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Fish_Tree_of_Life_Bony_Fishes_New_Classification_Data
数据集概述 本数据集围绕硬骨鱼类的生命之树与新分类系统展开，包含基于1416个终端分类群（1410种硬骨鱼类、4种四足动物及2种软骨鱼类外类群）构建的系统发育树、相关序列数据及分类表格，为硬骨鱼类的系统发育研究与分类提供核心支撑。 文件详解 文件名称：Concat_Three_Plus.nex 文件格式：.nex...
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Pteraspidiformes_Protaspididae_中泥盆世鳍甲鱼新分类单元与系统发育数据_2020
数据集概述 本数据集记录北美中西部中泥盆世地层中发现的鳍甲鱼（无颌类、异甲亚纲）新化石材料，包含3个新分类单元的描述及系统发育分析数据，填补了该类群早泥盆世后化石记录空白，支持其属于Protaspididae科衍生支系的结论。 文件详解 TNT分析脚本文件...
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豆科植物基于分类学综合系统发育的新亚科分类数据集
数据集概述 该数据集基于质体matK基因序列的综合系统发育分析，提出豆科植物新亚科分类方案，解决传统云实亚科非单系性问题，识别六个单系亚科。包含近完整属级取样（698属）及约20%物种（3696种）的序列数据，提供系统发育树及相关文件。 文件详解 系统发育树文件（.tre格式，共5个）：...
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梅花草属物种DNA条形码鉴定应用数据集
数据集概述 本数据集基于DNA条形码技术，对30种梅花草属（Parnassia）植物的105个样本进行分析，测试rbcL、matK、trnH-psbA和ITS四种DNA标记的物种鉴定效果，提供不同标记及组合的鉴定成功率数据。 文件详解 基因序列文件（.nex格式）: rbcL.nex: 包含rbcL基因序列数据 matK.nex:...
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园丁鸟造亭行为平行演化系统基因组学数据集
数据集概述 本数据集围绕园丁鸟造亭行为的演化机制展开，通过系统基因组学方法构建物种树，验证单配制猫鸟分支与多配制造亭物种的亲缘关系，探讨造亭行为是祖先性状丢失还是平行演化的结果，为理解这一独特行为的起源提供数据支持。 文件详解 归档文件（.tar格式）： alignments_exons.tar：包含5653个外显子位点的比对文件...
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南美巴塔哥尼亚蜥蜴系统地理学研究数据集
数据集概述 该数据集为南美巴塔哥尼亚地区线斑石龙子属（Liolaemus lineomaculatus group）蜥蜴的系统地理学研究数据，包含线粒体与核基因序列数据及系统发育树文件，用于分析其演化历史与地理分布格局，揭示巴塔哥尼亚地质气候事件对生物多样性的影响。 文件详解 基因序列文件（.nex格式）： 1- All...
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非洲真蟾蜍多样化与生活史进化数据集
数据集概述 本数据集围绕非洲真蟾蜍（Anura: Bufonidae）的谱系多样化速率与生活史特征进化展开，通过分子系统发育分析检验大陆尺度下生态机会（EO）模型的适用性，包含相关的系统发育树、序列比对及补充说明文件。 文件详解 该数据集包含12个文件，具体说明如下： - 系统发育树文件： -...
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酵母核糖体DNA序列异质性与系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集围绕核糖体DNA（rDNA）序列异质性展开，包含酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其近缘野生种（Saccharomyces paradoxus）的rDNA变异数据，用于评估rDNA位点特征对种内系统发育推断的影响，验证其作为进化信息来源的价值。 文件详解 系统发育树文件（.nex格式）：...
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南青冈属分子分歧时间校准影响测试数据集
数据集概述 本数据集围绕南青冈属（Nothofagus）分子分歧时间校准展开研究，测试了八种校准场景的影响，涉及38个化石类群的系统发育位置与地质年代学分析，以及基于叶绿体和核基因组序列数据的分子定年结果，为植物分子定年校准策略研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含四个独立文件，具体说明如下： -...
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树后验概率估计数据集_条件分支概率分布法
数据集概述 本数据集围绕树后验概率估计方法展开，基于条件分支概率分布原理，包含14个.nex格式的树结构数据文件和1个附录PDF文档，为验证该方法对高低概率树的准确性及未采样树概率计算提供数据支持。 文件详解...
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GHOST模型系统发育分析数据集
数据集概述 本数据集围绕GHOST模型展开，包含系统发育分析相关的序列比对、树文件、补充文档及基因序列文件，用于验证该模型在处理异速进化序列时的性能，支持系统发育推断研究。 文件详解 文件名称: Chiari_amnios248genes_nt.nex 文件格式: .nex 内容: 包含248个基因的核苷酸序列比对数据，用于系统发育分析。 文件名称:...
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南美安第斯山十字花科Stenodraba属分子系统发育与生态位分析数据集
数据集概述 本数据集围绕南美安第斯山十字花科植物Stenodraba属的分类地位展开，包含分子系统发育数据（核基因ITS、质体基因trnL-F和trnH-psbA）及生态位分析结果，验证其分类归属与进化关系，为该属恢复提供科学依据。 文件详解 分子系统发育文件： 序列数据文件：如ITS_EUDEMEAE.fas、trnL-...
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马达加斯加西北部侏儒壁虎分子系统学与新物种描述数据集
数据集概述 本数据集为论文《马达加斯加西北部神秘侏儒壁虎Lygodactylus ornatus的分子系统学及L. verticillatus群新物种描述》的配套数据，包含原始DNA比对及系统发育树文件，支持对该区域侏儒壁虎物种分类与进化关系的研究。 文件详解...
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Kewa属植物系统分类与系统发育数据集
数据集概述 本数据集聚焦于单型科Kewaceae中Kewa属的分类修订与系统发育研究，包含6个物种的形态特征、分类处理、地理分布及基于质体与核基因序列的系统发育分析结果，为该属植物的分类学与进化研究提供支撑。 文件详解...
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龟类与鳄类进化隔离及威胁的系统发育与空间分布数据集
数据集概述 该数据集围绕龟类与鳄类的进化隔离、威胁状态及系统发育特征展开，结合分子、形态学证据与机器学习算法，评估现存物种的多样化、威胁等级及进化独特性，预测未评估物种的威胁风险并识别高威胁区域。 文件详解 该数据集包含9个文件，具体说明如下： - 文档类文件： -...
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蜘蛛科林蛛科全证据系统发育分析补充文件包
数据集概述 本数据集为林蛛科（Linyphiidae）全证据系统发育分析的补充文件包，包含基因序列、表型矩阵、系统发育树等核心数据文件，支持Silva-Moreira等人相关研究的复现与扩展分析。 文件详解 该数据集包含69个文件，按类型分类说明如下： -...
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四足动物近缘种识别系统发育基因组数据集
数据集概述 本数据集为四足动物近缘种识别的系统发育基因组研究数据，包含用于解决早期肉鳍鱼类分化短深节点的多文件数据，涉及基因序列块、分析脚本及补充文档，支持脊椎动物系统发育学中四足动物近缘种的研究。 文件详解...
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多洛数据新型距离研究数据集
数据集概述 该数据集围绕多洛过程（Dollo process）下的二元（存在/缺失）数据距离展开研究，引入了新型的加性多洛距离（ADD），通过模拟数据对比多种二元距离的性能，并将ADD应用于桉树DArT数据集和细菌基因家族数据，提供相关案例分析结果。 文件详解 案例研究文件（.nex格式）：...
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鸟类系统发育基因组数据类型与分类单元采样影响研究数据集
数据集概述 本数据集围绕鸟类系统发育基因组学研究展开，聚焦新鸟亚纲早期分化节点的系统发育树冲突问题，通过构建含90%非编码序列的235种鸟类数据矩阵，对比分析数据类型、分类单元数量及位点数量对系统发育树拓扑结构的影响，揭示数据类型为导致树结构不一致的关键因素。 文件详解 压缩文件（.gz格式）：...
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现存小嘴贝目_腕足动物门_形态与分子数据联合分析数据集
数据集概述 本数据集围绕现存小嘴贝目腕足动物的形态与分子数据联合分析展开，包含形态特征矩阵、核糖体DNA序列及系列系统发育分析结果，用于探究形态与分子数据的系统发育信号冲突，评估形态系统学在该类群中的适用性。 文件详解 文档类文件（.docx格式，共5个）：...
