找到178个数据集

标签: TRE

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  • Opiliones_Source_历史乙醇保存博物馆标本序列捕获系统发育基因组学研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集围绕历史乙醇保存博物馆标本的序列捕获系统发育基因组学研究展开,包含35份新鲜标本与15份历史乙醇保存标本(蛛形纲盲蛛目)的超保守元件(UCEs)测序数据,验证了该类标本在现代基因组学研究中的应用价值,涉及基因位点提取、系统发育分析等相关结果文件。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式)...
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  • Eocaiman_cavernensis_古生物形态学重新描述与系统发育亲缘关系研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集为阿根廷始新世凯门鳄亚科物种Eocaiman cavernensis的重新描述与系统发育亲缘关系研究数据,包含形态学分析、系统发育树构建及相关支持信息,支持对该古生物分类地位及演化历史的研究。 文件详解 Supporting_Information.docx:DOCX格式,包含研究的补充支持信息文档 DOIs_for_AMNH-...
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  • Plotting_for_change_Based_澳大利亚淡水鱼候选物种分析框架数据集

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集为论文“Plotting for change: an analytic framework to aid decisions on which lineages are candidate species in phylogenomic species...
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  • Bivalve_Growth_Rate_Based_海洋双壳类生长率环境与进化因素研究数据

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集整合卫星测量的海表温度、叶绿素a浓度数据,以及195种海洋双壳类692个种群的生长系数、体型、寿命数据库,并结合新的双壳类最大似然系统发育树,用于研究温度、初级生产力和进化史对双壳类生长率的影响,共包含9个文件。 文件详解 系统发育相关文件 文件名称:Saulsbury_et_al_2019_alignment.nex...
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  • Poritiinae_Based_灰蝶科Poritiinae亚科分子系统发育研究数据与脚本

    2026年1月13日   

    数据集概述 本数据集包含灰蝶科Poritiinae亚科的分子系统发育研究数据与分析脚本,涵盖14个基因区域的218个样本(来自177个分类单元),涉及该亚科86%的属。数据支持将Poritiinae分为亚洲Poritiini族与非洲Liptenini族,并将Liptenini族重新划分为6个亚族,同时提供了祖先分布区重建等相关分析结果,包含8个文件。...
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  • Macropodoid_Inhibitory_Dynamics_巨足类牙齿性状演化研究数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集为研究巨足类牙齿性状丢失与重现中抑制动力学作用的相关数据,包含牙齿形态测量、系统发育树状态、时间数据、R分析脚本等13个文件,支持分析后下脊性状演化与抑制级联变化、体型及饮食生态的关联。 文件详解 数据文件 文件名称:Tooth_dimensions.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Basidiomycete_yeasts_Based_子囊菌大型地衣皮层担子菌酵母研究数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集围绕子囊菌大型地衣皮层中的担子菌酵母展开,包含研究相关的序列文件、系统发育树文件、分析脚本及结果文件等,共31个文件。数据支持揭示地衣共生系统中担子菌酵母的存在及其与地衣表型的关联,挑战传统“一地衣一真菌”范式。 文件详解 文档类文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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  • Crop_Pollinator_Based_作物传粉者依赖与生长形态对产量下降影响分析数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集包含用于分析作物传粉者依赖程度和生长形态对产量下降影响的原始数据与R分析脚本,支持复现论文中的分析过程与图表。数据整合了FAO作物产量数据、作物传粉者依赖分类、作物性状信息及系统发育树等内容,可用于探究农业生态中作物特性与产量变化的关联机制。 文件详解 数据集文件...
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  • Holocentridae_Based_珊瑚礁鱼类视觉系统与多银行视网膜研究数据_2020

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集围绕夜行性珊瑚礁鱼类Holocentridae科的视觉系统展开,包含其视网膜转录组组装、基因预测、系统发育树及补充图表等数据。研究发现该科鱼类具有类似深海鱼类的多银行视网膜,结合视杆细胞主导的结构与双色视觉潜力,为探究硬骨鱼类暗光视觉及多银行视网膜功能提供支持。 文件详解 转录组组装文件...
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  • LG_Phylogenies_Based_澳大利亚干旱区蜥蜴群落系统发育与物种互作研究数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集聚焦澳大利亚干旱区高多样性蜥蜴群落,包含32个采样点的群落调查数据、3个蜥蜴分支(Ctenotus石龙子、鬣蜥科、澳虎亚科壁虎)的物种水平分子系统发育树,以及物种栖息地偏好和食性数据,用于研究系统发育、群落组成与生态位演化的关系。 文件详解 README_for_LG_phylogenies.txt 文件格式:TXT...
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  • Antennaria_Gnaphalieae_Asteraceae系统基因组学与进化研究数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集围绕Antennaria属(菊科鼠麴草族)的系统发育关系展开,包含基于核基因和叶绿体基因的系统发育树、生物地理分析数据、形态特征演化及分子钟年代估算等相关文件,为该属的进化研究、多倍体起源及无融合生殖机制提供基础框架,共含18个文件。 文件详解 表格文件(XLSX格式,7个)...
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  • Compositae_Phylogenomics_Based_菊科系统发育基因组学研究数据集

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集为菊科系统发育基因组学研究成果,包含23个菊科物种及1个近缘科物种的测序数据。通过靶向捕获低拷贝序列与Illumina测序,生成795个核基因位点数据及叶绿体基因组数据,采用保守单拷贝基因与多拷贝基因聚类两种方法构建系统发育关系,为解析大型植物科的复杂亲缘关系提供方法框架与数据支撑。 文件详解 系统发育树文件...
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  • Cichlid_Pharyngeal_Jaw_Based_慈鲷咽颌与摄食器官进化整合研究数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集围绕慈鲷特化咽颌系统开展进化分析,对比新热带慈鲷与北美棘臀鱼(无特化咽颌)的摄食相关骨骼结构的进化整合度、差异度及进化速率,检验咽颌是否增强口腔颌与咽颌的进化独立性。包含原始数据、补充表格、分析代码及系统发育树等8个文件。 文件详解 文档类文件 文件名称:README_Cich_v_Cent_Jaw_Integration.docx...
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  • 瓜亚基尔壁虎_Cyrtodactylus_新几内亚喀斯特地区专性物种的形态学及遗传学证据数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集是关于新几内亚喀斯特地貌特化蜥蜴新物种的形态与遗传证据数据,包含遗传采样、形态测量、基因序列比对、系统发育树、主成分分析结果等7个附录文件,用于验证该新物种的分类地位及喀斯特适应特征,支持生物多样性与物种特化研究。 文件详解 遗传与采样文件 文件名称:Appendix S1. Genetic sampling.docx...
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  • Fireflies_Opsin_Genes_北美萤火虫视蛋白基因变异与信号生态学关联研究数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集围绕北美萤火虫视蛋白基因变异与信号生态学的关联展开,包含基因组、转录组测序及目标基因测序结果,涉及10种萤火虫的视蛋白基因序列、系统发育树及转录组组装文件,用于分析视蛋白基因进化与信号模式、光环境的关系,共8个文件。 文件详解 转录组组装相关文件 文件名称:Transcriptome_assemblies.zip 文件格式:ZIP...
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  • Treponema_primitia_Source_白蚁肠道螺旋体芳香族代谢途径基因研究数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集聚焦白蚁肠道螺旋体Treponema primitia的芳香族化合物间位裂解代谢途径基因,包含基因序列比对、系统发育分析结果及实验数据。涉及catechol 2,3-双加氧酶等关键基因的序列比对、系统发育树文件,以及生长数据、氧气渗透深度数据等实验记录,为研究该厌氧微生物的芳香族降解代谢提供支撑。 文件详解...
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  • Primate_Diversification_Based_灵长类多样化化石与系统发育研究数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集围绕灵长类多样化研究展开,整合约600种化石物种数据与覆盖90%现生物种的系统发育树,验证灵长类多样化的两个核心假设:多样化速率随时间增加、渐新世存在显著灭绝事件。数据集包含原始数据、模型结果、分析代码及补充材料,共6个文件,支持对比化石与系统发育数据对多样化模式的不同推断。 文件详解 数据文件(.xlsx格式,共3个)...
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  • Salix_Populus_Based_Salicaceae系统发育组学研究补充数据_2023

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集为Salicaceae科中Salix(柳属)和Populus(杨属)及其近缘类群的系统发育组学研究补充材料,包含基于787个基因区域构建的系统发育树、基因序列捕获数据、杂交事件分析结果及多样化速率变化证据,用于揭示导致系统发育冲突的古老杂交模式与差异化多样化机制,共9个文件。 文件详解 文档类文件...
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  • Neuron_Numbers_Based_鸟类神经元数量与脑大小及创新性关联研究数据_2022

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集基于一百一十一种鸟类的神经元数量估算,探究鸟类创新性与绝对及相对脑大小的关联。数据核心内容包括鸟类分类信息、神经元数量、脑及身体形态测量、创新性指标等,同时提供配套分析代码,支持验证神经元数量通过发育调节连接认知表现与脑大小的研究结论。 文件详解 数据文件 文件名称:KSepka_grades.csv 文件格式:CSV...
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  • Bacterial_Invasion_Mechanism_实验室细菌群落入侵成功及影响实验数据

    2026年1月12日   

    数据集概述 本数据集为实验室细菌群落入侵机制研究的实验数据,聚焦入侵种与本地种的生态位差异、适合度差异及系统发育距离对入侵成功和群落结构影响的验证,通过细菌微宇宙模型实验获取,包含群落数据与系统发育树两类文件,共2个文件。 文件详解 群落数据文件 文件名称:community data.xlsx 文件格式:XLSX...
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