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Schneider_Based_针叶树幼苗小规模移栽施肥处理实验数据_2024
数据集概述 本数据集为Schneider等人2024年研究的处理后数据，聚焦小规模移栽施肥对针叶树幼苗生长及真菌群落建立的影响。包含土壤数据、微生物测序数据、样本元数据等9个文件，覆盖样本处理、生长指标监测及真菌群落分析等内容，支持林业生态相关研究。 文件详解 土壤及PLFA数据文件：...
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Supplementary_material_1_澳大利亚蚂蚁鉴定补充材料数据
数据集概述 本数据集为澳大利亚蚂蚁形态与高通量测序研究的补充材料，包含180份蚂蚁样本的元数据，用于支持生物安全与生物多样性领域的蚂蚁鉴定工作，共包含1个文件。 文件详解 文件名称：oo_1157615.docx 文件格式：DOCX...
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NONINVASIVE_Based_遗传非侵入性采样有效性测试_无尾熊种群数据
数据集概述 本数据集围绕遗传非侵入性采样在种群遗传监测中的有效性展开研究，以自由放养无尾熊种群（n=430）的高质量SNP数据为基础，分析了遗传非侵入性样本典型的SNP面板大小、检出率及采样强度对遗传多样性、近交系数、内部关联性等遗传指标准确性的影响，为保护决策提供数据支持。 文件详解 README文档 文件名称：README_Dec2021.docx...
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Pacific_Trout_Based_墨西哥太平洋鳟鱼遗传结构与保护研究数据
数据集概述 本数据集包含墨西哥太平洋鳟鱼（Oncorhynchus属）的遗传结构研究数据，涵盖微卫星和单核苷酸多态性（SNP）位点的基因型数据及样本元数据，用于分析其遗传多样性、种群结构及非本地虹鳟鱼的基因渗入情况，为该物种的保护策略提供科学依据。 文件详解 README_for_DA_genotypes.txt 文件格式：TXT...
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Computational_Metabolomics_Tutorial_原始数据文件
数据集概述 本数据集为计算代谢组学教程配套原始数据，包含二十个原始数据文件、一份样本元数据文件和一份已知目标列表文件，共二十二个文件。数据支持代谢组学数据分析相关教程的实践操作，适用于学习和掌握代谢组学数据处理方法。 文件详解 原始数据文件（Raw data files）...
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URT_微生物组_家畜暴露_基于荷兰山羊养殖户与农村居民鼻咽和口咽微生物组的过滤数据
数据集概述 本数据集包含荷兰山羊养殖户与农村居民的鼻咽（NP）和口咽（OP）微生物组数据，以phyloseq S4对象形式提供，包含扩增子序列变体（ASV）表、分类学表和样本元数据。数据经DADA2 pipeline处理及去污染、低质量样本过滤，最终保留904个NP样本和1046个OP样本，支持微生物组关联分析。 文件详解...
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Eucalyptus_microcarpa_Based景观基因组学遗传多样性分析数据
数据集概述 本数据集通过DArTseq基因组方法，分析澳大利亚东南部Eucalyptus microcarpa（Grey Box）的基因组多样性模式，涵盖大型残遗林、小型隔离残遗林及植被恢复地的样本，对比不同林分类型的基因组多样性与分化特征，为植被恢复的遗传多样性评估提供依据。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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Plasma_LC_MS_MS_Based_亮氨酸补充对1型糖尿病小鼠血浆代谢组学研究数据集
数据集概述 本数据集为亮氨酸补充对链脲佐菌素诱导的1型糖尿病小鼠的非靶向LC-MS/MS代谢组学研究数据，包含原始离子特征表、样本元数据及实验方案文件。研究涉及24只雄性C57BL/6J小鼠，分为对照组、对照组+亮氨酸、1型糖尿病组、1型糖尿病+亮氨酸四组，共3个文件。 文件详解 Table S1. Raw LC‑MSMS ion...
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Genome_wide_parallelism_城市蜥蜴当代适应性基因组分析数据
数据集概述 本数据集为论文“Genome-wide parallelism underlies contemporary adaptation in urban lizards”（Winchell et al., 2023, PNAS）的配套分析文件，包含全部分析与可视化所需的R脚本及数据文件，支持复现研究结果，共4个文件。 文件详解 样本元数据文件...
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Beacon_Training_Material_Beacon_V2教程训练数据
数据集概述 本数据集为Galaxy Training Material中“Working with Beacon V2”教程的训练数据，包含来自1000 Genomes Project和GDC数据库的5个文件，覆盖JSON、XLSX、VCF、TSV格式，用于指导用户学习Beacon V2的构建、数据转换、导入及变体查询技能，支撑教程中的实操练习。...
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SAMS_Scotland_IMTA_Lab_微塑料相关微生物组研究数据_2022
数据集概述 本数据集为2022年5月在苏格兰IMTA实验室（SAMS）开展的微塑料相关微生物组研究数据，涵盖微塑料及周边海水样本的微生物多样性分析，包含样本元数据信息，共1个文件。 文件详解 文件名称：metadata_mp_microbioma.xlsx 文件格式：XLSX...
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Rare_taxa_Source_禁牧下灌木荒漠草原稀有类群驱动土壤有机碳积累研究数据
数据集概述 本数据集围绕禁牧处理下灌木荒漠草原的稀有类群与土壤有机碳积累关系展开，包含样本元数据、多样性指数、OTU表、细菌组成数据及相关分析代码，共11个文件，用于支撑生态学研究中稀有类群对土壤碳积累的驱动机制分析。 文件详解 数据文件（共6个） metadata.csv（CSV格式）：包含样本ID、土层（如0-5...
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E_MTAB_6422_PRJEB24664_Based拟南芥生命周期基因表达图谱数据
数据集概述 本数据集为拟南芥（Col-0生态型野生型）全生命周期基因表达图谱，基于RNA-Seq技术构建36个基因表达文库，覆盖幼苗、莲座叶、根、花序、花、果实荚、种子等组织部位，以及2叶期、6叶期、12叶期、衰老期等发育阶段，每个组织和发育阶段包含3个生物学重复，记录了不同年龄样本的转录程序特征。 文件详解...
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Soygarden_Citizen_Science_北方纬度大豆环境适应根瘤菌研究数据
数据集概述 本数据集围绕北方纬度大豆种植的环境适应型根瘤菌研究，包含33个文件，涉及生物DNA、基因分析、统计模型构建、实验样本数据等内容，主要用于通过公民科学方法快速培育适应环境的大豆根瘤菌，涵盖数据文件、分析脚本及模型文档。 文件详解 数据文件...
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Freezing_Microbiome_阴道拭子冷冻DNA纯化微生物组实验数据2024
数据集概述 本数据集包含阴道拭子样本与内部质控（IQC）样本的微生物宏基因组测序数据，已按丹麦法律伦理规范移除宿主DNA。数据涵盖分类学谱（MetaPhlAn4输出）、样本元数据及质控数据，用于研究冷冻处理对阴道拭子微生物组组成的影响。 文件详解 文件名称：copi of...
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Periparus_ater_Based喜马拉雅煤山雀杂交区不对称等位基因渐渗研究数据
数据集概述 本数据集为喜马拉雅中部煤山雀杂交区的种群遗传分析数据，涵盖西部"点翅山雀"与东部喜马拉雅煤山雀杂交带的表型及遗传信息，包含线粒体谱系混合、微卫星位点不对称渐渗等研究相关的样本元数据、基因序列及分析文档，共8个文件。 文件详解 文档类文件（.docx格式，共4个）...
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CyTOF_Based_MPN患者PBMC样本免疫监测BinaryClust2测试数据
数据集概述 本数据集是BinaryClust2管道的测试数据，包含11例骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者的外周血单个核细胞（PBMC）样本。样本通过36标记面板的质谱流式细胞术（CyTOF）获取，用于免疫监测研究。数据集包含清理后的FCS原始数据、样本元数据、面板元数据及预定义的R对象文件，共16个文件。 文件详解 原始数据文件...
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ZooMS_Based_现代澳大利亚有袋类动物胶原蛋白MALDI_TOF_MS光谱数据
数据集概述 本数据集包含现代澳大利亚有袋类动物提取胶原蛋白的MALDI-TOF-MS光谱数据，用于开发ZooMS（质谱考古学）的肽标记物。数据包含光谱文件及样本元数据，支持考古学中物种鉴定相关研究。 文件详解 文件名称：Metadata modern references.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：包含物种信息、样本编号及LC-...
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Anna_s_hummingbird_Based_肠道微生物组组成与宿主因素关联分析数据
数据集概述 本数据集针对安娜蜂鸟（Calypte anna）的肠道微生物组进行分析，通过16S rRNA基因扩增子测序，探究其粪便与肠道不同部位微生物组的差异，以及性别、年龄、痘病毒感染状态等宿主因素对微生物组成的影响，包含4个相关文件。 文件详解 Readme.docx 文件格式：DOCX...
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Gut_Brain_Axis_Based_肠道细菌互作神经动力学RNA_seq分析数据集
数据集概述 本数据集包含肠道-大脑轴细菌直接互作神经动力学研究的RNA-seq分析数据，包括计数矩阵、样本元数据及差异基因表达（DGE）分析代码，共22个文件，覆盖基因表达定量、元数据记录、生物信息学分析脚本等内容，支持肠道微生物与神经互作的转录组学研究。 文件详解 数据文件...
