-
raw_data_Based_生物学原始实验数据文件集
数据集概述 本数据集为生物学领域的原始实验数据文件集,包含三十个文件,覆盖FASTA、PDB、TXT、CSV、TSV、XLSX、R等七种格式,涉及信号强度测量、序列比对、结构分析、数据处理脚本等内容,无明确目录结构,可用于生物信息学相关分析。 文件详解 数据文件类 信号强度测量文件:如Fig. S9Dand...
-
Micrarchus_低温胁迫转录响应与遗传结构研究数据
数据集概述 本数据集围绕新西兰竹节虫属(Micrarchus)开展,包含高山与低地物种对低温胁迫的转录响应及种群遗传结构数据。通过RNA-Seq、qPCR技术分析低温诱导的差异表达基因,结合线粒体DNA、核糖体DNA及SNP数据探究种群遗传背景对基因表达的影响,揭示低温适应的分子机制与种群分化特征。 文件详解 转录组注释文件...
-
SNP_Based_欧洲野猫家猫及其杂交后代鉴定标记数据
数据集概述 本数据集包含用于鉴定欧洲野猫、家猫及其杂交后代的SNP标记相关数据。数据围绕物种保护中关键的基因渐渗检测问题,提供了开发的诊断标记集所需的序列、微卫星、形态学、线粒体DNA、Y染色体、模拟及基因分型等多类型文件,支持对自然种群渐渗率的评估与杂交过程研究。 文件详解 RefSamplesSequences.zip 文件格式:ZIP...
-
Petunia_Based红色花色素复杂演化机制研究数据
数据集概述 本数据集记录了矮牵牛(Petunia)红色花色素复杂演化机制的研究数据,包含蛋白质序列比对、系统发育树、基因注释、表型与基因型关联数据等40个文件,涉及花色素生物合成通路基因、MYB转录因子等关键分子的分析资料,用于揭示红色花色素从无色祖先演化的遗传机制。 文件详解 序列比对文件...
-
OGRDB_Source_小鼠IGKJ基因种系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠IGKJ基因种系参考数据集,包含所有品系的IGKJ基因种系序列及相关信息,由开放种系受体数据库(OGRDB)发布。数据集共含4个文件,涵盖基因序列、元数据及许可文件,用于免疫遗传学领域的基因参考研究。 文件详解 数据文件 文件名称:Mouse_IGKJ (all strains)_rev_1_gapped.fasta...
-
MinION_Based_动物源药材产地鉴定测序研究数据
数据集概述 本数据集为基于MinION便携测序仪的动物源药材产地鉴定研究数据,包含标准、非标及混合样品的细胞色素c氧化酶I基因测序结果,涉及不同测序模式(Fast/High-accuracy)及流细胞类型(R10.3/Flongle),可用于验证MinION在药材物种溯源中的应用效果。 文件详解 README.txt 文件格式:TXT...
-
Copepod_Based_桡足类光感受分子特征研究数据
数据集概述 本数据集围绕桡足类甲壳动物视觉的分子机制展开,通过12个分类多样的桡足类物种的RNA测序数据,识别光转导基因,分析视蛋白基因的进化特征,包括中波长敏感视蛋白、翼视蛋白等类型,以及部分物种的视蛋白表达差异。数据集包含5个相关文件,支持桡足类视觉分子层面的研究。 文件详解 文件名称:CopepodOpsinNewick.result...
-
结核分枝杆菌复合体基因组洞察_进化与抗生素耐药性数据解析
数据集概述 本数据集聚焦结核分枝杆菌复合群的全球进化与抗生素耐药性基因组研究,包含基因组序列、耐药相关数据及补充文件等13个文件,覆盖.xlsx、.tsv、.docx等7种格式,为结核分枝杆菌的进化分析与耐药机制研究提供多类型数据支持。 文件详解 数据文件(共9个)...
-
Anolis_Based_遗传形态与交配行为关联研究数据
数据集概述 本数据集围绕棕安乐蜥(Anolis sagrei)的交配行为展开,旨在评估遗传分化和形态特征对其交配的影响。研究通过分析234对圈养雌雄蜥蜴(涵盖6个岛屿种群的36种配对组合)的四小时视频,探究交配发生与种群遗传相关性、形态特征的关联。数据集包含4个文件,支持相关生物学研究。 文件详解 文件名称:README_dryad.docx...
-
M_phalerata_Based分子序列与注释完整数据
数据集概述 本数据集包含M. phalerata的蛋白质、CDS、基因、注释及重复序列等分子生物学数据,共七个文件。数据覆盖该物种的核心分子序列资源与功能注释信息,是开展其基因组学、转录组学及功能基因研究的基础数据支撑。 文件详解 文件名称:MM_xdfigixg.emapper.annotations.xlsx 文件格式:XLSX...
-
Oatk_Based植物细胞器基因组从头组装工具配套数据
数据集概述 本数据集包含195个植物细胞器基因组组装数据,涵盖24种单子叶植物、154种真双子叶植物、16种苔藓和1种苔类。数据由Sanger Institute的生命之树项目(主要来自达尔文生命之树项目)生成,用于支持论文“Oatk: a de novo assembly tool for complex plant organelle...
-
Nacobbus_aberrans_植物寄生线虫转录组数据
数据集概述 本数据集包含假根结线虫Nacobbus aberrans的转录组数据,涵盖其生命周期中不同寄生阶段的基因表达变化。通过RNAseq技术分析基因表达丰度,结合多基因系统发育分析、横向基因转移事件及效应因子的转录组范围分析,为研究该线虫寄生模式转换的生物学机制及植物寄生线虫 sedentary endoparasitism 进化提供遗传资源。...
-
基于地中海欧洲树木区系属级DNA序列数据的系统发育信号分析
数据集概述 本数据集包含地中海欧洲64个树木属的matK、rbcL、trnH-psbA三个基因的共识DNA序列,遵循Médail等人2019年的清单,用于构建属级时间校准系统发育树及评估脆弱性,支持相关植物学研究。 文件详解...
-
Dryad_Data_欧洲地松鼠多基因座系统地理学研究数据
数据集概述 本数据集基于欧洲地松鼠(EGS)的多基因座系统地理学研究,包含线粒体DNA序列(细胞色素b基因)和12个核微卫星标记的分析数据,覆盖其现有自然分布区的915个样本。数据揭示了该物种的进化与古地理历史,支持潘诺尼亚和东南巴尔干草原作为更新世间冰期大陆气候的隐秘避难所,反映其冰期扩张/间冰期收缩的动态模式。 文件详解 README文件...
-
果蝇实验性杂交育种_染色体倒位与X染色体不相容位点关联数据
数据集概述 本数据集为果蝇实验渐渗研究数据,围绕D. flavomontana与D. montana两个物种的种间基因流展开,通过回交实验结合基因组测序,分析染色体倒位和X染色体不相容位点对合子后生殖隔离的影响,识别限制或增加基因渐渗的染色体区域,共包含六个相关文件。 文件详解 README_file.txt 文件格式:TXT...
-
Priority_effects_微生物元群落跨代实验数据
数据集概述 本数据集源于关于花蜜微生物元群落优先效应的实验研究,聚焦于粘性猴花(Mimulus aurantiacus)花蜜中的细菌和酵母菌,通过实验操纵初始微生物优势类群,探究优先效应对多代花(作为局域栖息地)微生物群落共存的长期影响。数据集包含2个文件,记录了实验相关的序列和表格数据。 文件详解 文件名称:AppendixS4.fasta...
-
DMelSV_Based果蝇垂直传播病毒遗传与生态研究数据
数据集概述 本数据集围绕果蝇(Drosophila melanogaster)的垂直传播病毒DMelSV展开,通过病毒的遗传信息分析果蝇的种群迁徙与生态历史。病毒高突变率和低有效种群规模的特性,为解析果蝇迁徙模式、欧洲-非洲扩散路径及北美种群起源提供了精细尺度的遗传证据,助力理解这一模式生物的未知生态特征。 文件详解 NXS文件(系统发育分析结果)...
-
软体动物_5S_rDNA基因家族_转录调控区与进化分析数据
数据集概述 本数据集为软体动物5S rDNA基因家族研究的补充数据,涵盖双壳类、腹足类和头足类等物种的5S rDNA序列分析结果,重点研究贻贝科物种的转录调控区保守性、二级结构预测及长期进化模式,识别出不同类型的非转录间隔区及假基因拷贝,支持软体动物5S rDNA基因家族的进化机制研究。 文件详解 文件名称:README_for_Sequence...
-
Megabunus_Source_盲蛛SNP发现测序数据集
数据集概述 本数据集为Megabunus属盲蛛(Opiliones目)的简化基因组测序数据,通过下一代测序技术开发单核苷酸多态性(SNP)标记,是目前该属盲蛛可用的最大基因组资源,支持盲蛛遗传多样性与系统发育研究。 文件详解 文件名称:FASTA and ALN files...
-
Common_bean_PvIND基因座亚硫酸氢盐测序数据
数据集概述 本数据集包含普通菜豆PvIND基因座的亚硫酸氢盐测序数据,用于研究豆荚纤维沉积相关的表观遗传调控机制。数据源于对普通菜豆荚果发育过程中PvIND基因表达及DNA甲基化状态的分析,涉及转录组、解剖学、表观遗传学及遗传学等多维度研究,旨在揭示豆荚纤维沉积的可逆性表型调控机制。 文件详解 文件名称:README_file.txt 文件格式:TXT...



