，为比较与演化基因组学研究提供核心资源。 文件详解 文件名称: README.md，格式:...
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促进乳腺肿瘤转移的瘤内细菌鉴定支持数据集
数据集概述 本数据集是Gerbec等人题为《促进乳腺肿瘤转移的瘤内细菌鉴定》的研究论文的支持数据集，包含8个支持数据集及说明各数据集的图例文件，覆盖细菌分类、基因组分析、注释等多维度实验数据。 文件详解 该数据集包含40个文件，覆盖多种格式与研究内容，具体说明如下： - 16S rRNA序列文件（.fa格式）: -...
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江户明樱蛤染色体水平基因组组装数据集
数据集概述 本数据集为江户明樱蛤的染色体水平基因组组装数据，包含基因组序列、基因家族注释、系统发育树等信息，旨在揭示其血红素生物合成的分子基础，为贝类遗传育种与群体遗传学研究提供基因组资源。 文件详解 该数据集包含多个文件，具体说明如下： - 文档与说明文件： - readme.txt：文本格式，提供数据集标题、作者信息等基础说明 -...
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黄病毒科系统发育研究补充材料数据集
数据集概述 本数据集为黄病毒科系统发育研究的补充材料，包含基因组数据、基因注释、系统发育树分析结果及相关配置文件等，支持对黄病毒科进化关系的深入研究，提供标准化的实验参数与可视化结果。 文件详解 表格文件（CSV格式）： tableS1.csv：基因组数据，含ID、终端名称、属分类及注释信息...
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曼氏血吸虫组装染色体与ZW性别决定系统进化数据集
数据集概述 该数据集提供曼氏血吸虫组装染色体数据，其基因组约380MB，含7对常染色体和2条性染色体。数据基于Wellcome Sanger研究所等机构的测序项目，经多轮组装优化，助力研究其ZW性别决定系统的进化机制。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件，具体说明如下： - 基因组序列与注释文件： -...
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霞多丽基因组组装与注释数据集
数据集概述 本数据集包含霞多丽（Chardonnay）葡萄的基因组组装数据及相关注释信息，涵盖组装序列、基因预测、功能注释、重复序列、染色体定位、亲本溯源等多维度内容，为葡萄基因组学研究提供全面的数据支持。 文件详解 基因组组装文件： chardonnay_p-ctg.fasta.gz：FASTA格式，单倍体主组装序列（primary contigs）...
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突尼斯优良椰枣品种Deglet_Nour基因组草图数据集
数据集概述 该数据集为突尼斯优良椰枣品种Deglet Nour的基因组草图，包含其基因组序列、编码序列、蛋白质序列及注释信息。通过与Barhee BC4参考基因组比对，识别出与成熟过程和果实品质相关的遗传变异，丰富了椰枣基因组资源，尤其填补了北非品种的空白。 文件详解...
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巴拉圭冬青YMM1核基因组注释关联数据集
数据集概述 该数据集包含巴拉圭冬青（Ilex paraguariensis）YMM1核基因组注释的关联数据，涵盖基因预测、基因注释及组装转录本列表三类文件，为基因组功能解析提供基础数据支持。 文件详解 基因预测文件（共16个）： 文件示例：BRAKER3 37732 gene models.gff.gz、Augustus (1) 33227 gene...
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原猴亚目灵长类基因组注释GFF文件数据集
数据集概述 该数据集包含采用长读长技术测序的九种原猴亚目灵长类动物的基因组注释文件，以GFF格式存储于压缩包中。对应物种的基因组组装数据已提交至NGDC数据库，为灵长类基因组研究提供注释支持。 文件详解 文件名称：Strepsirrhini Primate Genome Annotation GFF Files.zip...
