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Lepilemur_mitogenomes_Based运动狐猴系统基因组重建及生物地理学分析数据
数据集概述 本数据集包含35个完整线粒体基因组的分析结果,覆盖运动狐猴属(Lepilemur)全部26个已识别类群,用于系统基因组重建及马达加斯加生物地理学推断。数据支持25个单系谱系的恢复,以及Lepilemur mittermeieri与Lepilemur...
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Stevardiinae_Molecular_Phylogeny_鱼类亚科分类与繁殖性状进化研究数据
数据集概述 本数据集为Stevardiinae亚科(脂鲤科)的分子系统发育研究数据,包含该亚科鱼类的系统发育树与基因序列比对文件。研究涉及355个样本、153个假定物种及32个属,基于7个基因片段(线粒体与核基因)构建系统发育关系,用于验证亚科单系性、内部亲缘关系,支撑分类修订及繁殖性状进化分析。 文件详解 Stevardiinae_trees.zip...
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TransadriaticNiphargus_Based_亚得里亚海地下端足类系统发育与生物地理数据
数据集概述 本数据集为亚得里亚海两侧地下端足类(Niphargus属)的生物地理研究数据,包含系统发育分析、物种界定、生物地理模型构建等相关文件,用于验证海退-海侵循环对端足类分布模式的影响,支持“扩散-隔离交互作用塑造分布”的结论,共9个文件。 文件详解 系统发育分析文件...
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基于UCE技术的墨西哥短吻石龙子_Plestiodon_brevirostris_系统分类学_生物地理学及基因组学研究数据
数据集概述 本数据集为Plestiodon brevirostris组石龙子生物地理学系统基因组学研究的原始数据,包含58个样本的3282个超保守元件(UCEs)序列及相关分析文件。数据用于构建时间校准的系统发育树,探究该组石龙子的地理分布历史与墨西哥跨火山带形成的关联,共包含4个文件。 文件详解 README文件...
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宿主_寄生虫祖先互作的贝叶斯推断数据集
数据集概述 本数据集围绕宿主-寄生虫共进化历史的贝叶斯推断方法展开,包含模型模拟代码、系统发育数据文件及补充文档,支持研究宿主范围演化的复杂性(如宿主的获得与丢失),并应用于34种蛱蝶与25个被子植物科的互作历史分析。 文件详解 代码文件: Rscript_simulation.R、Rscript_empirical.R:...
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动物代谢缩放生长与繁殖数据集
数据集概述 该数据集包含动物代谢率、生长速率及年度繁殖的缩放关系数据,配套R脚本支撑“代谢缩放是生活史优化产物”相关研究。含结构化数据、分析代码、图表及文献参考,覆盖统计模型构建、生长曲线模拟等内容,为动物生理生态学与进化生物学研究提供数据与方法支持。 文件详解 数据文件: Weight for...
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fairy_wrasses进化辐射的系统基因组学分析补充材料
数据集概述 该数据集为fairy wrasses(Teleostei: Labridae: Cirrhilabrus)进化辐射的系统基因组学分析补充材料,包含基因树、系统发育树、矩阵文件、电子补充材料文档等29个文件,用于支持相关研究的结果验证与深入分析。 文件详解 基因树与系统发育树文件:...
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扁甲总科系统发育CAT_GTR模型重新分析数据集
数据集概述 该数据集基于Gimmel等(2019)的数据,使用CAT-GTR+G4位点异质性混合模型对扁甲总科(Cleroidea)的系统发育关系进行重新分析,包含分子分析所需数据及输出文件,关联于特定研究论文。 文件详解 数据文件: cleroidfull.phy:系统发育分析的输入数据文件 分析结果文件:...
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濒危淡水海豹虱子近交水平与空间及宿主关联结构数据集
数据集概述 本数据集围绕濒危淡水海豹(芬兰塞马环斑海豹)的宿主特异性虱子(Echinophthirius horridus)展开,通过种群基因组方法分析其近交水平、空间种群结构及与宿主的关联特征,为濒危物种寄生虫的保护研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种类型文件,具体说明如下: - 文档与文本文件(.txt格式,共12个): -...
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Hemileuca_maia物种复合体系统基因组学研究数据集
数据集概述 该数据集为Hemileuca maia物种复合体(天蚕蛾科)的系统基因组学研究数据,通过全基因组单核苷酸多态性分析群体结构与适应性特征,探究分类学与生态特化的不一致性,揭示基因流背景下局域适应机制及地理隔离对基因组分化的作用。 文件详解 phylo.phy: 系统发育分析文件,可能包含用于构建物种或群体间进化关系的序列数据...
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智利阿塔卡马沙漠Tillandsia_landbeckii进化时间线数据集
数据集概述 本数据集围绕智利阿塔卡马沙漠特有植物Tillandsia landbeckii的进化时间线展开,包含基于全质体DNA序列数据的系统发育分析文件,涉及物种分化时间及与近缘种的遗传接触研究。 文件详解...
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蚂蚁系统发育中病毒多样性与协同进化动力学数据集
数据集概述 该数据集包含研究中评估的所有病毒分支的比对文件和系统发育树,以及鉴定出的所有病毒序列的核苷酸序列数据,为分析蚂蚁系统发育中病毒多样性与协同进化动力学提供支持。 文件详解 该数据集包含多种格式的文件,具体说明如下: - 病毒序列文件: - final_viruses_contigs.fasta:...
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子代大小与温度关系的代谢及发育成本数据集
数据集概述 本数据集围绕子代大小与温度的关系展开,结合生活史理论和代谢理论,通过实验室实验与72种 ectotherms 物种的元分析,探究温度对母体投资的影响及发育成本的变化机制,包含实验数据、分析代码及物种特异性文档。 文件详解 该数据集包含15个文件,具体说明如下: - 文档文件(.pdf): -...
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结核分枝杆菌萜烯核苷进化保留分析数据集S3
数据集概述 本数据集包含支持结核分枝杆菌萜烯核苷进化保留研究的全部原始数据与分析代码,可复现相关统计分析及图表生成。涵盖代谢、转录组、表型等多维度实验数据,以CSV为主要格式,辅以R代码、系统发育树及HTML报告等文件。 文件详解 原始数据文件(CSV格式,共12个):...
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双门齿类草食动物颅面形态与咬合力关联数据集
数据集概述 本数据集围绕双门齿类草食动物的颅面形态与咬合力关系展开,包含现生动物的形态学、生物力学数据及已灭绝短面袋鼠的食性预测分析资料,为研究动物摄食生态与颅面结构演化提供支持。 文件详解 文件名称: landmarks.txt,格式: TXT,内容: 可能包含颅面形态学研究中的地标点坐标数据,用于形状分析 文件名称:...
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泛甲壳动物系统发育组学中丝氨酸密码子使用偏好数据集
数据集概述 本数据集围绕泛甲壳动物系统发育关系研究,分析Regier等2010年组装的62个蛋白质编码基因中,核苷酸与氨基酸数据构建系统发育树的差异,重点探究丝氨酸等同义密码子使用偏好对拓扑结构的影响。 文件详解 文件名称: ser_rev_suppl.info.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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蜘蛛蝇系统发育基因组学研究补充材料数据集
数据集概述 本数据集为蜘蛛蝇(双翅目,Acroceridae)系统发育基因组学研究的补充材料,包含支撑论文结论的补充图表、核苷酸与氨基酸序列比对及基因分区文件,用于揭示其演化关系及核苷酸与氨基酸数据的不一致性。 文件详解 该数据集包含六个独立文件,具体说明如下: - 文档类文件: -...
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性状进化早期爆发检测方法改进数据集
数据集概述 本数据集围绕性状进化早期爆发检测方法展开,包含改进后的系统发育比较方法相关代码、数据及文档,用于提升早期爆发模式的检测能力,以鲸类体型进化为例验证方法有效性。 文件详解 代码文件(.r格式): cetacean analyses.R:鲸类体型进化分析的R代码文件...
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长尾黑颚猴进化辐射研究数据集
数据集概述 该数据集基于新一代DNA测序技术,对博物馆保存的117年历史标本进行线粒体基因组测序,包含92个长尾黑颚猴(Cercopithecini族)样本数据,用于推断其进化关系、分化时间及地理分布,揭示非洲森林变化对其辐射演化的影响。 文件详解 文档与图表文件: Guschanski_et_al_SI.doc:可能包含研究补充信息的Word文档...



